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磷酸化肽富集:一种基于抗体的免疫沉淀技术,用于从复杂的肽混合物中分离特异性的磷酸化肽

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2023年4月30日

本文内容

摘要

来源:Cheng, L. C. 等。利用非标记定量质谱结合磷酸肽富集技术研究前列腺癌中的磷酸化蛋白质组。J. Vis. Exp. (2018)。

在本视频中,我们演示了从肽段混合物中使用抗体进行磷酸化肽段的免疫沉淀。富集后的磷酸化肽段经真空浓缩并保存,用于后续分析。

方案

1. pY 肽段的免疫沉淀与富集

  1. 将纯化后的肽段冻干粉各组分分别用0.5 mL预冷的免疫沉淀(IP)结合缓冲液重悬。将第二组分的0.5 mL重悬液转移至第一组分中以合并组分,并保留移液器吸头。剧烈涡旋振荡(避免反复吹打)以确保样品完全溶解,随后转移至3.6 mL螺口冻存管中。
  2. 用另外0.5 mL IP结合缓冲液冲洗冻干管表1)。使用同一枪头将溶液转移至3.6 mL螺口管中,以尽量减少样品损失。再重复洗涤1次,最终重悬体积为2 mL(对应5 mg蛋白)。测定样品pH值,确保其约为7.4。若pH过低,逐次加入10 µL 1 M Tris(未滴定,pH ~11)进行调节;若pH过高,逐次加入10 µL稀释盐酸(1:25 或 1:100)进行调节。
  3. 预洗 pY 珠子(用于 5 mg 起始裂解液)
    1. 每个样本需要 25 µg 的 4G10 抗体和 12.5 µg 的 27B10.4 抗体。使用切去尖端的 p200 移液枪将抗体分别转移至微量离心管中后,用 450 µL 冰冷的 IP 结合缓冲液洗涤抗体 2 次。在 4 °C 下以 100 × g 离心 1 分钟,并吸除上清液。 
    2. 将磁珠用IP结合缓冲液重悬至储存浓度0.5 mg/mL。(切勿涡旋振荡磁珠。)将所需体积的浆液(每份样品分别加入50 µL 4G10抗体浆液和25 µL 27B10.4抗体浆液)分装....

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披露

未声明任何利益冲突。

材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
冷冻干燥机Labconco7420020
CentriVap 台式真空浓缩仪Labconco7810010
Kimwipes 擦拭纸Fisher Scientific06-666A
Millipore 0.2 µm 离心过滤器Millipore SigmaUFC30GVNB
低蛋白吸附 Eppendorf 离心管Eppendorf22431081
抗磷酸化酪氨酸抗体-琼脂糖偶联物,克隆号:4G10Millipore Sigma16101
27B10.4 抗体CytoskeletonAPY03-beads
肽定量检测试剂盒Thermo Scientific23275
TopTipPolyLC IncTT200TIO.96
SCX 柱(PolySULFOETHYL A)PolyLC IncSPESE1203
3 mL 注射器BD309657
MilliQ 水 用于配制所有溶液和缓冲液的去离子水
三氟乙酸(TFA)Fisher ScientificPI-28904
乙腈(ACN)Fisher ScientificA21-1
氯化钾 Fisher ScientificBP366-500
乳酸 Sigma-Aldrich69785-250ML
氢氧化铵Fisher ScientificA669S-500
Tris 碱Fisher ScientificBP152-5

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