同源重组 (HR) 的基本反应涉及两个染色单体,其中包含共享重要身份的 DNA 序列。其中一个序列使用另一个序列的链作为模板,在酶催化反应中合成 DNA。最终产品是两种底物的新型融合。为了确保序列的准确重组,HR 仅限于细胞周期的 S 和 G2 期。在这些阶段,DNA 已经被复制,并且在姐妹染色单体上出现相同或相似 DNA 序列的可能性很高。因此,修复的时间可以防止不同序列之间的重组。这是 HR 的一个关键特征,尤其是在后代亲本 DNA 序列重组期间,错误的 HR 会导致整个基因和周围染色体区域的丢失。