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方法文章

光斑检测法:一种用于研究的实验方法 果蝇 趋光行为

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2023年4月30日

本文内容

摘要

来源:Sun, Y., 等 基于光斑的检测方法用于分析 黑腹果蝇 幼虫趋光性. J. Vis. Exp. (2019).

Drosophila 幼虫对光敏感,会对周围光照的变化产生反应。本视频介绍了一种检测其避光能力的实验方法,称为光斑实验。该方案展示了如何使用蓝色LED光源建立实验装置,并演示了如何记录动物在接触光线时的行为反应。

方案

本实验方案文本节选自 Sun 基于光斑的分析检测方法 黑腹果蝇 幼虫趋光性 视频实验杂志 (2019).

1. 成像系统的设置

  1. 使用铁夹将一个高分辨率网络摄像头夹住,固定在桌面光斑上方约 10 cm 处(图 1)。
  2. 调整摄像头镜头方向,使其对准桌面。通过 USB 接口将摄像头连接至计算机。
  3. 将一个琼脂平板放置在摄像头正下方的桌面上。
  4. 在运行 Windows 7 系统的计算机上打开 "Amcap9.22" 软件,AMcap 窗口中将自动显示光斑图像。轻微左右移动摄像头,确保光斑位于窗口中央附近。确保摄像头不会遮挡光路,光斑应完整且呈圆形。
    注意: 该软件可在 http://amcap.en.softonic.com/ 获取。
  5. 使用夹子将一个 850 nm ± 3 nm 带通滤光片固定在摄像头正下方 5–7 mm 处。
    注意: 滤光片直径约为 2.5 cm,而摄像头镜头直径小于 1 cm,因此滤光片可完全覆盖摄像头的视野。安装滤光片后,AMcap 窗口中不应再看到光斑。
  6. 将三个红外发光 LED(中心波长 = 850 nm)均匀布置在琼脂平板周围。每个 LED 距琼脂平板边缘约 5 cm,LED 镜头面应向下倾斜 70° 对准琼脂平板。通过交流转直流电源适配器为 LED 供电。
    注意: 建议固定红外 LED 的位置和角度,以确保多次实验中光照场亮度的一致性,并便于后续视频处理。
  7. 在计算机与装置之间放置一块黑板,并调低计算机屏幕亮度,防止屏幕光线干扰实验。
    注意: 在测量光的波长或强度时,应保持环境黑暗。

2. 设置成像参数

  1. 在 AMcap 软件菜单中,选择 选项 | 视频设备 | 捕获格式,并将所捕获视频的像素尺寸设置为 800 x 600,帧率为 60 fps。
  2. 取下摄像头下方的滤光片,在摄像头下方放置一把刻度尺,调节摄像头焦距,使刻度线清晰且与视频视野的宽度方向平行。
  3. 点击 捕获 | 设置 | 视频捕获 以选择保存路径,点击 开始录制,记录对应 600 像素的实际距离,并计算每个像素对应的实际距离比例。

3. 光回避行为的视频记录

  1. 所有实验过程中保持温度为 25.5 °C。如有需要,使用空调控制室温。使用加湿器将湿度恒定维持在 60%。
  2. 拍摄一段名为 "lightarea1" 的光斑位置短视频。然后,将 850 nm ± 3 nm 滤光片移回以遮盖相机镜头。
    注意:记录幼虫行为时,相机镜头被 850 nm ± 3 nm 滤光片覆盖,以确保光斑不会出现在视频中。后续可通过 Matlab 在包含幼虫的视频中重建光斑位置。请勿移动相机位置,并避免更改第 2.3 步中测得的每个像素与实际距离之间的比例。
  3. 打开远离实验装置的光源(例如房间照明灯),并将灯光调至尽可能低的亮度,以确保肉眼仍能清晰观察到幼虫。用勺子将幼虫从培养基中取出,轻柔地挑选一只三龄幼虫,并用蒸馏水将其清洗干净。注意每次只清洗一只幼虫,以避免饥饿状态对实验造成干扰。单次实验至少需要 20 只幼虫。
  4. 将幼虫转移至第 1.3 步中放置于相机正下方的琼脂平板中心。使用毛笔轻轻去除幼虫表面多余的水分,或用吸水纸吸干水分,以防止镜头下产生光线反射。关闭房间照明灯,让幼虫在黑暗环境中适应 2 分钟。
  5. 打开 LED 光源以产生红外光,并用毛笔轻柔地将幼虫引导至平板中心。当幼虫开始直线爬行时,旋转平板使其头部朝向光斑方向。确保其从起点即沿直线爬行,否则可能无法成功接近光斑。
  6. 点击 采集 | 设置 | 视频采集 以选择保存路径,然后点击 开始录制 进行记录。让幼虫向光斑爬行,进入光斑区域,随后离开光斑直至几乎移出视野范围,再点击 停止录制。若幼虫在接近光斑前即转向远离,则直接点击 停止录制
  7. 将滤光片从相机前移开。拍摄一段名为 "lightarea2" 的光斑位置短视频,并与 "lightarea1" 进行比对,以确认光斑位置未发生改变。若发现明显的位置偏移,则应舍弃该组数据。

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结果

蓝光和红外光下幼虫行为实验装置的示意图与照片。
图1:实验装置。A)基于光斑的幼虫快速趋光性实验装置的示意图。蓝线表示用于视觉刺激的可见光光路,红线表示红外光光路。箭头指示光的传播方向。850 nm带通滤光片允许红外光通过,但阻隔可见光。(B)光斑实验装置的实际图像。需注意的是,该图像在有利于可视化的光照条件下拍摄。请点击此处查看该图的放大版本。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
850 nm &plusmn; 3 nm 红外光发射 LEDThorlabs, USAPM100A兼容传感器:光电二极管和热电型传感器<br/> 光学功率范围a:100 pW 至 200 W<br/> 可用传感器波长范围a:185 nm - 25 &mu;m 显示刷新率:20 Hz<br/> 带宽:DC - 100 kHz<br/> 光电二极管传感器范围b:50 nA - 5 mA<br/> 热电堆传感器范围b:1 mV - 1 V
交流转直流转换器Thorlabs, USAS120VC孔径尺寸:&Oslash;9.5 mm<br/> 波长范围:200 - 1100 nm<br/> 功率范围:50 nW - 50 mW<br/> 探测器类型:硅光电二极管(紫外扩展型)<br/> 线性度:&plusmn;0.5%<br/> 测量不确定度c:&plusmn;3%(440 - 980 nm),&plusmn;5%(280 - 439 nm),&plusmn;7%(200 - 279 nm,981 - 1100 nm)
带通滤光片Thorlabs, USADC2100LED 电流范围:0 - 2 A<br/> LED 电流分辨率:1 mA<br/> LED 电流准确度:&plusmn;20 mA<br/> LED 正向电压:24 V<br/> 调制频率范围:0 - 100 kHz 正弦波<br/> 调制方式:任意
准直蓝光 LEDELP, 中国USBFHD01M最大分辨率:1920×1080<br/> F6.0 mm<br/> 传感器:1/2.7" CMOS OV2710
紧凑型功率计主机Ocean Optics, USAUSB2000+(RAD)尺寸:89.1 mm × 63.3 mm × 34.4 mm<br/> 重量:190 g<br/> 探测器:Sony ILX511B(2048 元素线性硅 CCD 阵列)<br/> 波长范围:200 - 850 nm<br/> 积分时间:1 ms &ndash; 65 秒(典型值为 20 秒)<br/> 动态范围:8.5 × 10^7(系统);单次采集为 1300:1<br/> 信噪比:250:1(满信号)<br/> 暗噪声:50 RMS 计数<br/> 光栅:2(250 &ndash; 800 nm)<br/> 狭缝:SLIT-50<br/> 探测器收集透镜:L2<br/> 消杂级滤光片:OFLV-200-850<br/> 光学分辨率:约 2.0 nm FWHM<br/> 杂散光:&lt;0.05%(600 nm 处);&lt;0.10%(435 nm 处)<br/> 光纤连接器:SMA 905 转 0.22 数值孔径单股光纤
高功率 LED 驱动器Minhongshi, 中国MHS-48XY工作电压:DC12V<br/> 中心波长:850 nm
高分辨率网络摄像头Thorlabs, USAMWWHL4颜色:暖白<br/> 相关色温:3000 K<br/> 典型 LED 功率测试电流:1000 mA<br/> 最大电流(连续):1000 mA<br/> 带宽(FWHM):不适用<br/> 电功率:3000 mW<br/> 视角(全角):120&deg;<br/> 发光体尺寸:1 mm × 1 mm<br/> 典型寿命:>50 000 小时<br/> 工作温度(非冷凝):0 至 40 &deg;C<br/> 存储温度:-40 至 70 &deg;C<br/> 风险等级a:RG1 &ndash; 低风险等级
暖白 LEDMega-9, 中国BP850/22K&Oslash;25.4(+0 ~ -0.1) mm<br/> 带宽:22&plusmn;3 nm<br/> 峰值透射率:80%<br/> 中心波长:850 nm&plusmn;3 nm
光谱仪Noel DanjouAmcap9.22AMCap 是一款具备高级预览和录制功能的静态图像与视频采集应用程序。<br/>该软件为桌面应用程序,适用于运行 Windows 7 SP1 或更高版本操作系统的计算机。<br/>支持大多数 Video-for-Windows 和 DirectShow 兼容设备,无论是廉价的网络摄像头还是高级视频采集卡。
标准光电二极管功率传感器Super Dragon, 中国YGY-122000输入:AC 100 - 240 V ~ 50/60 Hz 0.8 A<br/> 输出:DC 12 V 2 A
热功率传感器Thorlabs, USAM470L3-C1颜色:蓝色<br/> 标称波长a:470 nm<br/> 带宽(FWHM):25 nm<br/> 最大电流(连续):1000 mA<br/> 正向电压:3.2 V<br/> 电功率(最大):3200 mW<br/> 发光体尺寸:1 mm × 1 mm<br/> 典型寿命:100 000 小时<br/> 工作温度(非冷凝):0 至 40 &deg;C<br/> 存储温度:-40 至 70 &deg;C<br/> 风险等级b:RG2 &ndash; 中等风险等级
热功率传感器Thorlabs, USAS401C波长范围:190 nm - 20 &mu;m<br/> 光功率范围:10 &mu;W - 1 W(3 Wb)<br/> 输入孔径尺寸:&Oslash;10 mm<br/> 有效探测器面积:10 mm × 10 mm<br/> 最大光功率密度:500 W/cm²(平均)<br/> 线性度:&plusmn;0.5%

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果蝇幼虫蓝光LED红外LED琼脂平板三龄幼虫避光行为视频记录遗传品系