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Research Article
Lamis Osama Anwar Abdelhakim1, Barbora Pleskačová1, Natalia Yaneth Rodriguez-Granados2, Rashmi Sasidharan2, Lucia Sandra Perez-Borroto3, Sophia Sonnewald4, Kristina Gruden5, Ute C. Vothknecht6, Markus Teige7, Klára Panzarová1
1PSI (Photon Systems Instruments), spol. s r.o. Drasov, 2Plant Stress Resilience, Institute of Environmental Biology,Utrecht University, 3Plant Breeding,Wageningen University and Research, 4Department of Biology, Biochemistry,Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg, 5Department of Biotechnology and Systems Biology,National Institute of Biology, 6Plant Cell Biology, Institute of Cellular and Molecular Botany,University of Bonn, 7Department of Functional & Evolutionary Ecology,University of Vienna
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Wir haben ein bildbasiertes Phänotypisierungsprotokoll entwickelt, um die morphologischen und physiologischen Reaktionen auf einfache und kombinierte Hitze-, Trockenheits- und Staunässebehandlungen zu bestimmen. Dieser Ansatz ermöglichte die Identifizierung von frühen, späten und Wiederherstellungsreaktionen auf der Ebene der gesamten Anlage, insbesondere in oberirdischen Teilen, und unterstrich die Notwendigkeit des Einsatzes mehrerer bildgebender Sensoren.
Die bildbasierte Phänotypisierung mit hohem Durchsatz ist ein leistungsfähiges Werkzeug, um die Entwicklung und Leistung von Pflanzen unter bestimmten Bedingungen im Laufe der Zeit nicht-invasiv zu bestimmen. Durch die Verwendung mehrerer bildgebender Sensoren können viele interessante Merkmale bewertet werden, darunter die pflanzliche Biomasse, die photosynthetische Effizienz, die Temperatur des Kronendachs und die Reflexionsindizes der Blätter. Pflanzen sind häufig mehreren Belastungen unter Feldbedingungen ausgesetzt, bei denen schwere Hitzewellen, Überschwemmungen und Dürreereignisse die Produktivität der Pflanzen ernsthaft bedrohen. Wenn Stress zusammenfällt, können die daraus resultierenden Auswirkungen auf Pflanzen aufgrund synergistischer oder antagonistischer Wechselwirkungen unterschiedlich sein. Um zu klären, wie Kartoffelpflanzen auf Einzel- und kombinierte Belastungen reagieren, die natürlich vorkommenden Stressszenarien ähneln, wurden einer ausgewählten Kartoffelsorte (Solanum tuberosum L., cv. Lady Rosetta) zu Beginn der Tuberisierung fünf verschiedene Behandlungen auferlegt, d.h. Kontrolle, Trockenheit, Hitze, Staunässe und Kombinationen aus Hitze-, Trockenheits- und Staunässestress. Unsere Analyse zeigt, dass Staunässe die nachteiligsten Auswirkungen auf die Pflanzenleistung hatte und zu schnellen und drastischen physiologischen Reaktionen im Zusammenhang mit dem Verschluss der Stomata führte, einschließlich einer Verringerung der Quantenausbeute und -effizienz von Photosystem II und einer Erhöhung der Temperatur und des Wasserindex im Kronendach. Unter Wärme- und kombinierten Stressbehandlungen war die relative Wachstumsrate in der frühen Stressphase reduziert. Bei Trockenheit und kombiniertem Stress sanken das Pflanzenvolumen und die Photosyntheseleistung mit erhöhter Temperatur und dem Verschluss der Spaltöffnungen in der späten Stressphase. Die Kombination aus optimierter Stressbehandlung unter definierten Umweltbedingungen zusammen mit ausgewählten Phänotypisierungsprotokollen ermöglichte es, die Dynamik morphologischer und physiologischer Reaktionen auf einzelne und kombinierte Belastungen aufzudecken. Hier wird ein nützliches Werkzeug für Pflanzenforscher vorgestellt, die Pflanzenmerkmale identifizieren möchten, die auf die Widerstandsfähigkeit gegenüber verschiedenen klimawandelbedingten Belastungen hinweisen.
Die potenziellen Auswirkungen des Klimawandels, einschließlich der Zunahme der Intensität und Häufigkeit von Hitzewellen, Überschwemmungen und Dürreereignissen, haben negative Auswirkungen auf den Anbau von Kulturpflanzen1. Es ist wichtig, den Einfluss des Klimawandels auf die Variabilität der Kulturpflanzen und die daraus resultierenden Schwankungen in der jährlichen Pflanzenproduktion zu verstehen2. Angesichts der steigenden Bevölkerung und des steigenden Nahrungsmittelbedarfs ist es eine Herausforderung, den Ertrag von Kulturpflanzen zu erhalten, weshalb es dringend erforderlich ist, klimaresistente Pflanzen für die Züchtung zu finden 3,4. Kartoffeln (Solanum tuberosum L.) sind eine der wichtigsten Nahrungspflanzen, die aufgrund ihres hohen Nährwerts und ihrer gesteigerten Wassernutzungseffizienz zur globalen Ernährungssicherheit beiträgt. Die Verringerung des Wachstums und des Ertrags unter ungünstigen Bedingungen ist jedoch ein Hauptproblem, insbesondere bei den anfälligenSorten 5,6. In vielen Studien wurde hervorgehoben, wie wichtig es ist, alternative Ansätze zur Aufrechterhaltung der Produktivität der Kartoffelernte zu untersuchen, einschließlich landwirtschaftlicher Praktiken, der Suche nach toleranten Genotypen und des Verständnisses der Auswirkungen von Stress auf die Entwicklung und den Ertrag 7,8,9, was auch von europäischen Kartoffelbauern (oder Landwirten) stark nachgefragt wird10.
Automatisierte Phänotypisierungsplattformen, einschließlich bildbasierter Phänotypisierung, ermöglichen die quantitative Analyse der Pflanzenstruktur und -funktion, die für die Auswahl relevanter Merkmale von Interesse unerlässlich sind11,12. Die Hochdurchsatz-Phänotypisierung ist eine fortschrittliche nicht-invasive Technik, um verschiedene morphologische und physiologische Merkmale von Interesse reproduzierbar und schnell zu bestimmen 13. Obwohl der Phänotyp genotypische Unterschiede in Bezug auf Umwelteinflüsse widerspiegelt, ermöglicht der Vergleich von Pflanzen unter kontrollierten Bedingungen mit Stress die Verknüpfung der umfangreichen Phänotypisierungsinformationen mit einem spezifischen (Stress-)Zustand14. Die bildbasierte Phänotypisierung ist für die Beschreibung phänotypischer Variabilität unerlässlich und ist auch in der Lage, eine Reihe von Merkmalen über die gesamte Pflanzenentwicklung hinweg zu screenen, unabhängig von der Populationsgröße15. Zum Beispiel wird die Messung morphologischer Merkmale, einschließlich der Form, Größe und des Farbindex von Blättern mit Rot-Grün-Blau (RGB) Bildsensoren, verwendet, um das Wachstum und die Entwicklung von Pflanzen zu bestimmen. Darüber hinaus werden Messungen physiologischer Merkmale, einschließlich der photosynthetischen Leistung, der Kronentemperatur und des Blattreflexionsvermögens, mit mehreren Arten von Sensoren quantifiziert, wie z. B. Chlorophyllfluoreszenz, thermisches Infrarot (IR) und hyperspektrale Bildgebung16. Neuere Studien in kontrollierten Umgebungen zeigten das Potenzial der bildbasierten Phänotypisierung bei der Bewertung verschiedener Mechanismen und physiologischer Reaktionen von Pflanzen unter abiotischem Stress wie Hitze bei Kartoffeln17, Trockenheit bei Gerste18, Reis19 und kombinierten Trocken- und Wärmebehandlungen bei Weizen20. Auch wenn die Untersuchung der Reaktionen von Pflanzen auf multiple Stressinteraktionen komplex ist, eröffnen die Ergebnisse neue Erkenntnisse zum Verständnis der pflanzlichen Mechanismen bei der Bewältigung des schnellen Wandels der Klimabedingungen21.
Die physiologischen und morphologischen Reaktionen der Pflanzen werden direkt durch abiotische Stressbedingungen (hohe Temperaturen, Wasserdefizit und Überschwemmungen) beeinflusst, was zu einer Ertragsminderung führt22. Auch wenn Kartoffeln im Vergleich zu anderen Kulturen eine hohe Wassernutzungseffizienz aufweisen, wirkt sich das Wasserdefizit aufgrund der flachen Wurzelarchitektur negativ auf die Ertragsmenge und -qualitätaus 5. Abhängig von der Intensität und Dauer der Trockenheit ist der Blattflächenindex reduziert, und in späteren Stressstadien ist eine Verzögerung des Kronenwachstums mit Hemmung der Blattneubildung ausgeprägt, was zu einer Verringerung der Photosyntheserate führt23. Der Wasserschwellenwert ist kritisch bei Wasserüberschuss oder längeren Trockenperioden, was sich aufgrund von Sauerstofflimitierung, verminderter hydraulischer Leitfähigkeit der Wurzeln und Einschränkung des Gasaustauschs negativ auf das Pflanzenwachstum und die Knollenentwicklung auswirkt24,25. Darüber hinaus reagieren Kartoffeln empfindlich auf hohe Temperaturen, bei denen Temperaturen über dem optimalen Niveau zu einer verzögerten Initiierung, einem verzögerten Wachstum und einer verzögerten Assimilationsrate der Knollen führen26. Wenn Stress in Kombination auftritt, unterscheiden sich die biochemischen Regulierungen und physiologischen Reaktionen von den individuellen Stressreaktionen, was die Notwendigkeit unterstreicht, die Reaktionen der Pflanzen auf Stresskombinationen zu untersuchen27. Kombinierter Stress kann zu einer (noch) stärkeren Verringerung des Pflanzenwachstums und zu determinanten Effekten auf reproduktionsbezogene Merkmale führen28. Der Einfluss der Stresskombination hängt von der Dominanz der einzelnen Stressfaktoren über die anderen ab, was zu einer verstärkten oder unterdrückten Pflanzenreaktion führt (z. B. führt Trockenheit in der Regel zum Schließen der Spaltöffnungen, während die Spaltöffnungen offen sind, um eine Abkühlung der Blattoberfläche unter Hitzestress zu ermöglichen). Die kombinierte Stressforschung ist jedoch noch im Entstehen, und es sind weitere Untersuchungen erforderlich, um die komplexe Regulation, die die Pflanzenreaktionen unter diesen Bedingungen vermittelt, besser zu verstehen29. Daher zielt diese Studie darauf ab, ein Phänotypisierungsprotokoll unter Verwendung mehrerer bildgebender Sensoren hervorzuheben und zu empfehlen, das geeignet sein kann, morphophysiologische Reaktionen zu bewerten und die zugrunde liegenden Mechanismen der Gesamtleistung der Kartoffel unter einfachen und kombinierten Stressbehandlungen zu verstehen. Wie angenommen, erwies sich die Kombination mehrerer bildgebender Sensoren als wertvolles Werkzeug, um die frühen und späteren Strategien während der Stressreaktion von Pflanzen zu charakterisieren. Die Optimierung des bildbasierten Phänotypisierungsprotokolls wird ein interaktives Werkzeug für Pflanzenforscher und -züchter sein, um Merkmale zu finden, die für die abiotische Stresstoleranz von Interesse sind.
1. Vorbereitung des Pflanzenmaterials und Wachstumsbedingungen
2. Anwendung von Stress
3. Vorbereitung der Pflanzen für die Phänotypisierung
4. Phänotypisierungsprotokoll
5. Anpassen der Einstellungen für jeden Bildsensor


6. Exportieren von Daten und Bildanalyse
7. Wiegen und Gießen
8. Datenanalyse
In dieser Studie wurde eine automatisierte bildbasierte Phänotypisierung verwendet, um die morphologischen und physiologischen Reaktionen der Kartoffel (cv. Lady Rosetta) unter einfachem und kombiniertem Stress zu untersuchen. Der angewandte Ansatz zeigte die dynamischen Reaktionen von Pflanzen in hoher räumlich-zeitlicher Auflösung, wenn Stress in der Knolleninitiierungsphase induziert wurde. Um die frühen und späten Phasen von Stress zu erfassen, wurden die Ergebnisse in 3 Zeiträumen dargestellt ([0-5 Tage Phänotypisierung (DOP)], [6-10 DOP] und [11-15 DOP]) (Abbildung 1). Bis 0 DOP wurden alle Pflanzen unter Kontrollbedingungen (C) angebaut, dann von 1-5 DOP, wobei Staunässe (W) und Hitzestress (H) angewendet wurden. So wurden die Reaktionen wie folgt beobachtet: (i) in 0-5 DOP zeigte die anfängliche Hitze- und Staunässe; (ii) in 6-10 DOP wurde die frühe Dürre (D) und kombinierte Hitze und Dürre (HD) beobachtet und (iii) in 11-15 DOP zeigte die späte Hitze, Trockenheit und kombinierte Hitze + Dürre + Staunässe (HDW). Die Erholung von Staunässe wurde bei 6-10 DOP und 11-15 DOP beobachtet.
Morphologische Merkmale
Mit Hilfe von RGB-Bildgebung wurde der Einfluss verschiedener Belastungen und Kombinationen auf das oberirdische Pflanzenwachstum bestimmt. Die Ergebnisse in Abbildung 4 zeigen, dass Wärmebehandlung und Staunässe (0-5 DOP) bereits eine Reduzierung des Anlagenvolumens und der RGR im Vergleich zur Regelung bewirken. Während 6-10 DOP nahmen das Pflanzenvolumen und die RGR der Kontrollpflanzen kontinuierlich zu, während unter Hitze, Kraft-Wärme-Kopplung, Trockenheit und Staunässe diese Zunahme des Pflanzenvolumens deutlich reduziert wurde (Abbildung 4A). Da Pflanzen sehr anfällig für Staunässe sind, war ein Rückgang der RGR ausgeprägt (Abbildung 4B). Während des späten Trockenstresses (11-15 DOP), bei dem der SRWC bei 20% gehalten wurde, wurde eine deutliche Reduktion der RGR im Vergleich zur Kontrolle beobachtet. In der späten Phase der kombinierten HDW führte die Anwendung einer Staunässebehandlung jedoch zu einem Anstieg der RGR am letzten Tag der Belastung.
Physiologische Merkmale
Die Kombination aus struktureller und physiologischer Phänotypisierung wurde angewendet, um weitere Reaktionen auf Stress aufzudecken. Die Verwendung mehrerer bildgebender Sensoren ermöglicht die Bestimmung der physiologischen Reaktionen in der frühen Phase von Stress. Eine weitere Analyse der Chlorophyll-Fluoreszenzdaten zeigte, dass Staunässe die photosynthetische Effizienz negativ beeinflusste, wobei Fv'/Fm' (Fv/Fm_Lss) bei 0-5 DOP und 6-10 DOP dramatisch abnahm, aber eine Erholungsreaktion bei 11-15 DOP beobachtet wurde, wo Fv'/Fm' leicht anstieg (Abbildung 5A). Während der späten Stressphase (11-15 DOP) wurde eine Reduktion von Fv'/Fm' bei Trockenheit und kombinierter Hitze und Trockenheit beobachtet. In wassergesättigten Pflanzen war die Betriebseffizienz der Pflanzen (QY_Lss auch bekannt als φPSII) im Vergleich zu anderen Behandlungen bei 0-5 DOP und 6-10 DOP signifikant niedriger, aber ein leichter Anstieg bei 11-15 DOP, was auf eine Wiederfindung der Pflanzen hinweist (Abbildung 5B). Darüber hinaus wurden die verschiedenen Mechanismen zur Regulierung der Effizienz, die zum Schutz von PSII beitragen, durch Berechnung des Anteils der offenen Reaktionszentren in PSII in einem leichten stationären Zustand (qL_Lss) bestimmt (Abbildung 5C). Nur unter Trockenheit wurde ein Anstieg der qL beobachtet, wahrscheinlich aufgrund der Photoinhibition.
Diese Ergebnisse stimmten mit IR-Daten überein, die unterschiedliche zugrundeliegende Mechanismen unter Stress widerspiegelten (Abbildung 6). Bei Staunässe wurde ein Anstieg von deltaT (ΔT) beobachtet, wodurch sich die Gaswechselrate verringerte. Bei Spättrockenheit und kombinierter Hitze und Trockenstress war ein Anstieg des ΔT auf den Verschluss der Spaltöffnungen zurückzuführen, der als eine der wichtigsten Reaktionen zur Vermeidung von übermäßigem Wasserverlust angesehen wurde. Auf der anderen Seite wurde eine Verringerung des ΔT unter Wärmebehandlungen beobachtet, wenn sich die Spaltöffnungen öffnen, um die Transpirationseffizienz zu erhöhen und die Blattoberfläche zu kühlen.
Bei der Untersuchung der hyperspektralen Daten wurden zwei Parameter aus den hyperspektralen VNIR-Daten ausgewählt, um die Blattreflexionsindizes zu bewerten, darunter NDVI als Indikator für den Chlorophyllgehalt und PRI als Indikator für die Effizienz der Photosynthese. Die Ergebnisse zeigten eine Abnahme von NDVI und PRI nur unter Staunässe in Verbindung mit der beobachteten Reduktion der morphologischen Merkmale (Abbildung 7A,B). Darüber hinaus wurde aus den hyperspektralen SWIR-Daten, die zur Beurteilung des Wassergehalts in den Pflanzen verwendet wurden, ein Anstieg des Wasserindex bei Staunässe während 0-5 DOP beobachtet (Abbildung 7C). Bei Wärmebehandlungen wurde jedoch eine gegenteilige Reaktion beobachtet, bei der der Wasserindex niedriger war als bei der Kontrolle. Diese Ergebnisse stimmten mit einer Untersuchung der Vegetation aus der Farbsegmentierung der RGB-Draufsicht überein. Die Veränderungen im Anteil der Farbtöne zeigen die Stressreaktionen im Laufe der Zeit an (Abbildung 8). Der Greening-Index zeigte eine Verringerung des Pigmentgehalts unter Trockenheit und kombinierter HDW in der späten Stressphase und eine allmähliche Erholung von der Staunässebehandlung. Die Verwendung der verschiedenen bildgebenden Sensoren spiegelte somit die Korrelation morphophysiologischer Merkmale wider und ermöglichte die Beurteilung der Gesamtleistung der Pflanze unter abiotischem Stress.

Abbildung 1: Zeitleiste der Anwendung der verschiedenen Behandlungen, einschließlich des Alters der Pflanzen in Tagen nach dem Umpflanzen der In-vitro-Stecklinge . Tag 0 der Phänotypisierung (DOP) wurde unter Kontrollbedingungen (C) gemessen, und dann wurden die verschiedenen Belastungen mit unterschiedlicher Dauer induziert. Von 1-5 DOP wurde Staunässe (W) Spannung aufgebracht und die erste Reaktion der Wärmebehandlung (H). In den folgenden Tagen wurde 6-10 DOP die Anfangsphase von Trockenstress (D) und kombinierter Hitze- und Trockenstress (HD) vorgestellt. Während 11-15 DOP wurde die Reaktion der Pflanzen auf die späte Phase der Trockenheit und Wärmebehandlungen und die Anwendung von Staunässe auf HD (HDW) für 1 Tag reflektiert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Schema zur Zusammenfassung des Phänotypisierungsprotokolls und der Datenanalyse. (A) Überblick über das Phänotypisierungsprotokoll. Die Pflanzen werden von den kontrollierten Bedingungen in der FS-WI-Wachstumskammer (PSI) zum Phänotypisierungssystem transportiert. Die Pflanzen wurden vor den Messungen 5 Minuten lang in der Lichtadaptionskammer bei 500 μmol.m-2.s-1 lichtakklimatisiert. Mehrere bildgebende Sensoren wurden verwendet, um morphologische und physiologische Merkmale zu bestimmen, gefolgt von der Wiege- und Bewässerungsstation. Je nach Behandlung wurden die Pflanzen wieder unter kontrollierten Bedingungen ausgesetzt, entweder bei 22 °C/19 °C oder 30 °C/28 °C. (B) Automatische Extraktion und Segmentierung der Bildverarbeitungspipeline von jedem Bildsensor. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: Kurzübersicht über das Lichtprotokoll für die Chlorophyll-Fluoreszenzbildgebung. Das Messprotokoll begann mit dem Einschalten von kaltweißem aktinischem Licht zur Messung der stationären Fluoreszenz im Licht (Ft_Lss) und dem anschließenden Anlegen eines Sättigungsimpulses zur Messung der stationären maximalen Fluoreszenz im Licht (Fm_Lss). Das aktinische Licht wurde ausgeschaltet und das dunkelrote Licht eingeschaltet, um die stationäre minimale Fluoreszenz im Licht (Fo_Lss) zu bestimmen. Die Dauer des Protokolls betrug 10 s pro Pflanze. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: RGB-Bildgebung für die morphologische Beurteilung. (A) Pflanzenvolumen berechnet aus dem RGB-Bereich von oben und von der Seite. (B) Relative Wachstumsrate (RGR) während der Initiierungsphase der Knolle. Bei den Daten handelt es sich um Mittelwerte ± Standardabweichung (n = 10). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 5: Chlorophyll-Fluoreszenz-Bildgebung an lichtadaptierten Pflanzen. (A) Maximale Effizienz der PSII-Photochemie lichtadaptierter Proben im lichtstabilen Zustand (Fv/Fm_Lss). (B) Quantenausbeute des Photosystems II oder Betriebseffizienz des Photosystems II im stationären Lichtzustand (QY_Lss). (C) Anteil der offenen Reaktionszentren in PSII im leichten stationären Zustand (oxidierte QA) (qL_Lss). Bei den Daten handelt es sich um Mittelwerte ± Standardabweichung (n = 10). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 6: Thermische IR-Bildgebung wurde verwendet, um die Differenz zwischen der aus thermischen IR-Bildern extrahierten Durchschnittstemperatur des Kronendachs und der Lufttemperatur (ΔT) zu berechnen. Bei den Daten handelt es sich um Mittelwerte ± Standardabweichung (n = 10). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 7: Hyperspektrale Bildgebung zur Bestimmung von Vegetationsindizes und Wassergehalten. (A) Normalisierter Differenz-Vegetationsindex (NDVI). (B) Photochemischer Reflexionsindex (PRI), berechnet aus VNIR-Bildgebung. (C) Wasserindex berechnet aus SWIR-Bildgebung. Bei den Daten handelt es sich um Mittelwerte ± Standardabweichung (n = 10). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 8: Begrünungsindex für Pflanzen unter verschiedenen Behandlungen. Die Bildverarbeitung basiert auf der Umwandlung des ursprünglichen RGB-Bildes in eine Farbkarte, die aus 6 definierten Farbtönen besteht. Bei den Daten handelt es sich um Mittelwerte ± Standardabweichung (n = 10). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Ergänzende Abbildung 1: Gemessene Lichtintensität während der Tage der Phänotypisierung (DOP). Die Dauer der Messungen von 9:00 bis 12:35 Uhr. LI_Buff bezieht sich auf die Mediandaten von 5 Lichtsensoren, die im Gewächshaus verteilt sind. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 2: Relative Luftfeuchtigkeit (RH), gemessen während der Tage der Phänotypisierung (DOP). Die Dauer der Messungen von 9:00 bis 12:35 Uhr. RH_Buff bezieht sich auf die Mediandaten von 5 Feuchtigkeitssensoren, die im Gewächshaus verteilt sind. RH2 bezieht sich auf die relative Luftfeuchtigkeit in der Adaptionskammer. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 3: Temperatur, die während der Tage der Phänotypisierung (DOP) gemessen wurde. Die Dauer der Messungen von 9:00 bis 12:35 Uhr. T_Buff bezieht sich auf die Mediandaten von 5 Temperatursensoren, die im Gewächshaus verteilt sind. T2 bezieht sich auf die Temperatur in der Adaptionskammer. T3 bezieht sich auf die Temperatur der Heizwand. T4 bezieht sich auf die Temperatur im Wärmebildgerät. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 4: Screenshot aus der Datenanalysesoftware, der die Parameter zeigt, die für die Analyse von Pflanzenmasken in bildgebenden Chlorophyllfluoreszenzsensoren angepasst wurden. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 5: Screenshot aus der Datenanalysatorsoftware, der die Parameter zeigt, die für die Analyse von Pflanzenmasken in thermischen Infrarot-Bildsensoren angepasst wurden. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 6: Screenshot aus der Datenanalysesoftware, der die Parameter zeigt, die für die Analyse der Pflanzenmaske in RGB-Bildsensoren mit 1-Seitenansicht angepasst wurden. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 7: Screenshot aus der Datenanalysesoftware, der die Parameter zeigt, die für die Analyse von Pflanzenmasken in RGB2-Bildsensoren mit Draufsicht angepasst wurden. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 8: Screenshot aus der Datenanalysesoftware, der die Parameter zeigt, die für die Analyse der Pflanzenmaske in VNIR-Bildsensoren angepasst wurden. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 9: Screenshot aus der Datenanalysesoftware, der die Parameter zeigt, die für die Analyse der Pflanzenmaske in SWIR-Bildsensoren angepasst wurden. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Die Autoren erklären, dass ihnen keine konkurrierenden finanziellen Interessen oder persönlichen Beziehungen bekannt sind, die die in diesem Artikel berichtete Arbeit beeinflusst haben könnten.
Wir haben ein bildbasiertes Phänotypisierungsprotokoll entwickelt, um die morphologischen und physiologischen Reaktionen auf einfache und kombinierte Hitze-, Trockenheits- und Staunässebehandlungen zu bestimmen. Dieser Ansatz ermöglichte die Identifizierung von frühen, späten und Wiederherstellungsreaktionen auf der Ebene der gesamten Anlage, insbesondere in oberirdischen Teilen, und unterstrich die Notwendigkeit des Einsatzes mehrerer bildgebender Sensoren.
Dieses ADAPT-Projekt (Accelerated Development of multiple-stress tolerant Potato) wurde durch das Forschungs- und Innovationsprogramm Horizon 2020 der Europäischen Union im Rahmen der Finanzhilfevereinbarung Nr. GA 2020 862-858 gefördert. Diese Arbeit wurde teilweise vom Ministerium für Bildung, Jugend und Sport der Tschechischen Republik mit dem Europäischen Fonds für regionale Entwicklung, dem Projekt "SINGING PLANT" (Nr. CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_026/0008446). Die Core Facility Plants Sciences der CEITEC MU ist für ihre Unterstützung der Anbauanlagen bekannt. Wir danken Meijer BV für die Bereitstellung der in dieser Studie verwendeten In-vitro-Stecklinge. Wir danken Lenka Sochurkova für die Unterstützung bei der grafischen Gestaltung von Abbildung 2 und Pavla Homolová für ihre Hilfe bei der Vorbereitung des Pflanzenmaterials während der Experimente am Photon Systems Instruments (PSI) Research Center (Drásov, Tschechische Republik).
| 1,1" CMOS-Sensor mit RGB-Kamera | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://psi.cz/ | Der Sensor liefert eine Auflösung von 4112 x 4168 Pixeln für die Seitenansicht und 2560 x 1920 Pixel für die Draufsicht. Der Sensor ist extrem empfindlich und stellt einen echten Megapixel-CCD-Ersatz dar und erzeugt scharfe, rauscharme Bilder. |
| PSI, Drá sov, Tschechische Republik | FC1300/8080-15 | Pulsamplitudenmoduliertes (PAM) Chlorophyll-Fluorometer | |
| Fluorcam 10 Software | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | Version 1.0.0.18106 | Für die Visualisierung und Analyse von Chlorophyllfluoreszenzbildern |
| GigE PSI RGB – 12,36 Megapixel Kamera | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://psi.cz/ | Für die Seitenansichtsprojektionen wurde der Zeilenscan-Modus mit einer Auflösung von 4112 px/Zeile, 200 Zeilen pro Sekunde verwendet. Der abgebildete Bereich aus der Seitenansicht betrug 1205 & mal; 1005 mm (Höhe > Breite), während der abgebildete Bereich von der Draufsicht aus 800 > 800 mm. |
| Hyperspectral Analyzer Software | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | Version 1.0.0.14 | Für die Visualisierung und Analyse von hyperspektralen Bildern |
| Hyperspektralkamera HC-900 Serie | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://hyperspec.org/products/ | Kamera im sichtbaren Nahinfrarot (VNIR) 380-900 nm mit einer spektralen Auflösung von 0,8 nm FWHM |
| Hyperspektralkamera SWIR1700 | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://hyperspec.org/products/ | Kurzwellige Infrarotkamera (SWIR) Kamera 900 - 1700 nm mit einer spektralen Auflösung von 2 nm FWHM |
| InfraTec Wärmebildkamera (VarioCam HEAD 820(800)) | Flir, USA | https://www.infratec.eu/thermography/infrared-camera/variocam-hd-head-800/ | Auflösung von 1024 x 768 Pixeln, thermische Empfindlichkeit von < 20 mK und thermischer Emissionsgrad auf 0,95 eingestellt, mit einer Scangeschwindigkeit von 30 Hz und einer Länge von 768 Pixeln pro Zeile. Der abgebildete Bereich betrug 1205 & mal; 1005 mm (Höhe & Zeiten; Breite). |
| LED-Panel | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://led-growing-lights.com/products/ | Ausgestattet mit 4 > 240 rot-orangefarbenen (618 nm), 120 kalt-weißen LEDs (6500 K) und 240 dunkelroten LEDs (735 nm) gleichmäßig verteilt über einen Abbildungsbereich von 80 > 80 cm |
| Licht-, Temperatur- und relative Feuchtesensoren | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://psi.cz/ | Sensoren zur Überwachung der kontrollierten Bedingungen im Gewächshaus |
| MEGASTOP Blue Matten | Friedola | 75831 | Zur Abdeckung von Bodenoberflächen |
| Morphoanalyzer Software | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | Version 1.0.9.8 | Für die Visualisierung und Analyse von RGB-Bildern sowie die Analyse der Farbsegmentierung |
| PlantScreen Data Analyzer Software (Version 3.3.17.0) | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://plantphenotyping.com/products/plantscreen-modular-system/ | Zur Visualisierung und Analyse der Daten aller bildgebenden Sensoren Bewässerungs-Wiegeeinheit und der Umgebungsbedingungen im Gewächshaus |
| PlantScreen Modulares System | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://plantphenotyping.com/products/plantscreen-modular-system/ | Art der Phänotypisierungsplattform |
| Plantscreen Scheduler Software | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | Version 2.6.8368.25987 | Zur Planung des Experiments und zur Einstellung des Messprotokolls |
| SpectraPen MINI | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://handheld.psi.cz/products/spectrapen-mini/#details | Belichtungsmesser zum Einstellen des Lichtverhältnisses auf einer Haubenwaage |
| TOMI-2 hochauflösende Kamera | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://fluorcams.psi.cz/products/handy-fluorcam/ | Auflösung von 1360 > 1024 Pixel, Bildrate 20 fps und 16-Bit-Tiefe) mit einem 7-Positionen-Filterrad ist auf einem Roboterarm montiert, der in der Mitte des mehrfarbigen LED-Lichtpanels mit den Abmessungen 1326 x 1586 mm positioniert ist. |
| Begehbare FytoScope-Wachstumskammer | PSI, Drá sov, Tschechische Republik | https://growth-chambers.com/products/walk-in-fytoscope-fs-wi/ | Art der Kammern, in denen die Pflanze angebaut wird |