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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Dendritische Stacheln sind wichtige zelluläre Merkmale des Nervensystems. Hier werden bildgebende Verfahren zur Beurteilung der Struktur und Funktion von dendritischen Dornen in C. elegans beschrieben. Diese Ansätze unterstützen die Entwicklung von mutierten Screens für Gene, die die Form oder Funktion der dendritischen Wirbelsäule definieren.
Dendritische Dornen sind spezialisierte Orte der synaptischen Innervation, die durch Aktivität moduliert werden und als Substrate für Lernen und Gedächtnis dienen. Kürzlich wurden dendritische Dornen für DD GABAerge Neuronen als Eingangsstellen von präsynaptischen cholinergen Neuronen im motorischen Kreislauf von Caenorhabditis elegans beschrieben. Dieser synaptische Schaltkreis kann nun als leistungsfähiges neues In-vivo-Modell der Wirbelsäulenmorphogenese und -funktion dienen, das die einfache Genetik und leichte Zugänglichkeit von C nutzt. Elegans zur Bildgebung lebender Zellen.
Dieses Protokoll beschreibt experimentelle Strategien zur Beurteilung der Struktur und Funktion der DD-Wirbelsäule. Bei diesem Ansatz wird eine hochauflösende Bildgebungsstrategie verwendet, um die komplizierten Formen aktinreicher dendritischer Dornen zu visualisieren. Um die DD-Wirbelsäulenfunktion zu bewerten, stimuliert das lichtaktivierte Opsin Chrimson die präsynaptischen cholinergen Neuronen, und der Kalziumindikator GCaMP berichtet über die evozierten Kalziumtransienten in postsynaptischen DD-Stacheln. Zusammen umfassen diese Methoden leistungsfähige Ansätze zur Identifizierung genetischer Determinanten von dendritischen Dornen in C. elegans , die auch die Morphogenese und Funktion der Wirbelsäule im Gehirn steuern könnten.
Dendritische Dornen sind spezialisierte Zellstrukturen, die von benachbarten Neuronen für die synaptische Übertragung Input erhalten. Die Aktivierung von Neurotransmitterrezeptoren erhöht intrazelluläres Kalzium und nachgeschaltete Signalwege in diesen charakteristischen neuronalen Vorsprüngen1. Aufgrund der fundamentalen Bedeutung der dendritischen Dornen für die Neurotransmission und ihrer Fehlregulation bei neurologischen Entwicklungserkrankungen1 ist die Entdeckung von Faktoren, die die Morphogenese und Funktion der dendritischen Wirbelsäule modulieren, für die Neurowissenschaften von großem Interesse.
Kürzlich wurden dendritische Stacheln im Nervensystem von C. elegans identifiziert, basierend auf Schlüsselmerkmalen, die mit Säugetierstacheln geteiltwerden 2. Diese Bestimmung ist entscheidend, weil sie die Möglichkeit eröffnet, die Vorteile von C. elegans für die Erforschung der Wirbelsäulenbiologie zu nutzen. Dendritische Stacheln auf dorsalen D (DD) Motoneuronen erhalten Input von cholinergen Neuronen (VA und VB) im ventralen Nervenstrang (Abbildung 1A)2,3,4. Hier werden bildgebende Verfahren vorgestellt, um die Struktur von DD-dendritischen Dornen und ihre Funktion in vivo in einem intakten Nervensystem zu erforschen, das für Live-Bildgebung und genetische Analyse leicht zugänglich ist. Zur Überwachung der Form von dendritischen Dornen, (1) zytosolisch fluoreszierende Proteine, die den dendritischen Prozess und die Dornen füllen; (2) membrangebundene fluoreszierende Proteine, die den Rand von dendritischen Dornen und Dendriten schmücken; oder (3) die Aktinmarker LifeAct5 oder Utrophin6 verwendet werden, die mit dendritischen Stacheln angereichert sind und so ihre Form offenbaren. Um die Funktionalität von DD-Dornen zu überwachen, wird GCaMP-Fluoreszenz verwendet, um Ca++-Transienten zu detektieren, die durch Aktivierung des rotverschobenen Opsins Chrimson in präsynaptischen cholinergen Neuronen hervorgerufenwerden 7. Es wird erwartet, dass beide Strategien die Untersuchung von DD-dendritischen Stacheln bei Wildtyp- und mutierten Tieren erleichtern.
1. Bestimmung der Struktur der dendritischen DD-Dornen
2. Bewertung der Aktivierung von DD-dendritischen Dornen durch präsynaptische cholinerge Signalübertragung
Messungen mit drei unabhängigen Markern (zytosolische mCherry, LifeAct::GFP, MYR::mRuby) ergaben eine durchschnittliche Dichte von 3,4 ± 1,03 DD dendritischen Dornen pro 10 μm DD-Dendrit bei jungen Wildtyp-Erwachsenen (Abbildung 1B,C). Für diese Analyse wurden die mit dem GFP::Utrophin-Marker erzielten Messungen, die eine signifikant geringere Wirbelsäulendichte ergaben, aufgrund von Wechselwirkungen von Utrophin mit dem Aktin-Zytoskelett6, die möglicherweise die Wirbelsäulenmorphogenese15 antreiben, ausgeschlossen (2,4 ± 0,74, Abbildung 1). Die Messungen der Wirbelsäulendichte im Lichtmikroskop sind vergleichbar mit dem Wert von 4,2 Dornen/10 μm Dendrit, der aus der Rekonstruktion von 12 Dornen aus elektronenmikroskopischen Aufnahmen des DD1-Neurons2 gewonnen wurde. Der Lebendzell-Bildgebungsansatz bestätigte, dass die dünne/pilzförmige Morphologie der DD-Stacheln in den adulten vs. alternativen Wirbelsäulenformen (z. B. filopodisch, stumpf, verzweigt) vorherrscht (Abbildung 2B), was auch für Stacheln im reifen Säugetiernervensystem typisch ist16.
Eine optogenetische Strategie wurde verwendet, um zu fragen, ob die mutmaßlichen dendritischen Dornen, die durch hochauflösende Lichtmikroskopie detektiert wurden (Abbildung 1 und Abbildung 2), auf die Freisetzung von Neurotransmittern aus präsynaptischen Stellen ansprechen, ein charakteristisches Kennzeichen dendritischer Dornen in Säugetierneuronen. Grünes Licht (561 nm) wurde verwendet, um eine Kanalrhodopsin-Variante, Chrimson, in präsynaptischen cholinergen Neuronen und blaues Licht (488 nm) zu aktivieren, um Ca++-abhängige Fluoreszenz zu detektieren, die von einer zytoplasmatischen GCaMP-Sonde in postsynaptischen DD-dendritischen Dornen emittiert wurde. Dieses Experiment detektierte vorübergehende Ausbrüche des GCaMP-Signals in DD-Stacheln unmittelbar nach der optogenetischen Aktivierung von Chrimson in präsynaptischen VA-Neuronen (Abbildung 3). Der Erfolg dieses Experiments hängt von der zuverlässigen Expression von Chrimson in allen präsynaptischen VA-Neuronen ab. In diesem Fall wurde ein chromosomaler Integrant17 des Punc-4::Chrimson-Markers verwendet, um eine konsistente VA-Expression sicherzustellen. Dieses Experiment könnte auch mit einem extrachromosomalen Array durchgeführt werden. Die Chrimson-Expression in einem spezifischen VA-Neuron kann unabhängig voneinander bestätigt werden, indem beispielsweise das Chrimson-Transgen an eine SL2-transplicierte Leadersequenz mit einem nachgeschalteten nuklear-lokalisierten GFP als Co-Expressionsmarker2 gekoppelt wird. Es ist wichtig, ein Kontrollexperiment in Abwesenheit von ATR durchzuführen, um zu bestätigen, dass das gemessene GCaMP-Signal von der optogenetischen Aktivierung von Chrimson abhängt, die streng ATR-abhängig ist (Abbildung 4D). Da evozierte Ca++ -Signale transient sind, ist es schließlich wichtig, ein Bildgebungsprotokoll zu verwenden, das ein schnelles Umschalten (<1 s) zwischen 561-nm-Anregung und GCaMP-Signalerfassung mit dem 488-nm-Laser ermöglicht (Abbildung 4).

Abbildung 1: Markierung von DD-dendritischen Stacheln . (A) (Oben) Sechs dorsale D (DD1-DD6) Neuronen im ventralen Nervenstrang von C. elegans. (Unten) Bei Erwachsenen berühren ventral gerichtete DD-Stacheln (Pfeilspitze) präsynaptische Terminals von Ventral A (VA) und Ventral B (VB) Motoneuronen (Magenta), und DD-Kommissuren erstrecken sich bis zum dorsalen Nervenstrang, um den Körpermuskeln (Pfeil) GABAergen Output zu liefern18. Diese Abbildung wurde gegenüber Referenz2 geändert. (B) Fluoreszierende Mikroaufnahmen (Airyscan) von DD-Stacheln, markiert mit zytosolischer mCherry, myristoyliertem mRuby (MYR::mRuby), LifeAct::GFP und GFP::Utrophin bei jungen erwachsenen Würmern. Graue Pfeilspitzen zeigen auf Stacheln. Maßstabsbalken = 2 μm. (C) Dichte (Stacheln/10 μm) von dendritischen DD-Neuronen, markiert mit zytosolischer mCherry (3,77 ± 0,9), MYR::mRuby (3,09 ± 0,8), LifeAct::GFP (3,44 ± 1,1) oder GFP::Utrophin (2,41 ± 0,8). Alle Proben sind normalverteilt. One-Way ANOVA zeigt, dass die Wirbelsäulendichte für zytosolische mCherry, MYR::mRuby und LifeAct::GFP nicht signifikant (NS) unterschiedlich ist, während die Wirbelsäulendichte für GFP::Utrophin vs. zytosolisch markierte mCherry (p = 0,0016) und LifeAct::GFP (p = 0,0082). Die gestrichelte rote Linie stellt die Wirbelsäulendichte von DD-Neuronen dar, die aus der 3D-EM-Rekonstruktion bewertet wurden (4,2 Stacheln/10 μm). Diese Abbildung wurde gegenüber Referenz2 geändert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 2: Bildgebung von DD-dendritischen Stacheln. (A) (Oben) Schematische Darstellung der Wirbelsäulenformen. (Unten) Airyscan-Bilder jeder Art von Wirbelsäule (Maßstabsbalken = 500 nm) markiert mit LifeAct::GFP (grün) und 3D-Rekonstruktionen durch serielle elektronenmikroskopische Aufnahmen eines hochdruckgefrorenen Erwachsenen (blau). (B) Wirbelsäulenfrequenz nach Typ, visualisiert mit LifeAct::GFP: Dünn/Pilz (55,5 ± 14,5%), Filopodial (10,3 ± 8,70%), Stubby (18,8 ± 10,7%), Verzweigt (15,42 ± 6,01%). Stachelhäufigkeit nach Typ visualisiert mit MYR::mRuby: Thin/Mushroom (52,2 ± 16,5%), Filopodial (5,68 ± 7,0%), Stubby (33,1 ± 14,8%), Branched (9,02 ± 9,6%). Ungepaarter T-Test, Filopodial (p = 0,0339); Stubby- (p = 0,0009) und verzweigte (p = 0,011) Stacheln, die mit dem MYR::mRuby-Marker gekennzeichnet sind, unterscheiden sich signifikant von LifeAct::GFP. Diese Abbildung wurde gegenüber Referenz2 geändert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 3: Strategien zur Aufnahme hochauflösender Bilder von DD-Stacheln. (A-B) (Oben) Fluoreszierende Bilder von DD1-Dendriten, markiert mit einem zytosolischen Marker (mCherry) durch (A) Airyscan-Detektor und (B) Nyquist-Akquisition. (Unten) DD-Dendrit (rot) wird mit einer Bildanalysesoftware dargestellt (Auto-Path-Option des Filament-Tracers), und DD-Dornen (blau) werden mit dem halbautomatischen Stachelerkennungsmodul grafisch dargestellt. Der Pfeil zeigt auf einen verzweigten Stachel, der in C und D vergrößert ist. Pfeilspitzen bezeichnen benachbarte dünne / Pilzstacheln, die in C und D vergrößert sind. Maßstabsbalken = 2 μm. (C-D) Vergrößerte Beispiele für (oben) verzweigte Stacheln (Pfeil) und (unten) zwei benachbarte dünne / Pilzstacheln (Pfeilspitzen), die mit (C) Airyscan-Detektor oder durch (D) Nyquist-Erwerb erhalten wurden. Maßstabsbalken = 500 nm. Daten reproduziert aus2. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 4: Beurteilung der Funktion von DD-Stacheln. (A) DD-Motoneuronen exprimieren den Ca++ -Indikator GCaMP6s (grün) und VA-Motoneuronen die Kanalrhodopsin-Variante Chrimson (Magenta)7. (B) Schematische Darstellung des Verfahrens zur Montage von Würmern für Ca++ -Messungen. (1) Auf einen sauberen Objektträger geben, (2) 2 μL 0,05 μm Polyperlen geben, (3) einen Platindraht ("Wurmpickel") verwenden, um eine kleine Kugel Sekundenkleber hinzuzufügen und (4) in die Lösung wirbeln, um filamentöse Klebstoffstränge zu erzeugen. (5) Fügen Sie 3μL M9-Puffer hinzu. (6) Etwa zehn L4-Larven in die Lösung geben, (7) Deckglas auftragen und Ränder mit Vaseline/Wachs versiegeln. (C-D) Die Aktivierung von VA-Neuronen korreliert mit Ca++ -Transienten in DD1-Stacheln. GCaMP6s-Fluoreszenz, abgebildet (in 0,5 s-Intervallen) mit periodischer Lichtaktivierung von Chrimson (2,5 s-Intervalle), evoziert Ca++ -Transienten mit (C) +ATR (n = 12), aber nicht in (D) Kontrollen (-ATR, n = 12). Panels sind Momentaufnahmen über die Zeit(en), vor und nach dem Puls von 561 nm Licht (vertikale rosa Linie). Maßstabsbalken = 2 μm. Das GCaMP6s-Signal wird von einem ROI (Region of Interest) an der Spitze jeder Wirbelsäule erfasst. (E) GCaMP6s-Fluoreszenz während der 10 s Aufnahmeperiode, die für +ATR (grün) vs -ATR (Kontrolle, grau) (n = 12 Videos) dargestellt wurde. Vertikale rosa Balken bezeichnen 561 nm Beleuchtung (z. B. Chrimson-Aktivierung). Jedes Tier wurde 4 mal mit 561 nm Licht stimuliert. Die Messungen wurden vor und nach jedem Puls von 561 nm Licht gesammelt. (F) Darstellung der GCaMP6s-Fluoreszenz vor und nach jedem Puls von 561 nm Licht. Die GCaMP6s-Fluoreszenz wurde 1 s nach jedem Puls von 561 nm Licht gemessen. Da die Proben nicht normalverteilt sind, wurde ein gepaarter nichtparametrischer Friedman-Test angewendet, um mehrere Vergleiche der GCaMP6s-Fluoreszenz vor vs. nach 561 nm Lichtstimulation für Würmer, die entweder mit ATR (+ATR, grün) (*** p = 0,0004, n = 48 Messungen) oder in Abwesenheit von ATR (-ATR, grau) (NS, nicht signifikant, p = 0,0962, n = 48 Messungen) gewachsen sind. Diese Abbildung wurde gegenüber Referenz2 geändert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Zusatzdossier 1: Liste der in der Studie verwendeten Plasmide. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzendes Dossier 2: Zusammensetzung und Vorbereitung des M9-Puffers. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Wir erklären keine Interessenkonflikte.
Dendritische Stacheln sind wichtige zelluläre Merkmale des Nervensystems. Hier werden bildgebende Verfahren zur Beurteilung der Struktur und Funktion von dendritischen Dornen in C. elegans beschrieben. Diese Ansätze unterstützen die Entwicklung von mutierten Screens für Gene, die die Form oder Funktion der dendritischen Wirbelsäule definieren.
Bildgebung und Analyse auf Imaris wurden in der Vanderbilt Cell Imaging Shared Resource (CIRS) durchgeführt, die von NIH unterstützt wird (CA68485, DK20593, DK58404, DK59637 und EY08126). Der LSM 880 wird durch den Zuschuss 1S10OD201630 unterstützt. Die Bildgebung auf einer sich drehenden Nikon-Scheibe wurde im Nikon Center of Excellence durchgeführt. Wir danken Jenny Schafer, CISR-Direktorin, und Bryan Millis für Schulungen und aufschlussreiche Diskussionen und Mitgliedern des Burnette-Labors: Dylan Burnette, Aidan Fenix und Nilay Taneja für den Rat. Diese Arbeit wurde durch Zuschüsse der National Institutes of Health an DMM (R01NS081259 und R01NS106951) und einen Zuschuss der American Heart Association an ACC (18PRE33960581) unterstützt.
| All-trans retinal (ATR) | Sigma-Aldrich | R2500-100MG | Notwendiger Cofaktor für die neuronale Erregung mit Chrimson |
| diH2O | MilliQ | Zur Herstellung von M9-Puffer | |
| Ethanol 100% | Sigma | 64-17-5 | Zur Verdünnung von ATR und Herstellung von Kontrollplatten für die neuronale Erregung |
| Ethyl-3-aminobenzoat-Methansulfonatsalz (Tricain) | Zur Immobilisierung von Tieren für die Bildgebung dendritischer Dornen | ||
| ImageJ | NIH | (Schindelin J et al., 2012) | Open-Source-Bildverarbeitungssoftware |
| KH2PO4 | Fisher Bioreagents | 7758-11-4 | Zur Herstellung von M9-Puffer |
| Levamisolhydrochlorid | Sigma | 16595-80-5 | Zur Immobilisierung von Tieren für die Bildgebung dendritischer Dornen |
| MgSO4 | Fisher Chemical | M63-500 | Zur Vorbereitung von M9-Puffer |
| Mikroskop-Deckglas | Fisherbrand | 12542B | Zur Einbettung von Tieren für die Mikroskopie |
| Na2HPO4 | Fisher Scientific | S369-500 | Zur Herstellung von M9-Puffer |
| NaCl | Fisher Chemical | S671-3 | Zur Herstellung von M9-Puffer |
| NIS Elements Version 05.21 | Nikon | Zur Analyse von Bildern und Filmen (z. B. Dekonvolution, Bildausrichtung) | |
| Polybeads Carboxylat 0,05 μm Mikrosphären | Polysciences, Inc | 15913-10 | Zur Immobilisierung von Tieren für die Bildgebung Ca++-Transienten |
| Prisma | Zur statistischen Analyse und grafischen Darstellung normalisierter Ca++-Transienten | ||
| SeaKen ME agarose | Lonza | 50014 | Zur Herstellung von Agarose-Pads zur Montage von Tieren für die |
| Bildgebung Sekundenkleber | Die Gorilla-Firma | Zur Immobilisierung von Tieren für die Bildgebung Ca++ Transienten | |
| Superfrost Objektträger | Fisherbrand | 22-034-980 | Zur Aufnahme von Tieren für die Mikroskopie-Aufnahme |
| Vaseline | Covidien | 8884430300 | Zur Versiegelung von Proben für konfokale Schnappschüsse |
| Wachs | Fisherbrand | 23-021-399 | Paraplast Tissue Embedding medium |
| Mikroskop für hochauflösende Bildgebung | |||
| LSM880 | Zeiss | ||
| AiryScan Detektor | Zeiss | ||
| Plan Apochromat (Öl) 63x/ 1.40 NA, WD = 0.19 mm | |||
| Laserlinien | |||
| Tischregler | |||
| Mikroskop für Nyquist Bildaufnahme | |||
| A1R Konfokal | Nikon | ||
| Plan Fluor (Öl) 40x/1.3 NA, WD 0.24 mm | |||
| 488 nm, 16mW | |||
| 561 nm, 17mW | |||
| Mikroskop zur Überwachung evozierter Ca++-Transienten in dendritischen Dornen | |||
| Spinning Disk Konfokal | Nikon | ||
| Andor DU-897 EMCCD Kamera | |||
| Spinning Disk Head CSU-X1 | Yokogawa | ||
| Apo TIRF (Öl) 100x/1.49 NA ,WD 0.12 mm | |||
| 488 nm, 65mW | |||
| 561 nm, 86mW | |||
| 525 nm (+/- 18 nm) | |||
| 605 nm (+/- 35 nm) |