16.19: 全基因组关联研究-GWAS

Genome-wide Association Studies-GWAS
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Molecular Biology
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Genome-wide Association Studies-GWAS
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April 30, 2023

全基因组关联研究 (GWAS) 用于确定常见的 SNP 是否与某些疾病相关。假设在患有特定疾病的个体中比没有疾病的个体更频繁地观察到特定的 SNP。在这种情况下,这些 SNP 被称为与疾病有关。进行卡方分析以检查等位基因可能与疾病相关的概率。

GWAS 不需要鉴定与疾病表型相关的靶基因。它识别与疾病相关的 SNP,并帮助识别处于风险中的个体。这种方法简化了靶基因鉴定,在许多情况下,靶基因鉴定既耗时又不准确。GWAS 用于鉴定与心肌梗死风险增加相关的 SNP。GWAS 还确定了与 2 型糖尿病、帕金森病、其他心脏病、肥胖、克罗恩病和前列腺癌相关的 SNP。

Transcript

有时,单倍型块内的 SNP 可以帮助找到导致某些疾病(如血友病)的基因。为了追踪这些基因,研究人员可以进行群体研究。

例如,进行全基因组关联研究 (GWAS) 是为了将特定的遗传变异与疾病联系起来。

在这种方法中,研究人员使用两个大型研究组:患有相关疾病的人和类似的无疾病人群。

扫描基因组以查找 SNP 之前,对来自每个研究参与者的 DNA 样本进行分离和测序。

如果与健康个体相比,某些 SNP 在患有该疾病的个体中出现的频率更高,那么这些 SNP 被称为与该疾病有关。

虽然这些 SNP 可能导致这种情况,但它们更有可能是可能包含因果变异的单倍型块的一部分。