背景和环境影响表型

生物体的表型可能受到除基因型之外的多种因素影响，包括遗传背景和环境。有时，这些效应会同时发生。

"遗传背景"代表基因组中可能与目的基因相互作用的所有相关基因。

另一方面，环境包含生物体可能遇到的许多外部因素，包括温度、饮食和光照条件。

多个相关基因的突变都可能影响生物体的表型。例如，野生型黑腹果蝇（Drosophila）的砖红色眼睛是由于存在两种色素——眼色素（ommochrome）和果蝇蝶呤（drosopterin）——这两种色素由三个基因调控。

vermilion 基因是产生棕色眼色素（ommochrome pigment）通路中的第一步。

棕色基因编码一种膜转运蛋白，该蛋白是红色色素——果蝇蝶呤合成所必需的。

white 基因负责将这些色素转运至眼睛。

vermillion 基因的突变会产生具有鲜红色眼睛的果蝇，而 brown 基因的突变则会产生具有棕色眼睛的果蝇。

然而，即使另外两个基因功能正常，白眼基因的突变也会导致果蝇出现白眼。

 温度是众多环境因素之一，在决定欧洲池塘龟发育过程中的性别时起着至关重要的作用。

当卵在25˚C下孵化时，性腺组织发育为睾丸，所有后代均为雄性；然而，当卵在30˚C下孵化时，性腺组织则发育为卵巢，所有后代均为雌性。

性腺组织对温度敏感的这一时期称为温度敏感期。

由于Sox9基因的表达随温度变化而改变，性腺组织发生了改变。

在较低温度下，该基因表达水平较高，而在较高温度下，表达受到抑制。这种可变的表达水平导致表型发生可观测的变化——子代性别。