共翻译蛋白易位

大多数蛋白质在合成过程中即进入内质网腔，这一过程称为共翻译转运。

首先，携带核糖体-新生肽链复合物的信号识别颗粒（SRP）-SRP受体复合物将该复合物卸载到Sec61通道上。

当核糖体与通道对齐后，多肽链N端的信号序列会结合到信号序列识别位点上。

随着翻译的继续，  多肽链形成一个环状结构，推动打开通道堵塞物，进入内质网腔。

当多肽链进入腔内时，信号序列通过Sec61通道的侧向门孔进入相邻的信号肽酶复合物，并在此被切除。

当蛋白质被动进入内质网腔时，通道插头保持打开状态。

蛋白质完全转位至腔内后，通道阻断蛋白会反弹以阻止其返回胞质溶胶。

在内质网腔内，定位于内质网的分子伴侣（如 BiP）会立即结合已转位的蛋白质，并协助其进行蛋白质折叠。