Guest Editors
Venkata Chirasani
The University of North Carolina at Chapel Hill
Chirasani 博士在蛋白质及蛋白质-配体复合物的分子建模与分子动力学（MD）方面具有专长。他通过计算方法研究复杂人类疾病（如癌症和心血管疾病）的病因，以及多种生物过程背后的分子机制。目前他在 Campbell 博士实验室的研究目标是探究生物分子（如 RAS 蛋白、Actin-Vt 和 Actin-MVt 复合物）在空间和时间上的演化过程。
Prasanna Revanasiddappa
Siddaganga Institute of Technology
Prasanna D R 博士是印度图马克鲁 Siddaganga 理工学院生物技术系的副教授。他在分子动力学模拟、计算机辅助药物设计、大数据分析和基因组学领域拥有 12 年的教学经验和 6 年的研究经验。目前，他正积极从事心血管疾病、G-四链体、金属β-内酰胺酶以及 SAICAR 合成酶等领域的研究工作。他主持多项科研资助项目，并在同行评审期刊上发表了多篇论文。目前，在他的指导下，计算生物物理学实验室正在开展以下项目：“胆固醇酯转移蛋白小分子抑制剂的合成、金属离子存在下反平行 G-四链体的稳定化研究”以及“SAICAR 合成酶的结构解析与金属β-内酰胺酶新型抑制策略的揭示”。他的研究团队还致力于探究病毒衣壳在不同环境条件下的行为特征。
Collection Overview
乙型肝炎是由乙型肝炎病毒（HBV）引起的一种慢性病毒感染。全球有超过3亿人感染HBV 并且感染会逐渐导致肝硬化和肝癌死亡。尽管已有多种病毒学和血清学检测方法用于慢性乙型肝炎感染的诊断和治疗，但现有治疗手段仅能抑制病毒复制。因此，迫切需要通过选择不同靶点开发先进的治疗策略以应对乙型肝炎病毒（HBV）感染， 例如病毒酶和衣壳。然而 结构解析技术增进了我们对乙型肝炎病毒（HBV）分子水平结构与功能的理解，但这些实验技术固有的局限性使其未能解析病毒颗粒中具有柔性的部分。
在这一方面，粗粒化（CG）分子动力学模拟已成为研究大型生物分子系统结构与动力学的重要工具。本研究中对完整乙型肝炎病毒（HBV）进行的CG模拟所揭示的关键发现，将用于探索HBV表面的隐匿性口袋/裂隙。我们创新的计算方法将结合实验研究，以针对HBV衣壳上可成药位点设计并验证小分子抑制剂。 将使我们能够探索新型抗乙型肝炎病毒（HBV）治疗药物。