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方法文章

用于细胞DNA损伤检测的彗星实验

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2025年7月8日

本文内容

摘要

来源:Ji, Y., 等. 一种用于评估细胞DNA损伤的高通量彗星实验方法J. Vis. Exp. (2022)。

该视频演示了在暴露于有害物质后,利用彗星实验检测DNA损伤的方法。在碱性条件下,DNA解旋并发生变性,经过电泳后,未受损和受损的DNA在琼脂糖凝胶中的迁移行为不同,形成彗星状结构。迁移较慢的未受损DNA构成圆形的彗星头部,而迁移较快的受损DNA片段则形成拉长的彗星尾部。

方案

1. 准备彗星实验所需材料

  1. 显微镜载玻片的制备
    1. 取1% (w/v) 正常熔点琼脂糖[溶于双蒸水(ddH2O)中],加入50 mL离心管,用微波炉加热以使琼脂糖在ddH2O中完全溶解。将溶液置于37 °C保存,以防止在涂片前发生凝固。若发生凝固,应弃去并重新配制。
    2. 将显微镜载玻片浸入盛有1% (w/v) 正常熔点琼脂糖的50 mL离心管中,进行预包被。
    3. 浸渍后迅速擦干载玻片背面。
      注意:若未正确擦干载玻片背面,将在显微镜分析步骤中增加背景噪声。
    4. 使用永久性记号笔在磨砂区域的右下角标记已包被的载玻片(图1A),以标明载玻片的预包被面。
    5. 室温下静置过夜,使琼脂糖凝固并干燥。
    6. 将干燥后的载玻片用纸巾包裹,并存放于盒子中保存。

2. 样品制备

  1. 培养的细胞
    注意:首先,在开始彗星实验之前,用损伤试剂处理细胞。然后执行以下步骤。
    1. 如果细胞为贴壁细胞,使用胰蛋白酶消化以从细胞培养瓶或细胞培养培养皿中释放细胞,并在适当的细胞汇合度下进行。通过添加含血清的培养基来中和胰蛋白酶。<....

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结果

电泳中使用玻璃板进行蛋白质分离的色谱图及装置示意图。
图1:彗星试验载玻片和高通量载片架(显微镜载玻片载体)的代表性图像。 (A)为正确识别方向,显微镜载玻片上预包被的一面可通过载玻片右下角的黑点进行辨认。(B)高通量载片架的图像显示了载玻片如何保持紧密的垂直排列,载体上的卡扣可固定其在电泳槽中的方向。每个载体最多可容纳25张载玻片。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
22 x 22 mm 玻璃盖玻片美国新罕布什尔州汉普顿,Fisher Scientific631-0124
配备荧光显微镜<br/> &nbsp;使用相机蔡司,德国耶拿
高通量彗星试验系统Cleaver ScientificCOMPAC-50
人角质形成细胞(HaCaTs)美国典型培养物保藏中心<br/> &nbsp;(ATCC),美国弗吉尼亚州马纳萨斯已停止使用可从其他供应商购买<br/> &nbsp;公司<br/> &nbsp;ADDEXBIO TECHNOLOGIES<br/> &nbsp;货号 T0020001
过氧化氢(H2O2)<br/> &nbsp;30% 水溶液美国新罕布什尔州汉普顿,Fisher Scientific公司BP2633-500
图像与数据分析软件Perceptive Instrument<br/> &nbsp;英格兰伯里圣埃德蒙兹<br/> &nbsp;英国125525免费的图像分析软件是<br/> &nbsp;可用,例如 ImageJ
低熔点琼脂糖Invitrogen<br/> &nbsp;美国马萨诸塞州沃尔瑟姆P4864
Na₂EDTA(二钠)<br/> &nbsp;乙二胺四乙酸Sigma Aldrich,<br/> &nbsp;密苏里州圣路易斯市,MO<br/> &nbsp;美国E5134
NaCl(氯化钠)Sigma Aldrich,<br/> &nbsp;密苏里州圣路易斯市,MO<br/> &nbsp;美国S7653
Nanopure Infinity 超纯水<br/> &nbsp;系统(Barnstead Nanopure)Thermo Scientific<br/> &nbsp;马萨诸塞州沃尔瑟姆,<br/> &nbsp;美国D11901超纯水(16 MΩ·cm)&Omega; cm⁻¹
NaOH(氢氧化钠)Sigma Aldrich,<br/> &nbsp;美国密苏里州圣路易斯E5134
正常熔点琼脂糖Fisher Scientific<br/> &nbsp;美国新罕布什尔州汉普顿16520100用于预包被载玻片
碘化丙啶<br/> &nbsp;(1.0 mg/mL,水溶液)Sigma Aldrich,<br/> &nbsp;密苏里州圣路易斯市<br/> &nbsp;美国12-541BP486410ML
单面磨砂载玻片<br/> &nbsp;载玻片Fisher Scientific<br/> &nbsp;美国新罕布什尔州汉普顿12-541B
载玻片盒Fisher Scientific<br/> &nbsp;美国新罕布什尔州汉普顿03-448-2避光,以保护细胞免受光照损伤<br/> &nbsp;形成非特异性损伤<br/> &nbsp;(根据普遍接受的观点)<br/> &nbsp;并防止荧光褪色<br/> &nbsp;染料
载玻片冷却板Cleaver Scientific,<br/> &nbsp;英格兰拉格比<br/> &nbsp;英国CSL-CHILLPLATE
处理皿Cleaver Scientific<br/> &nbsp;英格兰拉格比<br/> &nbsp;英国STAINDISH4X
Tris碱Sigma Aldrich,<br/> &nbsp;密苏里州圣路易斯市,MO<br/> &nbsp;美国93362
Triton X-100Fisher Scientific<br/> &nbsp;美国新罕布什尔州汉普顿BP151-500
胰蛋白酶EDTA(0.5%)Invitrogen<br/> &nbsp;Gibco<br/> &nbsp;美国马萨诸塞州沃尔瑟姆15400054
垂直载玻片架Cleaver Scientific<br/> &nbsp;英格兰拉格比<br/> &nbsp;英国COMPAC-25

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