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资料来源:克里斯托弗·科博1,乔纳森·布莱泽1,伊丽莎白·苏特1
1大学生物科学系,瓦格纳学院,1 校园路,纽约州斯塔顿岛,10301
原核细胞能够栖息在这个星球上的几乎每一个环境。作为一个王国,它们具有巨大的代谢多样性,允许它们使用各种各样的分子来产生能量(1)。因此,在实验室中培养这些生物体时,必须在生长培养中提供制造能量所需的所有特定分子。虽然有些生物在代谢上是多种多样的,但其他生物能够在极端环境中生存,如高温或低温、碱性和酸性pH值、减少或缺氧环境,或含有高盐的环境(2,3,4)。这些生物体被称为"嗜血杆菌",它们往往需要这些强烈的环境来增殖。当科学家寻找培育这些生物时,需要考虑到介质成分以及任何特定的环境条件,才能成功地培育出感兴趣的生物体。
科学家能够在实验室中培育出可培养的生物体,因为他们了解这些物种生长所需的具体要求。然而,可养殖生物在估计地球上的物种中所占不到1%(5)。通过基因测序检测到但无法在实验室中生长的生物体被认为是不可培养的(6)。目前,我们对这些生物体的新陈代谢和生长条件了解不够,无法在实验室中复制其环境。
挑剔的有机体位于前两者之间。这些生物是可培养的,但它们需要非常具体的生长条件,如特定的生长介质成分和/或特定的生长条件。这种属的两个例子是Neisseria sp.和血友病,这两个都需要部分分解的红血球(也称为巧克力琼脂),以及特定的生长因子和富含二氧化碳的环境(7)。如果没有所有必需的特定成分,这些生物体将根本不会生长。通常,即使满足所有要求,这些生物体的生长也很差。
与真核细胞不同,真核细胞只能在有氧或含氧环境中生长,而原核细胞则能够利用几种发酵途径进行厌氧生长,从而产生充足的能量(8)。其他原生核生物更喜欢亲微亲氧体,或减少氧气环境,甚至亲亲生物或高二氧化碳环境(9)。这些生物体更难以丰富,因为大气必须改变。经常与对含氧环境敏感的生物体工作的科学家通常会在厌氧室和孵化器中工作,在那里,大量惰性气体(如 argon)被泵送来取代氧气(10)。另一些则利用常规的密封气体包系统,利用水产生氢气和二氧化碳,以及像铂一样的催化剂来去除所有大气中的氧气。这些市售的试剂盒可产生上述任何大气条件(10)。
无论是培养病原体以确定潜在感染,还是希望确定自然环境中存在的特定细菌种类,都存在一个问题。没有一个细菌物种栖息在一个栖息地。细菌作为多细胞群落生活,从人类的皮肤到我们星球的海洋(11)。在试图分离一种细菌时,科学家必须努力排除同样居住在隔离区的其他许多生物。因此,细菌的富集生长介质往往具有两种功能。第一是使媒体有选择性。选择性剂会阻止某些物种生长,同时不抑制甚至经常促进其他物种的生长(12)。介质成分的第二个功能可能是作为差分剂工作。这种制剂可以识别一个孤立的生物体的一个特定的生化特征。通过将几种不同的选择性和差别介质与适当的生长条件配对,科学家和诊断学家能够从特定分离物中识别特定细菌物种的存在。
选择性和差别化介质有助于鉴定的一个例子是临床上重要的有机体金黄色葡萄球菌。这种有机体通常是在曼尼托盐琼脂培养的。这种介质不仅只选择生活在高盐环境中的生物体,其中包括一些克阳性物,如金黄色葡萄球菌,而且还抑制任何对盐敏感的生物体。甘醇糖是这种介质的差分成分。在所有临床上重要的金黄色葡萄球菌物种中,只有S.金黄色葡萄球菌能够发酵曼尼托。这种发酵反应产生酸作为副产品,导致介质中的红色甲基红色指示灯变黄。其他葡萄球菌物种(如金黄色葡萄球菌表皮)虽然能够生长,但会使介质呈红色。
本实验练习演示了适当的无菌技术,以及从肉汤中正确接种生长介质。它还介绍了浓缩介质上常见污染物生物的生长情况,使用气体包厌氧培养系统进行厌氧细菌,以及使用不同的选择性和差分介质对克进行推定鉴定阳性和克阴性细菌。
1. 准备
2. 成长媒体和文化
3. 传播文化和孵化
4. 阅读和录制结果
从沙漠冻土带到热带雨林,细菌几乎能栖息在地球上的每一个环境。这种对不同利基进行殖民的能力,是由于其适应性和巨大的代谢多样性,这使得它们能够利用各种各样的分子来产生能量。正是这种巨大的多样性导致这一现象,地球上不到1%的细菌物种被认为是可培养的,这些只有在了解其特定的代谢和环境需求才有可能。
在实验室中操作介质和环境,不仅使研究人员能够进行实验,找到培育感兴趣的物种的最佳条件,而且还使丰富性、不断变化的条件选择过程混合文化的特定物种。一些微生物物种是通才,能够容忍各种各样的状态或环境。这种生物体在实验室条件下可能很容易生长,但如果有极端的栖息地,它们也可能被阻止生长,如果目标是使混合培养体能够适应这种条件而富于生物体,这会有所帮助。
挑剔的生物体是可培养的,但只有当满足特定条件时。例如,奈瑟里亚或血友病物种需要含有部分分解红血球和高二氧化碳浓度的介质,这也可能阻碍其他物种的生长。极恋人因其对极端条件的偏好而得名,例如极低或高温、缺氧或缺氧条件,或存在高盐。这些情况可能是不能容忍的大多数其他微生物。
为了进一步丰富感兴趣的生物体,一些介质类型包含指标,使洞察生物体的新陈代谢。曼尼托盐Agar抑制对高盐敏感的生物体的生长。革兰氏阴性细菌通常无法存活,但克氏阳性葡萄球菌属能够茁壮成长。此外,MSA琼脂表示任何菌落能够发酵曼尼醇,因为发酵的酸副产品将介质中的甲基红色指示器变为亮黄色。这可以允许更具体的物种选择。
另一种常见的浓缩介质,Eosin亚甲蓝,含有eosin和亚甲蓝染料,对克阳性生物有毒。它还含有乳糖和细菌在这些板,可以发酵这将产生酸,降低pH,鼓励染料吸收。这些菌落占用大量的色素,并出现黑暗和金属。在这个实验室中,您将在三种不同的介质条件下生长四种不同的测试生物,然后在有氧与厌氧条件下生长,然后观察它们的发展。
在开始实验之前,请彻底洗手并擦干,然后戴上适当尺寸的实验室手套。然后用5%的漂白剂对工作面进行消毒,彻底擦拭。接下来,采取无菌接种回路,并将其处理到一个空的125毫升烧瓶,以便它不接触工作台表面。然后,从冰箱中收集四盘曼尼托盐Agar,或MSA,四盘Eosin甲基蓝琼烷,EMB,和八个试吃大豆Agar,或TSA,板。TSA介质是一种非选择性生长介质,将用于两种不同的环境条件。最后,在管架中收集您感兴趣的文化。在这里,大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、金黄色葡萄球菌表皮和蛋白石等将生长。
首先,点燃一个Bunsen燃烧器,用于对工具进行消毒。然后,将一个 MSA 板、一个 EMB 板和两个 TSA 板放在手边。然后,选择一种细菌培养物。您将用第一种文化为这四个板块接种。用你的自由手,拿起接种回路,然后在燃烧器的火焰中消毒,直到它发出橙色几秒钟。让回路在空气中冷却。然后,打开汤培养管,迅速火焰打开。将环浸入培养物中,然后将有机体条纹到第一个板的第一象限上。然后火焰再次消毒循环,并条纹第二象限。重复火焰灭菌的这个动作,然后条纹完成第三和第四象限。以这种方式进行破坏应能给孤立的殖民地,并允许确认文化没有受到污染。
现在,更换盖子,用细菌名称、介质类型、日期和首字母缩写标记板的底部。然后,对其余三个板中的每一个使用相同的细菌培养物重复条纹电镀,每次注意标记它们。现在,第一个培养基已经条纹,重复这些步骤,让其他细菌获得一个接种的MSA板,一个EMB板,和两个TSA板为每个物种。一旦所有生物体被转移,最后一次点燃环。
为了确定哪些生物可以在减少的氧气环境中生长,打开一个密封的气室系统,并在内部放置一组四个TSA细菌板。然后,将厌氧条件小袋放入腔室,并密封。最后,将所有板,包括密封气室系统内的板,放入37摄氏度的培养箱过夜。今后,每24至48小时检查一次板,给菌落时间生长和代谢任何指标反应物。
为了评估不同细菌物种对每种生长条件的反应如何,首先检查板块的生长情况,并记录哪些物种能够在每个介质类型和厌氧与有氧条件下产生菌落。注意生长的生物体的颜色以及菌落的大小和形状。
曼尼托盐琼脂培养基是选择性的克阳性生物,能够生存在6。5%氯化钠。在这个实验中,这意味着克阴性大肠杆菌和P.p.低度没有增长,由于高盐浓度。S. 表皮和 S. aureus 能够生长,但是,确认它们是克阳性。此外,这两个物种之间有明显的区别,因为由于发酵的酸副产品,S. aureus能够发酵曼尼醇,将介质中的甲基红色指示器变成亮黄色。这在S.表皮的案例中是看不到的。
另一方面,EMB介质对克阴性生物体是选择性的,因为eosin和亚甲蓝染料对克阳性细胞有毒。克氏阴性细菌的外膜阻止这些有毒染料进入细胞,这意味着它们能够生长。此外,这种培养基表明目前的细菌物种是否能够发酵乳糖。在这里,大肠杆菌菌落变成深紫色,有时与绿色金属光泽指示发酵。P. vulgaris生长在这种介质上,但不发酵乳糖,因此在染料的存在下出现浅粉色到紫色。在厌氧条件下,TSA介质上的细菌种类仍应生长,但与含氧量充足的细菌相比,可能增长得很差。这是因为没有一个试验物种是义务的厌食动物。
像这样的实验,以丰富生长环境可以帮助青睐和分离一个特定物种从混合样本。它们还有助于确定不同细菌物种在实验室环境中的最佳生长条件,从而有助于进一步研究。
细菌几乎能够栖息在地球上的所有环境中,从沙漠苔原到热带雨林。这种在截然不同的生态位中定植的能力是由于它们的适应性和巨大的代谢多样性,这使它们能够利用多种分子来产生能量。正是这种巨大的多样性导致了地球上只有不到 1% 的细菌物种被认为是可培养的现象,而这些只有在了解它们特定的代谢和环境需求的情况下才有可能。
在实验室中对培养基和环境进行作,不仅可以让研究人员通过实验找到培养目标物种的最佳条件,还可以进行富集,即改变条件以从混合培养物中选择特定物种的过程。一些微生物物种是多面手,能够耐受各种状态或环境。这种生物体在实验室条件下可能很容易生长,但如果给予极端的栖息地,它们也可能被阻止生长——如果目标是丰富来自混合培养物的对这种条件有耐受性的生物体,这会有所帮助。
挑剔的生物体可以培养,但前提是满足特定条件。例如,奈瑟菌或嗜血杆菌物种需要含有部分分解的红细胞和高二氧化碳浓度的培养基,这也可能会阻碍其他物种的生长。极端微生物因其对极端条件的偏好而得名,例如极低或高温、还原或缺氧条件,或存在高盐的情况。大多数其他微生物可能无法忍受这些情况。
为了进一步富集感兴趣的生物体,一些培养基类型包含指标,这些指标可以深入了解生物体的代谢情况。甘露醇盐琼脂抑制对高盐敏感的生物体的生长。革兰氏阴性菌通常无法存活,但革兰氏阳性葡萄球菌属能够茁壮成长。此外,MSA 琼脂表示任何能够发酵甘露醇的菌落,因为发酵的酸副产物会将培养基中的甲基红指示剂变成亮黄色。这可以允许对物种进行更具体的选择。
另一种常见的富集培养基 Eosin Methylene Blue 含有伊红和亚甲蓝染料,它们对革兰氏阳性菌有毒。它还在这些板上含有乳糖和细菌,这些细菌可以发酵,从而产生酸,从而降低 pH 值,促进染料吸收。这些菌落吸收大量色素,呈现深色和金属色。在这个实验室中,您将在三种不同的培养基条件下培养四种不同的测试生物体,然后在好氧与厌氧条件下培养,然后观察它们的发育。
在开始实验之前,请彻底洗手并擦干双手,然后再戴上合适尺寸的实验室手套。然后,用 5% 的漂白剂对工作台面进行消毒,彻底擦拭。接下来,取无菌接种环并将其手柄放入 125 毫升空烧瓶中,使其不接触工作台表面。然后,从冰箱中取出四盘甘露醇盐琼脂 (MSA)、四盘伊红亚甲蓝琼脂 EMB 和八盘胰蛋白酶大豆琼脂 (TSA)。TSA 培养基是一种非选择性生长培养基,将用于两种不同的环境条件。最后,将您感兴趣的培养物收集在管架中。在这里,将生长大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌和普通变形杆菌。
首先,点燃一个本生灯,它将用于对工具进行消毒。然后,将一个 MSA 板、一个 EMB 板和两个 TSA 板放在手边。然后,选择一种细菌培养物。您将用第一次培养物接种所有这四个板。用另一只手拿起接种环,然后在燃烧器的火焰中消毒,直到它发出橙色光几秒钟。让 loop 在空气中冷却。然后,打开肉汤培养管并快速点燃开口。将环浸入培养物中,然后将生物体划线到第一个板的第一个象限上。然后再次对环进行火焰消毒并在第二象限划线。重复这个火焰灭菌然后划线的动作,完成第三象限和第四象限。以这种方式划线应产生孤立的菌落,并且还可以确认培养物未被污染。
现在,盖上盖子,并在板底部贴上细菌名称、培养基类型、日期和您的姓名首字母。然后,对其余三个板中的每一个使用相同的细菌培养物重复条纹电镀,每次都注意标记它们。现在第一次培养物已经划线,对其他细菌重复这些步骤,以获得每个物种的一个接种的 MSA 板、一个 EMB 板和两个 TSA 板。转移完所有生物后,最后一次点燃 Loop。
要确定哪些生物体可以在低氧环境中生长,请打开密封的气室系统,并在其中放置一组四个 TSA 细菌板。然后,将厌氧条件小袋放入腔室中并密封。最后,将所有板(包括密封气室系统内的板)放入 37 摄氏度的培养箱中过夜。今后,每 24 到 48 小时检查一次平板,让菌落有时间生长和代谢任何指示反应物。
为了评估不同细菌种类对每种生长条件的反应如何,首先检查平板的生长情况,并记录哪些物种能够在每种培养基类型以及厌氧与需氧条件下产生菌落。注意生长的生物体的颜色以及菌落的大小和形状。
甘露醇盐琼脂培养基对革兰氏阳性微生物具有选择性,能够在 6.5% 氯化钠。在本实验中,这意味着革兰氏阴性大肠杆菌和寻常假单胞菌由于盐浓度高而没有生长。然而,表皮链球菌和金黄色葡萄球菌能够生长,证实它们是革兰氏阳性。此外,这两个物种之间存在明显差异,因为金黄色葡萄球菌能够发酵甘露醇,由于发酵的酸副产物,将培养基中的甲基红指示剂变成亮黄色。这在 S. epidermis 的情况下没有看到。
另一方面,EMB 培养基对革兰氏阴性菌具有选择性,因为伊红和亚甲蓝染料对革兰氏阳性细胞有毒。革兰氏阴性菌的外膜阻止这些有毒染料进入细胞,这意味着它们能够生长。此外,该培养基表明存在的细菌种类是否能够发酵乳糖。在这里,大肠杆菌菌落变成深紫色,有时带有绿色金属光泽,表明发酵。P. vulgaris 在这种培养基上生长,但不发酵乳糖,因此在染料存在下呈现浅粉红色至紫色。在厌氧条件下,TSA 培养基上的细菌种类仍应生长,但与氧气充足的细菌相比,生长速度可能非常差。这是因为没有一个测试物种是专性厌氧菌。
像这样丰富生长环境的实验有助于从混合样品中支持和分离特定物种。它们还可以帮助确定实验室环境中不同细菌物种的最佳生长条件,从而有助于进一步研究。
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