7.4
现代分子分类学采用多相分类法。本课程重点介绍几种用于细菌鉴定与分类的联合方法。
保守基因序列分析利用高度保守的基因序列(如 recA 和 gyrB)来区分亲缘关系较近的细菌种类。
在多位点序列分型(MLST)中,对来自多种相关物种或菌株的若干看家基因的约450个碱基对的片段进行测序和分析。
MLST 可以区分亲缘关系密切的菌株,例如 E. coli K-12 和 O157:H7。该方法在检测单个核苷酸差异方面具有高效性。
基因组指纹图谱通过基因或全基因组的DNA片段,评估同一物种不同菌株之间的多态性。
核糖体分型是一种基因组指纹分析方法,通过分析核糖体RNA基因的模式,可快速鉴定物种和菌株,并有助于对食品、水和饮料中的微生物进行分析。
近年来,DNA测序技术的进步使得利用多个基因乃至整个基因组进行准确的细菌鉴定和分类学研究成为可能。
分子生物学的进步彻底革新了细菌的鉴定与表征,多个方法依托DNA测序技术,实现了更高的精确度。随着测序技术的不断提升和成本的下降,这些方法在临床、环境及进化研究中得到广泛应用。
多位点序列分型(MLST)通过检测数个管家基因——编码细胞基本功能的重要染色体基因——来区分菌株。通常测序约450个碱基对的…