13.6: 基因复制和分化

Gene Duplication and Divergence
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Molecular Biology
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Gene Duplication and Divergence
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02:37 min
April 07, 2021

Overview

Ohno 在 1970 年的开创性工作普及了基因复制和分化的思想。DNA 序列比较研究表明,细菌、古细菌和真核生物中的大部分基因是由基因复制和分化产生的,表明它在进化中的关键作用。

该基因的复制拷贝称为旁系同源物。具有相似序列和功能的旁系同源物形成一个基因家族。在几个物种中,有大量的基因家族被表征。例如,黑腹果蝇中的胰蛋白酶基因家族有超过 111 个成员;哺乳动物中的嗅觉受体基因家族有大约 1000 个成员基因。

重复基因的产生

基因复制可能是由于以下四个原因而出现的。首先,减数分裂过程中的不相等交叉会导致包含基因的一部分或多个基因的重复 DNA 片段。

第二个是复制滑点。在极少数情况下,在 DNA 复制过程中,聚合酶可以从 DNA 上解离并在错误的位置重新对齐,并再次复制已经复制的序列。这个过程可以在数百个碱基上产生 DNA 的重复拷贝。

第三个是逆调。在这里,细胞 mRNA 可能会被逆转录成称为逆转录基因的 DNA 拷贝。然后,这些逆转录基因可以将自己插入到基因组中,从而导致基因复制。由于插入的拷贝缺乏启动子和其他转录调节元件,因此这些拷贝中的大多数会失去其功能并成为假基因。

除了基因重复外,还会发生大规模的染色体重复或全基因组重复。一些染色体在减数分裂过程中可能无法分离成子细胞,导致单倍体细胞染色体数量异常。例如,唐氏综合征患者有一份额外的 21 号染色体副本。在小麦等植物中,整个基因组被复制六次以上,形成一个六倍体。

Transcript

基因复制是编码基因的 DNA 区域复制的过程,在同一基因组中产生额外的自身副本。这些基因的复制拷贝 – 称为旁系同源物,以后可以通过以下方式之一发生突变和分化。

首先是假基因的形成。在这里,其中一个基因旁系同源物可能会获得有害突变并变成称为假基因的非功能性拷贝。

第二种是亚功能化,其中两个旁系同源物都在不同的蛋白质编码域或外显子中获得突变,从而在它们之间分配原始基因功能。然而,两个旁系同源基因的蛋白产物相辅相成,表现出原始基因的功能。

例如,在原始鱼类和海洋动物中,单链珠蛋白充当血液中的携氧分子。

在进化过程中,珠蛋白基因复制并亚功能化为两个略有不同的基因,编码 α 和 β 珠蛋白,它们结合形成血红蛋白分子,与当今大多数脊椎动物中发现的 4 个亚基结合。

第三个是新功能化。在这里,一个旁系同源物获得新颖的、有利的突变,这些突变可以导致新基因的进化。相比之下,另一个 paralog 保留了原始功能。

例如,人类 β-珠蛋白基因复制并获得突变,产生一种称为胎儿 β-珠蛋白的新基因,该基因仅在人类胎儿中表达。然而,出生后不久,β-珠蛋白基因接管了 β-珠蛋白的产生。

人类三色视觉的进化是新功能化的另一个有趣例子。早在现代猿类进化之前,由于蓝色和绿色视蛋白基因的存在,早期的灵长类动物具有双色视觉。

后来,绿色视蛋白基因复制并新功能化为一种新的红色视蛋白基因。

因此,在复制事件后进化的物种,例如旧世界的猴子、猿类和人类,具有三个赋予三色视觉的视蛋白基因。

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