13.4: Synteny 和进化

Synteny and Evolution
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Synteny and Evolution
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April 07, 2021

John H. Renwick 于 1971 年首次创造了”synteny”一词,它指的是存在于同一染色体上的基因,即使它们没有遗传联系。具有共同祖先的物种往往表现出保守的同线区域。因此,synteny 的概念现在被用来描述物种之间的进化关系。

大约 8000 万年前,人类和小鼠的谱系与共同的祖先分化。在进化过程中,祖先染色体经历了几次重排、断裂和融合事件,进化成小鼠和人类的染色体。例如,祖先染色体进化成人类和小鼠染色体需要大约 180 次染色体断裂和重新连接事件。然而,小鼠和人类染色体的几个区域都保持了共同的基因顺序或同线。例如,超过 510,000 个碱基对的小鼠 12 号染色体与人类 14 号染色体共享同线阻断。未来,当两个物种之间的进化距离增加时,染色体断裂和再连接事件的数量会增加,synteny 会减少。

灵长类动物祖先核型

基于同线关系和 DNA 序列分析,科学家们预测了所有灵长类动物祖先的核型。人类与其他灵长类动物(如黑猩猩、大猩猩和其他现存灵长类动物物种)之间的同步表明,人类染色体是通过几个染色体断裂和重新连接事件从祖先染色体衍生而来的。这种大规模的染色体重排很少见,就像 500 万年一次一样。但无论何时发生,它们都最有可能导致新物种的进化。人类染色体与拟议的灵长类祖先核型之间的比较显示了几种染色体重排。例如,祖先 9 号和 11 号染色体的融合形成了人类 2 号染色体;或者祖先 14 号和 21 号染色体的相互易位导致人类 12 号和 22 号染色体的进化。

Transcript

在古典术语中,Synteny 是指存在于同一条染色体上的基因,就像同一根绳子上的珠子一样。

例如,考虑物种 X,它的一条染色体上存在基因 A、B 和 C。据说这些基因在物种 X 中是同线的。

然后考虑另一个物种 Y,在另一条染色体上具有等位基因 A1、B1 和 C1。据说这些基因在物种 Y 中也是同线的。

从进化的角度来看,synteny 是指两个或多个不同物种的染色体上基因共定位的现象。

因此,基因 A 和 A1、B 和 B1 以及 C 和 C1 代表 X 和 Y 两个物种之间的同线。

此外,存在于两个或多个物种的共同染色体区域中的基因,如基因 A、B 和 C,代表保守的连线片段或保守的连线块。

在进化过程中,物种经历随机突变,在自然选择中幸存下来并进化成几个谱系,同时大部分在许多染色体上保持保守的同线块。

例如,大约 8500 万年前,人类和树鼩共享一个共同的哺乳动物祖先。即使经过数百万年的分化,人类 10 号染色体长臂和树鼩的 16 号染色体上的几个基因在某些区域仍显示出保守的同线。

这表明一条祖先的哺乳动物染色体在树鼩中进化成 16 号染色体,在人类中进化成 10 号染色体的长臂。

根据来自所有已知现代灵长类动物的同线分析和高分辨率 DNA 数据,科学家们提出了所有这些物种的共同祖先的核型。

人类和祖先染色体中显示的匹配颜色表明人类染色体进化而来的保守同线块和祖先染色体。

这些祖先染色体会经历几轮染色体重排、融合或断裂,从而促进多样性和物种形成,成为今天的灵长类动物。