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Formen, Einschließen und Beobachten von Mikrotubuli-basierten aktiven Nematiken
Formen, Einschließen und Beobachten von Mikrotubuli-basierten aktiven Nematiken
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JoVE Journal Biology
Forming, Confining, and Observing Microtubule-Based Active Nematics

Formen, Einschließen und Beobachten von Mikrotubuli-basierten aktiven Nematiken

Full Text
3,210 Views
08:37 min
January 13, 2023

DOI: 10.3791/64287-v

Fereshteh L. Memarian1, Dimitrius A. Khaladj1, Derek Hammar1, Linda S. Hirst1

1Department of Physics,University of California

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study focuses on the preparation and confinement of active nematics formed from microtubules and kinesin motors, contributing to advances in experimental techniques for studying complex fluid systems. The methods outlined simplify the approaches needed for newcomers in the field, enabling them to explore the dynamics of active materials more effectively.

Key Study Components

Research Area

  • Active Nematics
  • Nonlinear dynamics
  • Liquid crystal behavior

Background

  • Active nematics exhibit unique chaotic dynamics and topological defects.
  • Recent theoretical studies focus on the confinement of active nematics in microscale geometries.
  • Experimentalists have faced challenges in confining these materials effectively.

Methods Used

  • Construction of flow cells for confining active materials.
  • Utilization of microtubules and kinesin motors as the biological system.
  • Techniques for surface treatment and preparation of hydrophilic/hydrophobic supports.

Main Results

  • Successfully demonstrated the preparation of active nematic systems.
  • Identified a homogenous texture with mobile topological defects.
  • Validated imaging techniques for observing microtubule behavior.

Conclusions

  • This study offers a reproducible method for preparing active nematics.
  • The results enhance understanding of complex fluid behaviors in biological systems.

Frequently Asked Questions

What are active nematics?
Active nematics are complex fluids characterized by the continuous movement of particles driven by the active forces generated by motor proteins, leading to unique dynamical behaviors.
How do you prepare the hydrophilic cover slips?
Hydrophilic cover slips are prepared by cleaning with soapy water and ethanol, treating with a silane solution, and coating with an acrylamide solution.
What is the significance of using microtubules and kinesin motors?
Microtubules and kinesin motors serve as a model system for studying active matter, providing insights into the mechanics of biological processes at the microscale.
What imaging techniques are employed in this study?
Epi-fluorescence microscopy is used to visualize the behavior and dynamics of the confined active nematic layers.
Why is controlling the environment important for active nematics?
Control over the surrounding environment is crucial for directing the behavior of active nematics and studying their interactions under various conditions.
Can these methods be applied to other systems?
Yes, the techniques may be adapted for studying various types of active matter systems beyond nematics.

Hier werden Verfahren zur Herstellung aktiver Nematika aus Mikrotubuli und Kinesinmotoren vorgestellt, einschließlich Proteinpräparation und -aufbau sowie der Verwendung von Vertiefungen für den aktiven nematischen Einschluss.

Aktive Nematik hat sich zu einem spannenden Forschungsthema entwickelt, das die Bereiche der nichtlinearen Dynamik und der Flüssigkristalle erweitert. Es gibt komplexe Flüssigkeiten, die tödliche topologische Defekte und chaotische Dynamik aufweisen. Es gibt viele neuere theoretische Studien in der Literatur, die sich auf beschränkte aktive Nematik konzentrieren.

Für Experimentatoren war es jedoch eine Herausforderung, das Material in mikroskaligen Geometrien einzuschränken. Unsere Technik macht den Versuchsaufbau einfacher, so dass die neuen Gruppen das Feld betreten und diese aufregenden Materialien ausprobieren können. Die Techniken könnten auf andere EQUIS-Aktivmateriesysteme angewendet werden, um beispielsweise eine Phasenzusammensetzung aus wirkenden und Da in Zukunft mehr aktive Phasen entwickelt werden, müssen Experimentatoren Wege finden, das Material mit ähnlichen Nematiken einzuschließen.

Derek Hammar und Fereshteh Memarian, Doktoranden aus meinem Labor, demonstrieren das Verfahren. Zur Herstellung hydrophiler Deckgläser mit einer Acrylamidbeschichtung beginnen Sie mit der gründlichen Reinigung der Deckgläser mit Seifenwasser, Ethanol und 0,1 molärem Natronlauge mit abwechselnden Spülungen unter Verwendung von Nanoreinwasser. Nach dem Spülen gleitet der Bezug mit der Silanlösung aus 100 Milliliter Ethanol, einem Milliliter Asketsäure und 500 Mikrolitern Trimethoxysilylpropylmethacrylat a für 15 Minuten.

Anschließend mit nanoreinem Wasser abspülen. Bereiten Sie eine Acrylamidlösung aus 95 Milliliter Nanoreinstwasser und fünf Milliliter 40 Gewichtsprozent Acrylamid her. Dann entgasen Sie die Lösung für 30 Minuten in einem Vakuumofen, fügen Sie 0,07 Gramm Ammonium pro Sulfit und 35 Mikroliter Tetramethylethylendiamin für eine Endkonzentration von 2,3 Millimolar hinzu.

Gießen Sie Acrylamidlösung mit dem Gesicht nach oben über die Deckgläser und inkubieren Sie über Nacht bei Raumtemperatur. Zur Herstellung hydrophober Objektträger pipetten Sie 100 Mikroliter einer wasserabweisenden Lösung auf einen sauberen Glasobjektträger. Legen Sie dann einen weiteren sauberen Glasobjektträger darauf.

Dies gewährleistet eine gleichmäßige Beschichtung der wasserabweisenden Lösung auf der Oberfläche, wo sie zwei Minuten lang sitzt. Entfernen Sie den zweiten Objektträger und spülen Sie den ersten Objektträger gründlich mit nanoreinem Wasser ab. Anschließend mit Stickstoffgas trocknen.

Bereiten Sie eine Mischung aus technisch hergestelltem Öl vor, das 1,8% Fluortensid enthält. Glasobjektträger und Deckglas mit doppelseitigen 40 Mikrometer langen Klebeabstandshaltern montieren. Platzieren Sie die Abstandshalter im Abstand von 1,5 Millimetern auf dem hydrophoben Objektträger.

Legen Sie dann den acrylamidbeschichteten Abdeckstreifen mit einer behandelten Seite nach unten auf die Abstandshalter, um zu haften. Nachdem die Durchflusszelle aufgebaut wurde, pipetten Sie sofort das Ölgemisch in die Durchflusszelle, die den geschlossenen Raum mit einer Pipette in einer separaten Durchstechflasche füllt, mischen Sie vorsichtig sechs Mikroliter Aktivmaterial mit 3,73 Mikrolitern Mischung. Ein Mikroliter Mikrotubuli-Lösung 0,6 Mikroliter ATP-Lösung und 0,67 Mikroliter M-Zwei-B-Puffer pipettieren sechs Mikroliter frisch gemischtes Aktivmaterial in ein offenes Ende der Durchflusszelle.

Etwas Öl wird durch die wässrige Lösung verdrängt, wenn es in den Kanal injiziert wird. Dieser kann am gegenüberliegenden Ende des Strömungskanals mit einem kleinen Stück Seidenpapier aufgestaut werden. Versiegeln Sie nach dem Befüllen beide Seiten der Durchflusszelle mit einem Epoxidkleber, der bei UV-Licht für 20 Sekunden aushärtet.

Die aktive Schicht zwischen den beiden zulässigen Fluiden in einer quasi 2D-Schicht einzuschließen. Legen Sie die Durchflusszelle für 10 Minuten in eine schwingende Eimerzentrifuge mit der wässrigen Phase oben und der dichteren Ölschicht unter der Zentrifuge bei 212 G. Nach Abschluss dieses Schritts kann die Flusszelle zu einem Epifluoreszenzmikroskop gebracht werden, um sie mit einem 10-fachen oder 20-fachen Vergrößerungsobjektiv abzubilden.

Entwerfen Sie zunächst eine Masterform für das PDMS. Dies kann durch 3D-Drucksäulen auf einem Substrat erreicht werden. Nach dem 3D-Druck der Harz-Masterform reinigen Sie sie mit Isopropanol und härten Sie die Form dann unter einer UV-Lampe für 45 Minuten und im Ofen bei 120 Grad Celsius für zwei Stunden aus, bereiten Sie den Polyfarbstoff Methylcyan mit einem Elastomerhärter und einer Elastomerbasis vor.

Mischen Sie die beiden Komponenten im Verhältnis 1 zu 10 mit einem Metallspatel. Um diese Blasen zu entfernen, stellen Sie die Mischung unter ein Vakuum, um eine Stunde lang zu entgasen, danach sollte das nicht ausgehärtete PDMS transparent erscheinen. Gießen Sie das PDMS in eine geeignete Form und lassen Sie es über Nacht bei 60 Grad Celsius aushärten.

Um eine hydrophile PDMS-Oberfläche herzustellen, reinigen Sie das PDMS für 10 Minuten mit Ethanol und Isopropanol, spülen Sie es dann dreimal gründlich mit entionisiertem Wasser ab und trocknen Sie es. Verwenden Sie einen Plasmareiniger für fünf Minuten, um das trocken ausgehärtete PDMS zu reinigen. Dies macht die Oberfläche hydrophiler.

Als nächstes bereiten Sie eine Silanlösung vor und tauchen das Substrat für 15 Minuten in diese Lösung, um die Acrylamidbeschichtung vorzubereiten, spülen Sie das Substrat gründlich mit entionisiertem Wasser ab und tauchen Sie in Acrylamidlösung. Wenn Sie gebrauchsfertig sind, spülen Sie die Oberfläche mit entionisiertem Wasser ab und trocknen Sie sie mit Stickstoff für den sofortigen Gebrauch. Befestigen Sie das PDMS mit Epoxidkleber auf einem Objektträger, pipetten Sie einen Mikroliter der aktiven Mischung auf das PDM-Substrat und fügen Sie sofort Silikonöl auf den aktiven Netzwerktropfen hinzu.

Das aktive Netzwerk wird in den Brunnen einziehen. Dieser Vorgang dauert bis zu 60 Minuten. Legen Sie das PDMS-Gerät in eine schwingende Eimerzentrifuge mit der Ölschicht über der Wasserschicht und drehen Sie es 12 Minuten lang bei 212 G. Nachdem dieser Schritt abgeschlossen ist, bringen Sie das Material zum Mikroskop, um den Fortschritt des Materials abzubilden.

Wie es sich ausbalanciert. Das repräsentative Bild zeigt kurze Mikrotubuli ähnlicher Länge. Die einzelnen Mikrotubuli können aufgrund ihrer geringen Größe schwierig abzubilden sein.

Die Verwendung einer hochempfindlichen Kamera, die für die Fluoreszenzmikroskopie entwickelt wurde, ist für diese Anwendung am besten geeignet. Eine gut geformte aktive pneumatische Schicht ist homogen in der Textur ohne signifikante Hohlraumbereiche und mobile topologische Defekte. Beachten Sie jedoch, dass es einige akzeptable kleine Hohlräume in den Fehlerkernen geben kann.

Richtige Oberflächenbehandlung, um eine hydrophile oder hydrophobe Oberfläche zu haben. Mit dieser Methode kann die Rolle der Geometrie leicht diskutiert werden und die aktive Struktur kann gesteuert werden, indem nur die physikalische Begrenzung geändert wird.

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Biologie Ausgabe 191

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