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Molecular Biology
Chapter 16: Analyzing Gene Expression and Function
16.5:
单核苷酸多态性-SNP
单核苷酸多态性或 SNP 是大型群体中特定基因组位置的单核苷酸变异。它是人类基因组中发现的最普遍的序列变异类型。发生在超过 1% 的人群中的点突变符合 SNP 的条件。这些在人类基因组中平均每 1000 个核苷酸存在一次。用另一种嘌呤 (A/G) 取代嘌呤或用另一种嘧啶 (C/T) 取代嘧啶称为过渡。相反,嘌呤与嘧啶(A 或 G/C 或 T)的取代或反之亦然称为转位。在 SNP 中,转换比反向更突出。
使用不同的方法来研究基因组中存在的遗传变异,也称为基因分型。与 SNP 不同,单串联重复序列 (STR) 涉及二核苷酸、三核苷酸或四核苷酸重复序列。科学家们经常使用 SNP 基因分型而不是 STR,因为 SNP 更丰富和稳定,并且一些 SNP 直接影响表型。
大多数时候,SNP 存在于内含子中,内含子不编码任何蛋白质。这种 SNP 可用作定位与特定疾病相关的基因的生物标志物。如果 SNP 存在于基因内或基因附近的调节序列中,则可能会影响其功能并导致疾病。
当比较多个人类基因组时,在序列中观察到了变化。
由于一个核苷酸取代引起的变异称为单核苷酸多态性或 SNP。
由于插入或缺失长度小于 1 kb 的核苷酸序列而导致的变化称为插入缺失。
如果核苷酸的插入或缺失在同一基因组中被复制了可变次数,则称为拷贝数变异或 CNV。通常,CNV 涉及长度大于 1 kb 的大段 DNA。
单倍型是从单个父母那里继承的一组基因。一个基因组可以分为包含多态性簇的单倍型块。
由于在每次减数分裂期间同源染色体之间很少发生交叉,因此单倍型块在跨代的连锁组中遗传。
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