La cromatina es el complejo masivo de ADN y proteínas empaquetadas dentro del núcleo. La complejidad del plegamiento de la cromatina y la forma en que se empaqueta dentro del núcleo influye en gran medida en el acceso a la información genética. En general, la periferia del núcleo se considera transcripcionalmente represiva, mientras que el interior de la célula se considera un área transcripcionalmente activa.

Dominios Topológicamente Asociados (TADs)

El posicionamiento tridimensional de la cromatina en el núcleo influye en el momento y el nivel de expresión génica en eucariotas. Por ejemplo, los promotores de genes están organizados físicamente separados de sus elementos reguladores del ADN, como los potenciadores. Estos elementos promotores-potenciadores deben juntarse para llevar a cabo las expresiones génicas. Cada cromátida comprende varias unidades que interactúan, denominadas dominios topológicamente asociados (TAD). En algunos casos, los TAD de dos cromátidas también pueden interactuar entre sí.

Territorios Cromosómicos (TC)

Varios TADs se acumulan para formar los territorios cromosómicos (TC). Estas disposiciones y distribuciones espaciales hacen del núcleo un cuerpo heterogéneo con distintas actividades bioquímicas. El posicionamiento de los genes dentro de la TC y el propio posicionamiento de las TC afecta a la expresión génica. En los seres humanos, los genes transcritos activamente tienden a localizarse hacia la periferia de su CT, mientras que los genes no codificantes tienden a localizarse hacia el interior de su CT. Por ejemplo, en los núcleos de las células del líquido amniótico femenino humano, el gen ANT2 se encuentra en el cromosoma X inactivo. Cuando el gen ANT2 se localiza hacia la periferia de la TC, da lugar a su transcripción activa.

Las cromatinas se reposicionan dinámicamente dentro del núcleo. Incluso las células terminalmente diferenciadas que ya no pueden dividirse exhiben cromatina o reposicionamiento de genes. Esto significa que el reposicionamiento no es un evento aleatorio, sino un mecanismo molecular coordinado.