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方法文章

基于胚胎的化学毒性筛选:评估对发育中斑马鱼胚胎的影响

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2023年4月30日

本文内容

摘要

来源:Hao J. 等,基于斑马鱼的大规模体内小分子筛选。J. Vis. Exp. (2010)

本文使用斑马鱼胚胎进行化学毒性筛选。化学毒性与表型读数相关。示例方案展示了开展化学毒性筛选的方法学途径。

方案

1. 小分子文库的转移

尽管化合物转移可通过机器人转移方法实现自动化,但本文将描述手动转移方法。

  1. 小分子文库通常以96孔板形式提供,每种化合物以10 mM的储备液形式溶于DMSO中。在胚胎达到需要添加化合物的发育阶段前约60分钟,取出含有小分子分装液(来源板)的所需数量的96孔板进行解冻。记录来源板的序列号或其他识别编号。为尽量减少板上产生冷凝,可在含有干燥剂(Drierite,W.A. HAMMOND DRIERITE CO, Xenia, OH)的干燥箱中进行解冻。
  2. 使用配备多孔板适配器的台式离心机对板进行短暂离心。
  3. 移除来源板上的铝密封膜。使用12通道移液器,将来源板中的化合物稀释至0.5 mM的浓度(例如,若起始为10 mM储备液的250 nL分装量,则向每孔加入4.75 μL DMSO)。
  4. 当96孔板中的胚胎(受体板)达到目标发育阶段时,使用12通道(2–20 μL)移液器将2.5 μL的化合物溶液(0.5 mM)从来源板转移至含有胚胎的受体板中。
  5. 在受体胚胎板上记录来源板的识别编号。用盖子盖好现已含有胚胎和化合物的受体板,轻轻晃动混匀,并将其置于28.5°C培养箱中孵育。
  6. 用铝密封膜封好每块含有未使用小分子(0.5 mM)的来源板,并置于-80°C冰箱中长期保存。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
以 DMSO 为溶剂、浓度为 10 mM 的结构多样化小分子化合物库,以 96 孔板格式排列。每块主板分装至 96 孔聚丙烯储存板(Corning)中,并于 -80°C 保存°C直至
使用。
DrieriteW.A. HAMMOND DRIERITE CO, Xenia, OH
12通道移液器,2-20 μL μL Eppendorf
96孔板用铝封膜 Nunc,罗切斯特,纽约州
DMSO Sigma,美国密苏里州圣路易斯
基础培养箱,28.5°C Fisher Scientific
聚苯乙烯96孔圆底检测板Corning COSTAR;洛威尔,马萨诸塞州
带透射光源底座的体视显微镜 Leica Microsystems,Bannockburn,IL
E3 胚胎培养基:5 mM NaCl,0.17 mM KCl,0.33 mM CaCl2,0.33 mM MgSO4,含 0.003% PTU(苯硫脲,Sigma;St. Louis, MO)。 PTU 可配制成 10 倍浓度溶液,方法是将 0.3 g PTU 溶解于 1 L E3 胚胎培养基中。含 PTU 的溶液应避光保存,可用铝箔包裹。

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