蛋白质向线粒体的转运

携带靶向基质前序列的肽段通过TOM/TIM复合物进行转运。当肽段从TIM通道输出时，线粒体Hsp70会结合该肽段，并将其转运至基质中，随后前序列被基质蛋白酶切除。

靶向线粒体膜间隙的蛋白质具有一段额外的疏水信号序列，可阻止其通过TIM复合物的转位。信号肽酶会切割该疏水片段，并将活性蛋白质释放到膜间隙中。

或者，线粒体膜间隙组装蛋白40（Mia40蛋白）可导入缺乏前序列的膜间隙蛋白。

氧化态的Mia40与进入的多肽链上的巯基形成瞬时二硫键，并将新生肽链拉过TOM通道。一旦整个肽链完全穿过，Mia40即被还原。

一些具有终止转移序列的内膜蛋白会被滞留并插入膜中。另一些蛋白则首先被信号肽酶加工，然后被OXA 转运酶识别，由该转运酶将其嵌入膜内。