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用于细胞DNA损伤检测的彗星实验

2025年7月8日

本文内容

摘要

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来源:Ji, Y., 等. 一种用于评估细胞DNA损伤的高通量彗星实验方法J. Vis. Exp. (2022)。

该视频演示了在暴露于有害物质后,利用彗星实验检测DNA损伤的方法。在碱性条件下,DNA解旋并发生变性,经过电泳后,未受损和受损的DNA在琼脂糖凝胶中的迁移行为不同,形成彗星状结构。迁移较慢的未受损DNA构成圆形的彗星头部,而迁移较快的受损DNA片段则形成拉长的彗星尾部。

方案

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1. 准备彗星实验所需材料

  1. 显微镜载玻片的制备
    1. 取1% (w/v) 正常熔点琼脂糖[溶于双蒸水(ddH2O)中],加入50 mL离心管,用微波炉加热以使琼脂糖在ddH2O中完全溶解。将溶液置于37 °C保存,以防止在涂片前发生凝固。若发生凝固,应弃去并重新配制。
    2. 将显微镜载玻片浸入盛有1% (w/v) 正常熔点琼脂糖的50 mL离心管中,进行预包被。
    3. 浸渍后迅速擦干载玻片背面。
      注意:若未正确擦干载玻片背面,将在显微镜分析步骤中增加背景噪声。
    4. 使用永久性记号笔在磨砂区域的右下角标记已包被的载玻片(图1A),以标明载玻片的预包被面。
    5. 室温下静置过夜,使琼脂糖凝固并干燥。
    6. 将干燥后的载玻片用纸巾包裹,并存放于盒子中保存。

2. 样品制备

  1. 培养的细胞
    注意:首先,在开始彗星实验之前,用损伤试剂处理细胞。然后执行以下步骤。
    1. 如果细胞为贴壁细胞,使用胰蛋白酶消化以从细胞培养瓶或细胞培养培养皿中释放细胞,并在适当的细胞汇合度下进行。通过添加含血清的培养基来中和胰蛋白酶。<....

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结果

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电泳中使用玻璃板进行蛋白质分离的色谱图及装置示意图。
图1:彗星试验载玻片和高通量载片架(显微镜载玻片载体)的代表性图像。 (A)为正确识别方向,显微镜载玻片上预包被的一面可通过载玻片右下角的黑点进行辨认。(B)高通量载片架的图像显示了载玻片如何保持紧密的垂直排列,载体上的卡扣可固定其在电泳槽中的方向。每个载体最多可容纳25张载玻片。

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材料

<表格border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"> 本文使用的材料清单 姓名 公司 目录编号 评论 22 x 22 mm 玻璃盖玻片 Fisher Scientific,美国新罕布什尔州汉普顿 631-0124 配备荧光显微镜
带摄像头 蔡司,耶拿,德国 HTP 彗星检测系统 克利弗科学公司 康帕克 - 50 人角质形成细胞 (HaCaTs) 美国类型文化馆藏
(ATCC),美国弗吉尼亚州马纳萨斯 停止 可以从其他
购买 公司
ADDEXBIO TECHNOLOGIES
Cat# T0020001 过氧化氢 (H2O2)
30% 在水中 Fisher Scientific,美国新罕布什尔州汉普顿 型号 BP2633-500 图像和数据分析软件 感知仪器,
英格兰伯里圣埃德蒙兹,
英国 125525 免费图像分析软件是
可用,例如 ImageJ 低熔点琼脂糖 Invitrogen
美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 货号 P4864 Na2 EDTA(二钠
乙二胺四乙酸) Sigma Aldrich,
密苏里州圣路易斯,
美国 编号 E5134 NaCl (氯化钠) Sigma Aldrich,
密苏里州圣路易斯,
美国 S7653 系列 Nanopure Infinity 超纯水
系统(Barnstead Nanopure) Thermo Scientific,
马萨诸塞州沃尔瑟姆,
美国 编号 D11901 超纯水(16MΩ cm ^{-1} ) NaOH(氢氧化钠) Sigma Aldrich,
美国密苏里州圣路易斯 编号 E5134 正常熔点琼脂糖 Fisher Scientific,
美国新罕布什尔州汉普顿 16520100 用于预涂玻片 碘化丙啶
(1.0 mg/mL,溶于水) Sigma Aldrich,
密苏里州圣路易斯,
美国 12-541BP486410 毫升 单磨砂玻璃显微镜
幻灯片 Fisher Scientific,
美国新罕布什尔州汉普顿 型号 12-541B 滑箱 Fisher Scientific,
美国新罕布什尔州汉普顿 编号 03-448-2 避光,保护细胞免受
地层不定损
(根据普遍持有的观点)
并防止荧光
褪色 染 滑台冷却板 克利弗科学公司,
拉格比,英格兰,
英国 CSL-CHILLPLATE 系列 处理皿 克利弗科学公司,
拉格比,英格兰,
英国 STAINDISH4X Tris 碱基 Sigma Aldrich,
密苏里州圣路易斯,
美国 编号 93362 海卫一 X-100 Fisher Scientific,
美国新罕布什尔州汉普顿 型号 BP151-500 胰蛋白酶 EDTA (0.5%) Invitrogen
Gibco,
美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 15400054 垂直滑轨架 克利弗科学公司,
拉格比,英格兰,
英国 康帕克-25

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