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JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics
Otimização para Sequenciamento e Análise de Amostras de RNA FFPE-RNA degradadas
Screening Cotton Genotypes for Reniform Nematode Resistance
Journal (Genetics)
Screening Cotton Genotypes for Reniform Nematode Resistance
Use of the Pyrimidine Analog, 5-Iodo-2′-Deoxyuridine (IdU) with Cell Cycle Markers to Establish Cell Cycle Phases in a Mass Cytometry Platform
Journal (Genetics)
Use of the Pyrimidine Analog, 5-Iodo-2′-Deoxyuridine (IdU) with Cell Cycle Markers to Establish Cell Cycle Phases in a Mass Cytometry Platform
 
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Otimização para Sequenciamento e Análise de Amostras de RNA FFPE-RNA degradadas

Article DOI: 10.3791/61060-v • 07:30 min • June 8th, 2020
June 8th, 2020 •
*1, *1,2, 1, 1, 1,2, 1
1NCI CCR Sequencing Facility, Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences, Frederick National Laboratory for Cancer Research
* These authors contributed equally

Kapitel

Summary
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Este método descreve as etapas para melhorar a qualidade e a quantidade de dados sequenciais que podem ser obtidos a partir de amostras de RNA incorporadas à parafina fixa-formalina (FFPE). Descrevemos a metodologia para avaliar com mais precisão a qualidade das amostras de FFPE-RNA, preparar bibliotecas de sequenciamento e analisar os dados das amostras de FFPE-RNA.

Tags

Genética Edição 160 sequenciamento de RNA parafina fixa em formalina incorporada FFPE sequenciamento de próxima geração NGS análise RNA-seq
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