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体外短发夹RNA介导的iHSPCs基因敲低:基于慢病毒的shRNA表达系统递送用于iHSPCs中特定基因表达的敲低

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2025年7月8日

本文内容

摘要

来源:Hsiao, Y. L., 等 通过短发夹RNA介导的基因沉默在造血干细胞与祖细胞系中研究树突状细胞发育 体外 J. Vis. Exp. (2022).

在本视频中,我们演示一种方法,通过将 shRNA 慢病毒载体转导至永生化造血干细胞和祖细胞(iHSPCs)中,以获得稳定的基因敲低细胞系。

方案

1. 永生化造血干细胞和祖细胞系(iHSPCs)的制备

  1. 在含有 100 ng/mL FL 和 1 μM β-estradiol 的完全 RPMI 1640 培养基中培养 iHSPC 细胞系。
  2. 每 3 天以 1:10 的比例传代细胞。
    注意:通过添加 10% 胎牛血清(FBS)、5 × 10-5 M β-巯基乙醇和 10 μg/mL 庆大霉素配制完全 RPMI 1640 培养基。重组小鼠 FL 也可从商业途径获得。

2. 慢病毒转导

  1. 将iHSPCs以1 × 105 个细胞/孔的密度接种于12孔板中,每孔加入含100 ng/mL FL、1 μM β-雌二醇和8 μg/mL polybrene的1 mL完全培养基。
    注意:polybrene的浓度取决于细胞类型,通常在4–8 μg/mL范围内。
  2. 在每孔中加入携带shRNA的慢病毒,感染复数(MOI)为100。
    注意:慢病毒载体为带有嘌呤霉素筛选标记的pLKO.1-Puro(图1)。针对LacZ、Tcf4和Id2的shRNA靶序列分别列于

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结果

pLKO.1-puro 质粒图谱,基因编辑载体,启动子及限制性酶切位点。
图 1:慢病毒载体 pLKO.1-Puro 的构建图谱。

....

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
1.5 mL 微量离心管 ExtraGene TUBE-170-C
12孔组织培养处理板 Falcon 353043
胎牛血清(FBS) Corning 35-010-CV
RPMI 1640 培养基 Gibco 11875-085
β-雌二醇  Sigma-AldrichE2758-250MG
β-巯基乙醇(β-ME) Sigma-Aldrich M6250
Flt3 配体(FL) 自制
聚凝胺(Polybrene) Sigma-Aldrich TR-1003-G
嘌呤霉素(Puromycin) Invivogen ant-pr-1
shId2 (GCTTATGTCGAATGATAGCAA/TRCN0000054390)RNA干扰联合体(TRC)
shLacZ (CGCGATCGTAATCACCCGAGT/TRCN0000072224)RNA干扰联合体(TRC)
shTcf4 (GCTGAGTGATTTACTGGATTT/TRCN0000012094)RNA干扰联合体(TRC)

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