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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Präsentiert hier ist ein Protokoll für die spontane Erzeugung von Neurosphären in neuronalen Vorläuferzellen aus hochdichten plattierten Neuronen angereichert. Während des gleichen Experiments, wenn Neuronen mit einer niedrigeren Dichte plattiert werden, führt das Protokoll auch zu verlängerten primären Rattenneuronkulturen.
Primäre Neuronenkultur ist eine wesentliche Technik auf dem Gebiet der Neurowissenschaften. Um tiefere mechanistische Einblicke in das Gehirn zu gewinnen, ist es wichtig, ein robustes In-vitro-Modell zu haben, das für verschiedene neurobiologische Studien genutzt werden kann. Obwohl primäre Neuronenkulturen (d.h. langfristige Hippocampuskulturen) Wissenschaftlern Modelle geliefert haben, stellt sie die Komplexität des Gehirnnetzwerks noch nicht vollständig dar. Im Gefolge dieser Einschränkungen ist ein neues Modell entstanden, das Neurosphären verwendet, die eine engere Ähnlichkeit mit dem Gehirngewebe aufweisen. Das vorliegende Protokoll beschreibt die Beschichtung von hohen und niedrigen Dichten gemischter kortikaler und hippocampaler Neuronen, die aus dem Embryo des embryonalen Tages 14-16 Sprague Dawley Ratten isoliert wurden. Dies ermöglicht die Erzeugung von Neurosphären und langfristige primäre Neuronenkultur als zwei unabhängige Plattformen, um weitere Studien durchzuführen. Dieser Prozess ist extrem einfach und kostengünstig, da er mehrere Schritte und Reagenzien minimiert, die bisher als wesentlich für die Neuronenkultur galten. Dies ist ein robustes Protokoll mit minimalen Anforderungen, das mit erreichbaren Ergebnissen durchgeführt und weiter für eine Vielzahl von Studien im Zusammenhang mit Neurowissenschaften verwendet werden kann.
Das Gehirn ist eine komplizierte Schaltung von neuronalen und nicht-neuronalen Zellen. Seit Jahren versuchen Wissenschaftler, Einblicke in diese komplexe Maschinerie zu gewinnen. Dazu griffen Neurowissenschaftler zunächst zu verschiedenen transformierten nervenbasierten Zelllinien für Untersuchungen. Jedoch, die Unfähigkeit dieser klonalen Zelllinien starke synaptische Verbindungen und richtige Axone oder Dendriten haben wissenschaftliches Interesse an primären Neuronenkulturen verschoben1,2. Der aufregendste Aspekt der primären Neuronenkultur ist, dass es eine Gelegenheit schafft, lebende Neuronen zu beobachten und zu manipulieren3. Darüber hinaus ist es weniger komplex im Vergleich zu Neuronengewebe, was es zu einem idealen Kandidaten für die Untersuchung der Funktion und des Transports von verschiedenen neuronalen Proteinen macht. In jüngster Zeit haben mehrere Entwicklungen in den Bereichen Mikroskopie, Genomik und Proteomik neue Möglichkeiten für Neurowissenschaftler geschaffen, Neuronenkulturen auszunutzen4.
Primäre Kulturen haben es Neurowissenschaftlern ermöglicht, die molekularen Mechanismen hinter der neuronalen Entwicklung zu erforschen, verschiedene neuronale Signalwege zu analysieren und ein kohärenteres Verständnis der Synapse zu entwickeln. Obwohl eine Reihe von Methoden Kulturen aus primären Neuronen berichtet haben (meist aus dem hippocampalen Ursprung5,6,7), ist ein einheitliches Protokoll mit einem chemisch definierten Medium, das eine langfristige Kultur von Neuronen ermöglicht, noch benötigt werden. Jedoch, Neuronen mit geringer Dichte plattiert werden am häufigsten beobachtet, die nicht langfristig überleben, wahrscheinlich aufgrund des Mangels an trophischen Unterstützung 8, die von den benachbarten Neuronen und Gliazellen zur Verfügung gestellt wird. Einige Methoden haben sogar vorgeschlagen, die primären Neuronen mit Gliazellen zu kultivieren, wobei die Gliazellen als Feederschicht9verwendet werden. Jedoch, Gliazellen stellen eine Menge Probleme aufgrund ihrer Überwucherung, die manchmal das neuronale Wachstum überschreiben10. Unter Berücksichtigung der oben genannten Probleme ist daher ein einfacheres und kostengünstigeres primäres neuronales Kulturprotokoll erforderlich, das sowohl von Neurobiologen als auch von Neurochemikern für Untersuchungen verwendet werden kann.
Eine primäre Neuronenkultur ist im Wesentlichen eine Form der 2D-Kultur und stellt nicht die Plastizität, räumliche Integrität oder Heterogenität des Gehirns dar. Dies hat dazu geführt, dass ein glaubwürdigeres 3D-Modell namens Neurosphären11,12benötigt wird. Neurosphären stellen Neurowissenschaftlern eine neue Plattform dar, mit einer engeren Ähnlichkeit mit dem realen, in vivo Gehirn13. Neurosphären sind nicht anhaftende 3D-Cluster von Zellen, die reich an neuronalen Stammzellen (NSCs), neuronalen Vorläuferzellen (NPCs), Neuronen und Astrozyten sind. Sie sind eine ausgezeichnete Quelle für die Isolierung von neuronalen Stammzellen und neuronalen Vorläuferzellen, die verwendet werden können, um Die Differenzierung in verschiedene neuronale und nicht-neuronale Linien zu untersuchen. Auch hier stellt die Variabilität innerhalb der Neurosphärenkulturen, die mit den zuvor gemeldeten Protokollen erzeugt werden, ein Hindernis für die Formulierung eines einheitlichen Neurosphärenkulturprotokolls14dar.
Dieses Manuskript stellt ein Protokoll dar, in dem es möglich ist, sowohl 2D- als auch 3D-Plattformen zu erzeugen, indem Zellverdichtungen aus einer gemischten kortikalen und hippocampalen Kultur abwechselnd werden. Es wird beobachtet, dass innerhalb von 7 Tagen frei schwebende Neurosphären aus hochdichten, plattierten Neuronen gewonnen werden, die aus dem E14-E16 Sprague Dawley Ratte Embryo isoliert sind, die nach weiterer Kultur Brücken und Verbindungen durch radiale glialartige Erweiterungen bilden. In ähnlicher Weise wird in den niedrigdichten, plattierten Neuronen eine primäre Neuronenkultur erhalten, die bis zu 30 Tage lang aufrechterhalten werden kann, indem das Pflegemedium zweimal pro Woche gewechselt wird.
Alle experimentellen Verfahren mit Tieren wurden von der Institutional Animal Ethics Committee of CSIR-Indian Institute of Chemical Biology (IICB/AEC/Meeting/Apr/2018/1) genehmigt.
1. Reagenz- und Medienzubereitung
2. Herstellung von Deckellipsen
3. Herstellung von Poly-D-Lysin beschichteten Platten für die Neuronenkultur
4. Entfernung und Enthauptung des Fötus
HINWEIS: Sterilisieren Sie alle chirurgischen Instrumente, die in Aluminiumfolie in einem Autoklaven verpackt sind, bei 121 °C (15 psi) für 30 min. Dazu gehören eine stumpfe Endschere, Zange, feine Zange, zwei feine Schere und eine Arteriezange für den gesamten Eingriff.
5. Entfernung des Gehirns und Zerlegung des Kortex mit Hippocampus
6. Dissoziation von kortikalem und hippocampalem Gewebe in einzelne Neuronen
In diesem Protokoll wurde eine einfache Strategie erläutert, bei der variable Zellbeschichtungsdichten von zwei verschiedenen neuronalen Screening-Plattformen erhalten werden. Abbildung 1A,B zeigt die Adhärenz von Zellen nach 4 h Der Beschichtung der Neuronen in hoch- bzw. niedrigdichten plattierten Zellen. Bei Der Beobachtung der korrekten Einhaltung der Neuronen gemäß Abbildung 1wurde das Beschichtungsmedium durch ein Pflegemedium in jedem der Brunnen ersetzt und damit bei 37 °C zum Inkubator zurückgeführt. Vergleichsweise mehr Zelladhärenz wurde in den hochdichten, verdichteten Neuronen beobachtet. Nach 24 h Beschichtung zeigten sowohl hoch- als auch niedrigdichte plattierte Neuronen aufwendige neuronale Erweiterungen und synaptische Verbindungen, wie in den Differential Interferenzkontrast(DIC)-Bildern in Abbildung 2A,Bbeobachtet.
In Abbildung 3Awird ein Phasenkontrastbild der niederdichten, verdichteten Neuronen nach 7 Tagen in der Kultur dargestellt. Hier haben die Neuronen ein ausgeklügeltes synaptisches Netzwerk entwickelt, das aus dendritischen Zweigen besteht. Diese Neuronen können für bis zu 30 Tage weiter gepflegt werden, indem das Pflegemedium alle 3 Tage mit der Entwicklung von komplizierteren neuronalen Netzwerken geändert wird. In Abbildung 3B,Cwurde eine immunzytochemische Färbung durchgeführt, um die neuronale Natur von Neuronen mit niedriger Dichte zu offenbaren, indem sie mit neuronalen Markern Tuj1 (ein Marker differenzierter Neuronen)21 und Tau (ein Marker von Axonen) gefärbt wurden22 , bzw. Die rote Farbe in Abbildung 3B zeigt das Vorhandensein von Tuj1-Färbung an, und Grün in Abbildung 3C stellt Färbung in den Axonen der primären Neuronen dar. Die Reinheit der neuronalen Kultur zeigt sich in der Abwesenheit von Färbungen von nicht-neuronalen Markern für GFAP von Astrozyten (Abbildung 3D) und O4 von Oligodendrozyten (Abbildung 3E). Die blau dargestellten Kerne waren mit Hoechst 33258 befleckt.
Die hochdichten, plattierten Neuronen nach 7 Tagen sind durch die Bildung spontanerNeurosphären gekennzeichnet, wie in Abbildung 4A,B,C,Dbeobachtet. Nach 8-10 Tagen wurden verschiedene Brücken, die aus radialen glialen Erweiterungen bestehen, zwischen Neurosphären beobachtet, wie in Abbildung 4Ezu sehen ist. Die Neurosphären waren reich mit NPCs ausgestattet, die die Marker Nestin und Tuj123koexpressen. Die Neurospehere zeigen eine positive Färbung von Nestin und Tuj, wie in Abbildung 524dargestellt. Die blau dargestellten Kerne waren mit Hoechst 33258 befleckt. Diese Neurosphären können mehrere Wochen lang aufrechterhalten werden, indem sie in ultraniedrigen Befestigungsplatten kultiviert werden. In Abbildung 6wurde die Langlebigkeit der für etwa 30 Tage kultivierten Neuronen bewertet, und die Zelllebensfähigkeit wurde in einem Intervall von 5 Tagen mit dem herkömmlichen MTT [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-Diphenyltetrazoliumbromid]-Assay gemessen, in dem es fand heraus, dass die Neuronen auch nach 30 Tagen Kultur mehr als 90% Lebensfähigkeit zeigten.
Als nächstes wurde der Anteil der Astrozyten in den Kulturen mit hoher und niedriger Dichte bewertet. Da diese Methode in erster Linie auf die Kultivierung von Neuronen abzielt, war es wichtig zu beurteilen, ob diese Methode das bevorzugte Wachstum von Neuronen gegenüber nicht-neuronalen Zellen, insbesondere Astrozyten, unterstützt. Das Vorhandensein einer Population von Astrozyten wurde in der Neurosphärebildenden Kultur mit hoher Dichte beobachtet, die durch die grüne Farbe der GFAP-Färbung in Abbildung 7Agekennzeichnet ist; Im Vergleich zur Tuj1(rot)-gefärbten neuronalen Population wurde jedoch deutlich weniger beobachtet. Dies wurde auch durch die quantitativen Daten in Abbildung 7Bbestätigt, in denen 17% der Zellpopulationen GFAP-exzessient waren, verglichen mit 83% der Population in Tuj1-exemitten Zellen.
Die astrozytische Population wurde auch durch GFAP-Färbung untersucht, im Vergleich zur neuronalen Population (Tuj1 Färbung) in samenarmen Zellen mit geringer Dichte, für 7 kontinuierliche Tage. Obwohl ein signifikanter Unterschied in der Gesamtzellzahl im Laufe von 7 Tagen nicht beobachtet wurde, aufgrund der geringen Aussaat, wurde auch die Astrozytenpopulation als sehr gering (fast keine oder sehr niedrige GFAP-Färbung) beobachtet, wobei die Mehrheit die neuronale Population (sehr hohen Tuj1-Ausdruck) wie in Abbildung 8Abeobachtet.
Wie in Abbildung 8Bdargestellt, wurde eine quantitative Analyse durchgeführt, indem die Population von Astrozyten und Neuronen, die durch Mikroskopie mit Hilfe der CellSens-Software gewonnen wurden, gezählt wurde, bei der zunächst nur 2 %-3% der Astrozytenpopulation beobachtet wurden. Aufgrund des Mangels an geeigneten Medien und Nährstoffen, um sein Wachstum zu unterstützen, ging diese Population von Astrozyten auch langsam im Laufe der Zeit zugrunde, während in Gegenwart von optimalen Faktoren und Medien, die Neuronen schnell die gesamte Kultur übernahmen.
Wie in Abbildung 9dargestellt, wurde beobachtet, dass aufgrund der Anwesenheit von NPCs die Neurosphären auch hohe Mengen an Astrozyten ausdrückten, die durch das starke grüne Signal der GFAP-Färbung zusammen mit einem stärkeren Tuj1-Signal gekennzeichnet waren. Schließlich, um zu beobachten, ob diese Neurosphären im Laufe der Zeit erweitert, nach 1 Woche der Hochdichte Kultur, an dem Punkt begann die kleinen Neurosphären zu bilden begann, wurden einige in ultra-niedrigen Befestigungsplatten übertragen und ihr Wachstum wurde alle 5 Tage für bis zu 15 Tage.
Ein Leben/Totzell-Test wurde auch mit Calcein AM (grün) und Propidiumjodid (rot) durchgeführt, um die Gesundheit der Zellen zu überprüfen. Es wurde beobachtet, dass die expandierenden Neurosphären eine große Menge an grüner Fluoreszenz ohne rote Färbung zeigten, was darauf hindeutet, dass in den Neurosphären mindestens bis zu 15 Tage in der Kultur ein Tod auftritt, wie in Abbildung 10Adargestellt. Wie in Abbildung 10Bdargestellt, wurde die voluminöse Ausdehnung der Neurosphären an allen 5 Tagen in der Kultur für bis zu 15 Tage beobachtet. Um das Liniendiagramm darzustellen, das die letztendliche Zunahme des Volumens von Neurosphären (für jeden Zeitpunkt) darstellt, wurden 50 Neurosphären untersucht, und ihre Durchschnittswerte wurden verwendet, um die Neurosphärenvolumina zu jedem Zeitpunkt abzuleiten.

Abbildung 1 : Darstellung der Zellhaftung nach 4 h Beschichtung. (A) Zellhaftung in hochdichten Neuronen. (B) Zellhaftung in niederdichten neuronen. Die Maßstabsleiste in (A,B) beträgt 200 m. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2 : Zellmorphologie von Neuronen nach 24 h Beschichtung. (A) Zellmorphologie der hochdichten neuronenden Neuronen. (B) Zellmorphologie von niederdichten neuronenden Neuronen. Maßstabsbalken in (A, B) stellen 20 m dar. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3 : Morphologie und Charakterisierung von niedrigdichten, verdichteten Neuronen nach 7 Tagen. (A) Phasenkontrastbild von Neuronen, die eine ausgedehnte Keimung zeigen. Maßstabsleiste steht für 200 m. Overlay-Bilder, die den Ausdruck für neuronale Proteine zeigen (B) Tuj1 (rot) und (C) tau (grün). Die Immnunozytochemie zeigt deutlich das Fehlen von Färbung in nicht-neuronalen Proteinen (D) GFAP (grün) und (E) O4 (rot). Nuclei wurden mit Hoechst 33258 (blau) befleckt. Maßstabsbalken in (B, C, D, E) stellen 20 m dar. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4 : Bildung von Neurosphären in hochdichten, plattierten Neuronen nach 7 Tagen. (A-D) Spontan erzeugte Neurosphären nach 7 Tagen in der Kultur aus den hochdichten, plattierten Neuronen. (E) Bildung von radialen glialartigen Erweiterungen zwischen zwei neu gebildeten Neurosphären, wie durch schwarze Pfeile angezeigt. Maßstabsbalken in (A, B, C, D, E) stellen 200 m dar. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 5 : Charakterisierung der erhaltenen Neurosphären. Overlay-Bild der Neurosphären, die die Expression des neuronalen Proteins Tuj1 (rot) und des neuronalen Stammzellmarkers Nestin (grün) zeigen, was auf eine NPC-reiche Population hinweist. Nuclei wurden mit Hoechst 33258 (blau) befleckt. Die Maßstabsleiste steht für 20 m. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 6 : Zelllebensfähigkeit von Primärneuronen. Das Stabdiagramm stellt die Zelllebensfähigkeit der primären Neuronen dar, die mit einem MTT-Assay für bis zu 30 Tage in Abständen von 5 Tagen bewertet werden. Fehlerleiste stellt SD des Wertes (*p < 0,05) dar. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 7 : Charakterisierung von neurosphärenbildenden Hochdichtekulturen mit neuronaischem Marker Tuj1 und Astrozytenmarker GFAP. (A) Das Bild zeigt hochdichte Samenzellen (im DIC-Modus), die Neuropshere erzeugen, die sowohl GFAP (für Astrozyten) als auch Tuj1 (für Neuronen) exezieren. Nuclei wurden mit Hoechst 33258 befleckt. Der Maßstabsbalken stellt 20 m (B) Balkendiagramm e.V. für den Prozentsatz der Population von Tuj1-exezierenden Zellen und GFAP-exezierenden Zellen in der Neurosphäre dar, die Zellen mit hoher Dichte erzeugen. Fehlerleiste steht für SD (*p < 0.05). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 8 : Charakterisierung von plattierten Zellen mit geringer Dichte für die primäre Neuronenkultur mit neuronagem Marker Tuj1 und Astrozytenmarker GFAP kontinuierlich bis zu 7 Tage. (A) Das Bild zeigt die zellenschwachen Samen in vier verschiedenen Kanälen (z.B. DIC, blauer Kanal [zeigt kerntechnische Färbung durch Hoechst 33258], grüner Kanal [GFAP-Färbung] und roter Kanal [für Tuj1-Färbung]) 7 Tage ununterbrochen. Der Maßstabsbalken stellt 20 m (B) Das Balkendiagramm stellt das prozentuale Verhältnis der Populationen von Tuj1-exemitten Zellen zu dem von GFAP-exemitten Zellen in den Samenzellen mit niedriger Dichte für die primäre Neuronenkultur für 7 Tage dar. Fehlerleiste steht für SD (*p < 0.05). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 9 : Immunostainierung von erhaltenen Neurosphären mit GFAP und Tuj1. Bilder der erhaltenen Neurosphären sind (A) im DIC-Modus, (B) Kernfärbung mit Hoechst 33258, (C) Astrozytenmarker GFAP (grün) und (D) neuronalen Marker Tuj1 (rot). Die Maßstabsleiste steht für 20 m. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 10 : Wachstum und Leben/Tote Zell-Assay von Neurosphären über 15 Tage. (A) Das Bild zeigt das Wachstum einer Neurosphäre über 15 Tage im 5-Tage-Rhythmus im DIC-Modus sowie deren Färbung mit Calcein AM (grün zeigt lebende Zellen) und PI (Propidiumjodid mit roter Farbe zeigt abgestorbene Zellen). Maßstabsbalken steht für 20 m. (B) Diagramm stellt die Zunahme der Größe von Neurosphären dar, die in Niedrighaftungsplatten über einen Zeitraum von 15 Tagen in 5-Tage-Intervallen angebaut werden. Fehlerleiste steht für SD. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Die Autoren erklären keine konkurrierenden finanziellen Interessen.
Präsentiert hier ist ein Protokoll für die spontane Erzeugung von Neurosphären in neuronalen Vorläuferzellen aus hochdichten plattierten Neuronen angereichert. Während des gleichen Experiments, wenn Neuronen mit einer niedrigeren Dichte plattiert werden, führt das Protokoll auch zu verlängerten primären Rattenneuronkulturen.
Wir danken CSIR-IICB Tieranlage. G. D. dankt ICMR, J. K. und V. G. danken DST Inspire und D. M. bei DBT, Indien für ihre Stipendien. S. G. würdigt SERB (EMR/2015/002230) Indien für die finanzielle Unterstützung.
| Anti-GFAP | Abcam | AB7260 | |
| Anti-Nestin | Abcam | AB92391 | |
| Anti-O4 | Millipore | MAB345 | |
| Anti-Tau | Abcam | AB76128 | |
| Anti-Tuj1 | Millipore | MAB1637 | |
| B27 Serum Free Supplement | Gibco | 17504-044 | |
| Cell Counter | Life technologies | Countess II FL | |
| CO2 Inkubator | Eppendorf | Galaxy 170 R | |
| D-Glukose | SDFCL | 38450-K05 | |
| Ethanol | Merck Millipore | 100983 | |
| Fluoreszenzmikroskop | Olympus | IX83 Modell | |
| Formaldehyd | Sigma Aldrich | 47608 | |
| GlutaMax-I Ergänzung | Gibco | 35050-061 | |
| GtXMs IgG Fluor | Millipore | AP1814 | |
| GtXMs IgG (H+L) | Millipore | AP124C | |
| HEPES | SRL | 16826 | |
| Hoechst 33258 | Calbiochem | 382061 | |
| Pferdeserum | HiMedia | RM10674 | |
| Salzsäure | Rankem | H0100 | |
| Laminar Hood | BioBase | BBS-V1800 | |
| MEM Eagle' s mit Earle" s BSS | Sigma Aldrich | M-2279 | |
| Mikroskop | Dewinter | Victory Modell | |
| Neurobasales Medium | Gibco | 21103-049 | |
| Kunststoffe (24-Well-Platten, Zellsiebe und Platten mit geringer Adhärenz) | BD Falcon | 353047, 352350 und 3471 | |
| 90 mm Petrischalen | Himedia | PW001 | |
| Penicillin/Streptomycin | Gibco | 15140-122 | |
| Poly-D-Lysin | Millipore | A.003.E | |
| Kaliumchlorid | Fisher Scientific | BP366-500 | |
| Kaliumphosphat monobasisch | Merck | MI6M562401 | |
| Natriumchlorid | Qualigem | 15918 | |
| Natriumphosphat dibasisch | Merck | MI6M562328 | |
| Stereomicrosope | Dewinter | Zoomstar Modell | |
| Triton-X 100 | SRL | 2020130 | |
| Trypanblau Lösung | Gibco | 15250-061 | |
| 0,25 % Trypsin-EDTA | Gibco | 25200-072 |