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基于胚胎的化学毒性屏幕:评估对斑马鱼胚胎发育的影响

April 30th, 2023

In This Article

Abstract

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资料来源:浩J 等人, 大型斑马鱼基在体内小分子屏幕J. 维斯 (2010)

在本文中,斑马鱼胚胎用于化学毒性筛查。化学毒性与表型读数相关。样本协议显示了执行化学毒性筛查的方法论方法。

Protocol

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1. 小分子库的转移

虽然复合转移可以通过机器人传输方法实现自动化,但我们将描述手动转移方法。

  1. 小分子库通常以 96 井格式提供,每个化合物都存储在 DMSO 中,作为 10 mM 库存。在胚胎到达添加化合物的阶段前约60分钟,解冻了96个含有小分子(源板)的96个井板。注意源板的序列号或其他标识号。为了尽量减少板块上的凝结,解冻可能发生在含有德里石的干燥室(W.A.哈蒙德德里埃里特公司,Xenia,OH)。
  2. 在装有多井板适配器的桌面离心机中短暂地旋转板。
  3. 从源板中取出铝密封胶带。使用 12 通道移液器,将源板中的化合物稀释到 0.5 mM 的浓度(例如,如果从 250 nL 的 1000 万立方米库存开始,则向每口井添加 4.75 μL 的 DMSO)。
  4. 当96井板(受体板)中的胚胎达到预期阶段时,使用12通道(2-20 μL)移液器将2.5μL化合物(0.5mM)从源板转移到含有胚胎的受体板中。
  5. 记录接受者胚胎板上来源板的识别编号。将现在含有胚胎和化合物的受体板盖上盖子,轻轻旋转将板混合,并将其放置在 28.5°C 的孵化器中。
  6. 用铝密封胶带盖住每个含有未使用小分子(0.5 mM)的源板,并放置在 -80°C 的冰柜中,以进行长期存储。

2. 通过对表型的视觉检查对小分子的影响进行筛查

  1. 在执行屏幕之前,为构成"命中"的内容制定具体标准。
  2. 在发育的理想时间,从孵化器中取出含有复合处理胚胎的96井板,并在立体显微镜下检查每个井。为了更好地可视化细微的变化,如循环模式的变化,可以使用相位对比倒显微镜。荧光显微镜可用于检查特定组织促进剂下 GFP 或 DsRed 蛋白质表达的扰动。
  3. 快速扫描96井板的任何井,其中至少3出5个胚胎显示规定的"命中"表型。记录板的标识和每个潜在命中的井位置。
  4. 通过在几剂(1 uM、5 uM、10 μM 和 50 μM)中重新测试化合物的效果,再次确认潜在的打击。每剂量,10个胚胎以48个井板格式在0.5 mL的E3介质中测试。复检的复合添加时间应与原始筛选的时间相同。当在复检化合物时复制引出的表型时,会确认一击
  5. 从化学库中小分子数据库中识别命中化合物。

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Materials

<表格border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"> List of materials used in this article Name Company Catalog Number Comments 结构多样的化合物的小分子文库,以 96-wll 格式排列,溶于 DMSO 中,浓度为 10 mM。将每个主板等分到96孔聚丙烯储存板(康宁)中,并在-80°C下储存至
用。 德里石 W.A. HAMMOND DRIERITE CO,俄亥俄州森尼亚 12 通道移液器,2-20 μL Eppendorf 埃本多夫 用于 96 孔板的铝密封胶带 Nunc,纽约州罗切斯特 DMSO Sigma, 密苏里州圣路易斯 基本培养箱,28.5°C Fisher Scientific 公司 聚苯乙烯 96 孔圆底分析板 康宁 COSTAR;马萨诸塞州洛厄尔 带透射光底座的体视显微镜 徕卡显微系统公司,伊利诺伊州班诺克本 E3 胚胎培养基:5 mM NaCl、0.17 mM KCl、0.33 mM CaCl2、0.33 mM MgSO4,含有 0.003% PTU(苯硫代脲,Sigma;密苏里州圣路易斯)。 通过将 0.3 g PTU 溶解在 1 L E3 胚胎培养基中,可以将 PTU 制备为 10x 溶液。含有 PTU 的溶液应用铝箔覆盖,避光保护。

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Zebrafish EmbryosChemical Toxicity ScreenSmall Molecule LibraryForebrain DevelopmentPhenotype Readout96 Well PlateDMSO DilutionMicroscope ExaminationHit ConfirmationDose Response

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