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方法文章

FITC-葡聚糖饲喂法:一种定量检测肠道通透性的方法 秀丽隐杆线虫

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2023年4月30日

本文内容

摘要

来源:Le, T. A. N., . 测量细菌和化学物质对肠道通透性的影响 秀丽隐杆线虫. J. Vis. Exp. (2019).

本视频介绍了一种通过喂食荧光素异硫氰酸(FITC)标记的葡聚糖来可视化并检测C. elegans肠道管腔完整性的方法。示例实验方案展示了使用3,3’-二吲哚基甲烷(DIM)处理并喂食病原菌的线虫进行该检测的过程。

方案

本实验方案节选自 Le et al,《测量细菌和化学物质对秀丽隐杆线虫肠道通透性的影响》,Caenorhabditis elegans, J. Vis. Exp. (2019)。

  1. 用于检测化学物质(DIM)对线虫肠道通透性影响的NGM平板的制备 秀丽隐杆线虫 喂食 P. aeruginosa
    1. 向500 mL玻璃瓶中加入0.5 g蛋白胨、0.6 g NaCl、195 mL蒸馏水、一个磁力搅拌子和6.8 g琼脂(NGM琼脂)。
    2. 向另一个500 mL玻璃瓶中加入0.5 g蛋白胨、0.6 g NaCl、195 mL蒸馏水和一个磁力搅拌子(不含琼脂),配制NGM液体培养基。
    3. 将两个瓶子(步骤1.1–1.2)、一个空的100 mL玻璃瓶和一个空的500 mL玻璃瓶在121 °C下高压灭菌15分钟。然后,将装有培养基的瓶子放入水浴中冷却至55 °C,持续30分钟。将琼脂培养基保留在水浴中,并取出装有液体培养基的瓶子(来自步骤1.2)用于下一步操作。
    4. 向NGM培养基中加入添加剂:0.4 mL 1 M CaCl₂2,0.4 mL 乙醇中的胆固醇(mL),0.4 mL 1 M MgSO₄4 和10 mL 1 M KPO4 (除乙醇中的胆固醇外,所有组分均需灭菌)。然后,在 55 °C 下使用磁力搅拌器将混合物充分搅拌。
    5. 用二甲基亚砜(DMSO)标记已灭菌的500 mL空玻璃瓶,用DIM标记已灭菌的100 mL空玻璃瓶。
    6. 将50 mL NGM肉汤转移至标有DIM的100 mL瓶中。向瓶中加入500 µL 20 mM DIM储备液,充分混匀。
      注意: DIM 溶于 DMSO 中(20 mM DIM 储存液)。
    7. 迅速将NGM琼脂培养基从水浴中取出,倒入50 mL至标有DIM的瓶子中,并充分混匀。
    8. 将含有DIM的NGM培养基各20 mL分装至每个90 mm × 15 mm的培养皿中。此步骤可制备约五个含DIM的NGM平板。
      注意: 每个NGM平板中DIM的终浓度为100 µM。
    9. 准备含DMSO的NGM平板时,将150 mL NGM肉汤转移至标有DMSO的500 mL瓶中,加入1.5 mL DMSO,充分混匀。
    10. 向标记为DMSO的瓶子中加入150 mL NGM琼脂培养基,并充分混匀。
    11. 在每个90 mm × 15 mm的培养皿中加入20 mL含DMSO的NGM培养基。此步骤可制备约十五块含DMSO的NGM平板。
      注意: 每个NGM平板中DMSO的最终浓度为0.5%。
    12. 在室温下凝固平板至少3小时,随后于4 °C保存直至使用。
      注意: 此处可以暂停实验方案。
    13. 移除 E. coli OP50 或 P. aeruginosa 从4 °C冰箱中取出PAO1菌液,充分涡旋混匀后涂布于NGM平板上。
    14. 加入800 µL的 E. coli OP50 或 P. aeruginosa 将PAO1菌液接种至每块新鲜的NGM琼脂平板上,置于20 °C培养箱中过夜干燥。
      注意: 此处可暂停该实验方案。对于第三个实验(图1),两个含有DMSO并涂有活菌的NGM平板 E. coli OP50,一皿含DMSO的NGM平板,涂布活菌 P. aeruginosa PAO1,以及一个含有DIM的NGM平板,涂布有活菌 P. aeruginosa PAO1 菌株已制备。
  2. 细菌或DIM处理与FITC-葡聚糖饲喂
    1. 在添加了活体微生物的 NGM 平板上,将年龄同步的卵在 20 °C 下孵育 64 小时 大肠杆菌 以OP50作为食物
    2. 用S缓冲液清洗同步化至L4期的幼虫,并将它们(约500条以上)转移至含有不同细菌和化学物质的处理用NGM平板。在20 °C下培养48小时。
      注意: 处理时间可根据所用细菌和化学物质的不同,介于24至72小时之间。DIM的治疗或预防效果也可通过以下方式评估:先用病原体预处理线虫,再用DIM处理线虫(评估治疗效果);或先用DIM预处理线虫,再用病原体处理(评估预防效果)。
    3. 为制备含FITC-葡聚糖的培养板,将2 mL热灭活的 大肠杆菌 OP50 加入 4 mg FITC-葡聚糖。然后,将 100 µL FITC-葡聚糖分装 E. coli 将OP50混合物加入二十个新的NGM琼脂平板(60 mm × 15 mm)中,并在洁净工作台上静置干燥1小时。
      注意: 每个NGM平板中FITC-葡聚糖的终浓度为20 μg/mL。
    4. 准备五个 E. coli 不含FITC-葡聚糖的OP50 NGM平板用于溶剂对照处理。为此,取100 µL热灭活的 E. coli 在洁净工作台上,将OP50涂布于每块新的NGM琼脂平板(60 mm × 15 mm)上,静置干燥1小时。
      注意: 每次独立实验需要十五个添加了FITC-葡聚糖的NGM平板和五个未添加FITC-葡聚糖的NGM平板。
    5. 在处理48小时后(自步骤2.2起),用S缓冲液洗涤线虫,将线虫转移至添加FITC-葡聚糖的平板以及不含FITC-葡聚糖的NGM平板,并将平板在常温下孵育过夜(14–15 h)。
      注意: 每个处理组需要进行5次FITC-葡聚糖染色(或溶剂对照喂养)重复实验。
    6. 用S缓冲液清洗线虫,然后将其转移至新鲜的NGM琼脂平板上爬行1小时。
      注意: 每次独立实验共需要 20 个新鲜的 NGM 平板。在此步骤中,您可以使用未添加或添加了的 NGM 平板 E. coli OP50
    7. 向黑色96孔平底板的每个孔中加入50 µL 4%甲醛溶液。从每块NGM平板转移约50条线虫至各孔,用于荧光检测。1至2分钟后,彻底移除各孔中的甲醛,并加入100 µL封片介质以覆盖孔壁。
      注意: 4% 甲醛溶液用于固定和 immobilize 线虫。每个处理组使用 5 个孔(5 个重复)进行图像分析。
  3. 成像 秀丽隐杆线虫 使用Operetta成像系统通过检测FITC-葡聚糖荧光吸收测定肠道通透性
    注意:荧光体视显微镜可替代Operetta系统用于图像分析。
    1. 使用 Operetta 高内涵成像系统捕获荧光图像并测量荧光强度,并通过 Harmony 软件分析图像。
    2. 在 Harmony 软件中,按下该图标 打开盖子 打开盖子并将培养皿放入仪器中。
    3. 设置参数。
    4. 点击 设置,选择培养板类型(96孔Corning平底板)并添加通道(明场和EGFP通道)。
    5. 调整布局。前往 布局选择,然后选择 追踪 并调整参数(第一张图片为 1 µm,平面数为 10,间距为 1 µm)。
    6. 选择一个处理孔和一个捕获视野,然后按下 测试 检查图片是否令人满意 运行实验 部分
    7. 如果图像满意,返回到 设置 切片并按压 重置 屏幕末端的图标。然后,选择所有目标孔以及适当数量的捕获区域。
    8. 前往 进行实验 再次输入并输入板名称,然后按 开始 开始处理。
    9. 为了测量荧光强度,进入图像分析部分并导入图像。通过选择EGFP通道和方法B来识别细胞。将共同阈值调整为0.5,面积调整为 >200 µm2,分裂因子设为3.0,个体阈值设为0.18,对比度设为大于0.18。然后计算强度属性,并选择平均值作为输出。按下 应用 保存设置的图标。
    10. 前往 评估 通过获取热图和数据表来测量强度的区域。设置 读出参数细胞 — EGFP强度细胞平均值 — 每孔平均值 并开始评估。
      注意: 此处可暂停该实验方案。
    11. 要从 Operetta 中提取数据,请单击 设置 按钮并选择 数据管理.
    12. 选择 写入归档,然后打开浏览器并选择该文件。
    13. 要选择文件,请点击小 + 左上角的信号,然后单击 测量 并选择 培养皿名称.
    14. 选择文件并单击 好的.
    15. 单击以选择保存文件的路径 浏览 激活通路中的信号
    16. 点击 开始 保存数据文件。
      注意: 此处可暂停实验方案。
  4. FITC-葡聚糖荧光的统计分析 秀丽隐杆线虫
    1. 导入数据,并使用统计软件计算均值和标准差(SD)。
    2. 采用单因素方差分析(ANOVA)进行显著性差异分析,随后进行Tukey多重比较检验。

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结果

荧光显微镜,FITC标记的细菌,E. coli,P. aeruginosa,DIM处理,柱状图结果。
图1:DIM对摄食P. aeruginosaC. elegans肠道通透性的影响。 虫体的显微图像来自以下组别:(A)未饲喂FITC-葡聚糖的E. coli OP50组;(B)饲喂FITC-葡聚糖的E. coli组;(C)饲喂FITC-葡聚糖的P. aeruginosa PAO1组;以及(

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
3,3’-二吲哚基甲烷 SigmaD9568
90×15 mm 培养皿SPL Life Sciences, South Korea10090
细菌琼脂Beckton DickinsonREF. 214010
甲醛溶液 SigmaF1635
秀丽隐杆线虫 N2秀丽隐杆线虫遗传中心(CGC)野生型 
胆固醇SigmaC3045
Costa 检测板,96 孔黑色带透明平底未经处理的聚苯乙烯板,无盖Corning IncorporatedREF. 3631
二甲基亚砜SigmaD2650
大肠杆菌 OP50秀丽隐杆线虫遗传中心(CGC)
异硫氰酸荧光素-葡聚糖SigmaFD10S
Harmony 软件 PerkinElmer版本 3.5
七水合硫酸镁 Fisher BioreagentsBP2213-1
Fluoromount 水性封片介质SigmaF4680
Operetta CLS 高内涵分析系统PerkinElmer HH16000000
蛋白胨MerckEMD 1.07213.1000
铜绿假单胞菌 PA01韩国典型培养物保藏中心KCTC NO. 1637
氯化钠Fisher BioreagentsBP358-1
体视显微镜Nikon, JapanSMZ800N

标签

荧光显微镜甲醛固定细菌喂养DIM处理病原体暴露线虫清洗琼脂平板