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方法文章

福尔马林固定石蜡包埋组织RNA显色原位杂交前处理:一种用于RNA显色原位杂交的福尔马林固定石蜡包埋组织切片处理流程 关键词:FFPE组织,RNA显色原位杂交,福尔马林固定,石蜡包埋,组织前处理,原位杂交,RNA检测,组织切片

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2023年4月30日

本文内容

摘要

来源:Outh-Gauer, S. . 染色原位杂交作为人乳头瘤病毒相关头颈部癌症诊断的工具. J. Vis. Exp. (2019)

本视频展示了福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本进行RNA染色原位杂交前处理的步骤。前处理过程有助于保持细胞内核酸的完整性以及整体组织形态。

方案

所有涉及人类参与者的操作均按照机构、国家和国际的人类福利指南进行,并已通过当地机构审查委员会的审查。

1. 材料的准备

  1. 1× 目标修复试剂的配制
    1. 在一大烧杯中,将 70 mL 的 10× 目标修复试剂 (见 材料表) 加入 630 mL 蒸馏水中。
    2. 将烧杯置于带磁力搅拌器的加热板上,并用铝箔覆盖。
    3. 在 100 °C 下煮沸 10–15 分钟。
      注意:煮沸时间不得超过 30 分钟。

2. 组织预处理

注意:这些步骤遵循制造商针对头颈部样本提出的“标准”预处理建议。根据所操作的组织类型,第 2.1 和 2.2 节的操作时间可能需要相应调整。

  1. 阻断过氧化物酶活性
    1. 向每张载玻片上加入 4–6 滴过氧化氢 (参见 材料表),室温孵育 10 分钟。
    2. 用蒸馏水在室温下洗涤载玻片,每次 2 分钟,共洗 2 次。
  2. 断裂 RNA/组织结合
    1. 用镊子移除置于加热板上、正在沸腾的 1× 目标修复试剂(TTR1x)容器表面的铝箔,并停止搅拌。将载玻片架缓慢且极其小心地浸入其中,持续 15 分钟。之后再次用铝箔覆盖烧杯。
      注意:此步骤期间必须保持微沸状态。
      警告:使用镊子操作铝箔和载玻片架,以避免烫伤。务必穿戴适当的个人防护装备,如手套和实验服。
    2. 立即用镊子将热的载玻片架迅速转移至蒸馏水浴中,洗涤 2 分钟。
      注意:确保样本不在 TTR1x 中冷却。
    3. 用新鲜的 100% 乙醇洗涤载玻片 2 分钟。
    4. 让载玻片在室温下干燥 2 分钟。
  3. 建立疏水屏障
    1. 使用疏水屏障笔 (参见 材料表),在样本周围画一圈屏障。使其干燥至少 5 分钟。
      注意:确保屏障完全干燥。若在操作过程中屏障磨损,请毫不犹豫地重新绘制。避免用笔触碰组织。本步骤可在此处暂停过夜。
  4. 蛋白酶消化
    1. 将载玻片放置在载玻片架上,每个样本加入约 4 滴 Protease Plus (参见 材料表)
    2. 将湿度控制盘盖上盖子,放入杂交炉中,在 40 °C 下孵育 30 分钟。
      注意:为防止蒸发,请确保旋钮完全旋转至锁定位置。
    3. 从烘箱中取出托盘,并取出载玻片架。
    4. 逐张载玻片快速去除多余液体,并将其放入盛有蒸馏水的染色缸中浸没的载玻片架内。
    5. 用蒸馏水在室温下洗涤载玻片,每次 2 分钟,共洗 2 次。持续轻轻振荡。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
HybEZ 烤箱(110v)Advanced Cell Diagnostics 公司321710
HybEZ 载玻片架Advanced Cell Diagnostics 公司300104
ImmEdge 疏水屏障笔Advanced Cell Diagnostics 公司310018
RNAscope H202 &蛋白酶增强试剂Advanced Cell Diagnostics 公司322330过氧化氢 ×2 和蛋白酶 Plus ×1
RNAscope 目标修复试剂Advanced Cell Diagnostics 公司322000

标签

RNA CISH