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基于siRNA逆转录转染的体外基因沉默:一种将小干扰RNA递送至培养细胞以抑制靶基因表达的实验方法

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2025年7月8日

本文内容

摘要

来源:Jager, J.   一种用于研究蛋白质和微小RNA调控对脂肪细胞功能影响的脂肪细胞培养模型. J. Vis. Exp. (2021)。

在本视频中,我们介绍了一种将siRNA反向转染至脂肪细胞以调控目标蛋白表达的实验方法。

方案

1. 预包被板的制备

  1. 转染前一天或转染前数小时,使用浓度为 1 mg/mL 的胶原蛋白 I 型储备液,以 30% 乙醇配制 100 µg/mL 的胶原蛋白 I 型溶液。每孔 12 孔板加入 250 µL 胶原蛋白溶液,每孔 24 孔板加入 125 µL,并将溶液均匀铺展于孔底表面。
  2. 将培养板置于超净工作台内,敞盖放置直至胶原溶液完全干燥。用杜氏磷酸盐缓冲液(D-PBS)洗涤两次。
    注意: 预包被的培养板可直接购买使用。

2. 转染混合物的制备

注意:siRNA 的终浓度范围为 1 至 100 nM(每孔 12 孔板加入 1 至 100 pmol siRNA)。miR 模拟物的终浓度为 10 nM(每孔 10 pmol)。在开始实验前,应预先确定每种 siRNA、miR 模拟物或其他寡核苷酸的最佳浓度,以避免脱靶效应。转染实验应设置三个重复孔,以便对结果进行统计学分析。所有试剂均需过量配制,以补偿移液过程中的正常损耗。

  1. 用移液器将siRNA(或其他寡核苷酸)与改良的最低必需培养基(表1)混合(体积/体积)。室温孵育5分钟。
  2. 将转染试剂和改良的最低必需培养基加入siRNA中,用移液器轻轻混匀(表1)。室温孵育20分钟(在此期间,进行第3节操作)。将转染混合物加入胶原包被板的每孔中。

3. 3T3-L1 脂肪细胞的制备

  1. 用 D-PBS 将 100 mm 培养皿中的细胞洗涤两次。向细胞中加入 5× 胰蛋白酶(每 100 mm 培养皿加 1 mL),确保胰蛋白酶覆盖整个培养皿表面。静置 30 秒后,小心吸除胰蛋白酶。
  2. 在培养箱中于 37 °C 孵育培养皿 5–10 分钟。轻敲 100 mm 培养皿以使细胞脱落。
  3. 加入10 ml不含丙酮酸盐、含25 mM葡萄糖、10% FCS和1%青霉素-链霉素的DMEM以中和胰蛋白酶。轻轻吹打培养基,使细胞脱离并混匀细胞悬液。
  4. 使用血球计数板或自动细胞计数仪对细胞进行计数,并将细胞浓度调整至 6.25 × 10⁵ 个/mL5 细胞/mL 培养基。每孔接种 800 µL 细胞悬液至 12 孔板(5 x 10⁵ 细胞/孔)。5 细胞)或每孔400 µl细胞悬液(24孔板,2.5 × 10⁵ 个细胞/孔)5 细胞)加入转染混合物。
    注意: 一个100 mm培养皿的脂肪细胞可用于制备一个12孔板或一个24孔板。一个100 mm培养皿通常含有6-7 × 106 脂肪细胞,相当于 5 x 105 每孔脂肪细胞数(12孔板)
  5. 将培养板置于细胞培养箱中(7% CO2,37 °C)孵育,24 h内勿扰动细胞。次日,小心吸去上清液,更换为新鲜的DMEM培养基(不含丙酮酸,含25 mM葡萄糖、10% FCS和1%青霉素-链霉素)。
    注意: 也可将细胞接种于胶原蛋白预包被的48孔板和96孔板中,但在更换培养基时需更加小心,以避免脂肪细胞脱落。
每孔(12孔板)每孔(24孔板)
寡核苷酸20 µL10 µL
(si-RNA、miR…)
改良最低必需培养基20 µL10 µL
转染试剂5.6 µL2.8 µL
改良最低必需培养基154.4 µL77.2 µL
转染混合物体积总量200 µL100 µL

表1:12孔板和24孔板培养格式所需的转染试剂。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
12 孔组织培养板Dutscher353043
2.5% 胰蛋白酶(10 倍浓度)Gibco15090-046用 D-PBS 稀释至 5 倍浓度
2-丙醇SigmaI9516
3-异丁基-1-甲基黄嘌呤Sigma-AldrichD5879
牛血清白蛋白(BSA)SigmaA7030
小牛皮来源 I 型胶原蛋白Sigma-AldrichC8919
地塞米松Sigma-AldrichD1756
D-PBSGibco14190144
杜尔贝科改良伊格尔培养基(DMEM)Gibco41965062含 4.5 g/L D-葡萄糖;L-谷氨酰胺;不含丙酮酸盐
乙醇Sigma51976
miRIDIAN micro-RNA 模拟物 Horizon Discovery
FAM 标记的阴性对照 siRNAInvitrogenAM4620
新生小牛血清 Gibco16010-159
胎牛血清Gibco10270-106
青霉素和链霉素 Gibco15140-122
FAM 标记的阴性对照 siRNA InvitrogenAM4620
ON-TARGETplus 小鼠 Plin1 siRNA SMARTpool Horizon Discovery L-056623-01-0005
游离甘油检测试剂Sigma-AldrichF6428
培养皿(100 mm × 20 mm)Dutscher353003
转染试剂(INTERFERin)Polyplus409-10
优化最低必需培养基(Opti-MEM)Gibco31985-047
人重组胰岛素Gibco12585-014

标签

siRNA RNA mRNA