使用串联质谱法进行肽鉴定

与MALDI-TOF或串联质谱（MS/MS）不同, 采用两个串联的质谱分析器，中间由碰撞池隔开。该技术可从复杂的混合物中鉴定肽段的氨基酸序列，用于深入分析。

首先，电喷雾离子源产生肽离子，并将其加速至第一级质谱分析器（如四极杆）。该分析器起到质量过滤器的作用，可选择具有特定质荷比的单一肽离子，即前体离子。

进入碰撞池后，所选肽离子与气体分子发生碰撞，主要断裂肽键，产生更小的离子。

这些离子进入第二级质谱分析器，该分析器类似于飞行时间分析器，根据离子的质荷比对其进行分离。

所获得的产物离子谱有助于鉴定肽段的氨基酸序列。

将串联质谱（MS/MS）与液相色谱联用有助于从复杂的生物样品中持续分析肽段。

MS/MS 还可以表征脂质，鉴定翻译后蛋白质修饰，并在生物样本中检测低水平的疾病特异性生物标志物。