所有涉及样本采集的程序均按照本机构的IRB指南进行。
1. 成像质谱(IMS)组织切片的制备
- 人尸体脑组织标本的处理
注意:确保质谱成像(IMS)的样本制备步骤能够保持组织的原始状态。避免污染和死后变化。以下步骤至关重要。
- 从死后8小时内取出、处理并储存在-80 °C的脑组织中获取用于质谱成像(IMS)的人类皮层标本。采集阿尔茨海默病(AD)患者及年龄匹配对照者的枕叶皮层脑组织标本。
- 冷冻组织切片的制备
- 在冷冻切片机上切割组织切片。将导电的氧化铟锡(ITO)涂层载玻片放入冷冻切片机内。
- 在冷冻切片机内将-80 °C保存的尸体脑组织升温至-22 °C。
- 每次实验均使用新的 disposable 刀片,并始终尽量使用刀片的清洁部分。
- 将冷冻的尸体脑组织连同少量最佳切割温度(OCT)包埋剂(足以覆盖切片台中央区域;见 材料表)一起放置于切片台上。
- 选择合适的薄切条件。对于质谱成像(IMS),人脑组织切片厚度应为10–12 μm。若需同时进行质谱成像(IMS)和免疫组织化学(IHC),则从每个组织样本中切取五到六张切片。
- 当刀片刚开始切割组织时,转动轮子“修块”,直至整个组织表面暴露。如果切片上出现轻微条纹或撕裂,应在冷冻切片机中多等待片刻,待温度调整自动修复后再继续。在打开防卷板前,先用组织垫于下方,等待数秒。
- 立即将组织切片转移至载玻片的ITO涂层一侧。通过将手指置于非ITO涂层一侧的载玻片下方使组织轻微解冻,使其牢固贴附于载玻片上;确保组织尽可能平整,无皱褶。此步骤应在室温下进行。
注意:由于人类样本可能含有生物污染物,操作时应佩戴手套、口罩和实验服。当日所有切片完成后,使用实验室擦拭纸和200 mL 100%乙醇清洁冷冻切片机、刷子和夹具。
- 组织切片的漂洗
- 将样本浸入40–100 mL 70%乙醇中30秒,以去除内源性脂质和无机盐。使用玻璃染色缸。
- 依次用40–100 mL 100%乙醇漂洗30秒,40–100 mL Carnoy固定液处理3分钟,40–100 mL 100%乙醇漂洗30秒,40–100 mL 0.1%三氟乙酸(TFA)处理1分钟,再用40–100 mL 100%乙醇漂洗30秒。使用玻璃染色缸。
注意:Carnoy固定液由六份乙醇、三份乙酸和一份氯仿组成。
- 在真空条件下干燥30分钟。
- 使用甲酸蒸气处理组织切片,以提高尸检脑组织中Aβ蛋白的离子化效率
- 准备烘箱和用于后续蒸气处理的玻璃孵育皿,加入5 mL 100%甲酸。为获得理想的酸处理效果,整个过程中应保持孵育玻璃皿内空气湿度处于饱和状态,并将温度维持在60 °C。将组织切片置于孵育玻璃皿中,避免直接浸入甲酸,处理6分钟。
- 使用胶片扫描仪、凝胶成像系统或数字显微镜等设备获取样本的光学图像。 等 此步骤应在室温下进行。当样本靶标被放入仪器时,需对齐样本的光学图像。通常情况下,在基质层下方无法识别组织切片。
注意: 最便捷的获取光学图像的方法是使用办公扫描仪。建议将图像保存至成像数据存储文件夹中。
- 为实现光学图像与样本的对应关系,应在光学图像和相机光学系统下基质层可见的位置制作引导标记。最简便的方法是在拍摄光学图像前,在样本周围至少标记三个修正液点。
- 基质涂布
- 基质溶液的配制
- 在耐有机溶剂的微量离心管中,配制10 mg/mL的芥子酸(SA)溶液,溶剂为50%乙腈(ACN)和0.1% TFA。通过涡旋振荡或短暂超声处理10分钟,充分溶解SA化合物。溶液配制后于室温保存,备用。
注意: 基质喷涂有三种不同方式:使用喷枪、超声喷涂仪或自动喷涂仪。
- 使用喷枪喷涂基质
- 操作应在恒定室温(20–23 °C)和湿度(40%–60%)下进行。为获得最佳喷涂效果,需调节液滴大小、雾化量、喷嘴与组织切片之间的角度和距离,以及实验室温湿度。通过显微镜观察结果来优化上述条件。
注意:影响因素包括基质结晶的大小与覆盖均匀性,以及分析物的非预期迁移/扩散。液滴越小越好,均匀性也是关键检查指标。
- 使用超声喷涂仪喷涂基质
- 将待喷涂的组织从干燥器中取出并放入喷涂室。确保组织未覆盖传感器窗口。
- 按下 开始 按钮启动准备程序;通常准备时间约为90分钟。系统将根据基质层厚度和湿润度自动调节过程。完成后取出载玻片,在MALDI仪器检测前置于干燥器中干燥15分钟。
- 用2–3 mL 100%甲醇(MeOH)清洗喷涂头,直至喷头外观清洁。
注意:基质微滴形成的细雾依靠重力薄膜沉降进入组织。平均液滴大小为20 μm,所有液滴直径均小于50 μm。
- 使用自动喷涂仪喷涂基质
- 使用自动喷涂仪将基质溶液喷涂至组织表面。喷涂过程中同时提供恒定流量的加热鞘气(N2,设定为10 psi和75 °C)。使用溶剂泵系统(设定为10 psi和0.15 mL/min)输送基质溶液。
注意:最重要的是在生物安全柜内操作,避免吸入基质气溶胶。控制实验室温湿度,以重现均匀的基质结晶。
2. 基质辅助激光解吸电离成像质谱
- 进行超高速质谱分析。
- 使用配备10 kHz掺钕钇铝石榴石(Nd:YAG,355 nm)激光器的基质辅助激光解吸电离成像质谱(MALDI-IMS)系统,开展高通量、高空间分辨率的成像实验。
- 在质谱测量过程中,利用MALDI控制软件和数据分析软件定义组织区域。
- 以正离子线性模式采集质谱数据,质荷比(m/z)范围为2,000–20,000,空间分辨率为20和100 µm。
- 配制校准标准品时,将肽段校准标准品与蛋白质校准标准品按1:4的比例溶解于TA30溶液(乙腈:0.1%三氟乙酸 = 30:70)中的α-氰基-4-羟基肉桂酸(CHCA)中,随后稀释10倍。将1 μL校准标准品分别点样于载玻片上四个不同位置。
- 使用分子组织学软件(见 材料表),叠加多个单通道图像,以分析不同信号之间的空间相关性,例如不同Aβ肽在老年斑(SPs)和动脉壁中的共定位情况。