7.8: 同源重组

Homologous Recombination
JoVE Core
Molecular Biology
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Homologous Recombination
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November 23, 2020

Overview

同源重组 (HR) 的基本反应涉及两个染色单体,其中包含共享重要身份的 DNA 序列。其中一个序列使用另一个序列的链作为模板,在酶催化反应中合成 DNA。最终产品是两种底物的新型融合。为了确保序列的准确重组,HR 仅限于细胞周期的 S 和 G2 期。在这些阶段,DNA 已经被复制,并且在姐妹染色单体上出现相同或相似 DNA 序列的可能性很高。因此,修复的时间可以防止不同序列之间的重组。这是 HR 的一个关键特征,尤其是在后代亲本 DNA 序列重组期间,错误的 HR 会导致整个基因和周围染色体区域的丢失。

HR 确保的精确修复已应用于基因编辑技术。HR 是最早用于编辑活细胞基因组的方法。CRISPR-Cas9 系统用于创建靶向双链断裂,以纠正基因组中致病突变。分离的片段被细胞吸收,在那里它们可以与细胞 DNA 重组并替换基因组的目标区域。HR 机制控制断裂的修复及其与细胞基因组的准确重组。为了帮助 HR 蛋白在双链断裂处精确定位,Cas9 蛋白与 HR 效应蛋白融合,后者可以在受损位点募集修复蛋白。研究表明,将 Cas9 与 CtIP、Rad52 和 Mre11 等蛋白质融合可以使细胞中的 HR 事件增加两倍,同时阻止非同源末端连接。HR 在基因组编辑中的这种应用可以彻底改变基因治疗,并为目前被认为无法治愈的遗传疾病提供治疗。

Transcript

DNA 复制的一个基本要求是保持遗传物质的完整性。因此,双链断裂优先通过同源重组进行修复,通常在 DNA 合成后两个子 DNA 分子靠近时进行,一个可以作为修复另一个的模板。

在真核生物中,一种称为 MRN 的蛋白质复合物由专门的核酸酶组成,可降解 DNA 受损的末端,而末端彼此相连。DNA 留下 3-4 个核苷酸的单链突出端,带有 3′ OH 末端。该单链部分被 RPA 蛋白稳定,直到 Rad51(原核蛋白 RecA 的同源物)被 ATP 激活,并与 DNA 结合形成细丝。

在细丝中,DNA 以核苷酸三联体的形式存在,其中 DNA 骨架在相邻的三联体之间解开。这种 DNA-蛋白丝通过拉伸完整的模板 DNA 并使其不稳定,与来自姐妹染色单体的双链 DNA 结合,因此两条链可以很容易地拉开,断裂的链可以尝试与模板结合,这个过程称为链侵袭。

侵袭链通过尝试在三个核苷酸的块中形成碱基对,在基因组 DNA 中寻找未受损的同源序列。如果碱基对不匹配,侵袭的 DNA 就会解离并寻找其他同源区域。如果来自侵入链的一个三联体与模板匹配,则对接下来的三个核苷酸进行采样。

如果序列匹配至少五个三联体,则形成置换环结构,DNA 聚合酶使用侵袭链作为模板。

在此之后,解旋酶取代现在延伸的侵入链,该链与未包被的受损链进行碱基对。接下来,第二条受损链与模板 DNA 的互补链退火,进行另一轮 DNA 合成。最后,姐妹链解离,DNA 连接酶密封缺口,恢复修复的螺旋,并确保准确修复完整染色体。

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