Las topoisomerasas son enzimas que relajan las moléculas de ADN enrolladas durante varios procesos celulares, incluida la replicación y transcripción del ADN. Estas enzimas regulan el superenrollamiento positivo y negativo del ADN sin cambiar la secuencia de nucleótidos. El rebobinado del ADN en el sentido de las agujas del reloj da como resultado un ADN superenrollado positivamente, mientras que el rebobinado en el sentido contrario a las agujas del reloj produce un ADN superenrollado negativamente.
Tipos y mecanismo de acción
Las topoisomerasas se dividen en dos tipos principales. Las topoisomerasas de tipo I actúan sobre una hebra de ADN bicatenario, y a su vez se dividen en tres categorías: IA, IB e IC. El tipo IA forma un enlace covalente con el extremo 5′ de la hebra de ADN escindida y elimina las superbobinas negativas. Crea un avance de una sola hebra por el que puede pasar la hebra opuesta, lo que da como resultado una molécula de ADN desenredada localmente. El tipo IB forma un enlace covalente con el extremo 3′ de la hebra de ADN rota y puede relajar tanto positiva como negativamente el ADN superenrollado. La enzima hace girar la hebra única cortada alrededor de la hebra opuesta, desenrollando el ADN en el proceso. El tipo IC se encuentra principalmente en las arqueas y tiene un mecanismo similar al tipo IB. La mayoría de las topoisomerasas de tipo I no requieren ATP para relajar el ADN superenrollado. Con la excepción de la girasa inversa, esta topoisomerasa de tipo IA única requiere ATP y genera superbobinas de ADN positivas en lugar de desenrollarlas.
Las topoisomerasas de tipo II son enzimas dependientes de ATP que cortan ambas hebras de una doble hélice de ADN. Se dividen en dos subtipos, Tipo IIA y Tipo IIB. Estos subtipos se distinguen por su estructura y la ubicación de sus dominios proteicos. Ambos subtipos tienen mecanismos similares; transfieren un bucle de ADN superenrollado intacto a través de la doble cadena rota, desenredando así la bobina en un bucle. La girasa bacteriana, que pertenece a las topoisomerasas de tipo IIA, puede introducir un superenrollamiento negativo en el ADN y, por lo tanto, es diferente de todas las demás topoisomerasas conocidas.
El desenrollamiento de la doble hélice del ADN durante la replicación da como resultado un sobreenrollado en las regiones anteriores a la horquilla de replicación.
Además, el superenrollamiento puede ocurrir cuando el ADN se retuerce sobre sí mismo debido a la incapacidad de los extremos del ADN para rotar libremente para aliviar la tensión torsional. Esta torsión inhibe un mayor desenrollado del ADN, deteniendo procesos celulares vitales como la replicación del ADN.
Para hacer frente a este problema de sinuosidad, las células tienen enzimas conocidas como topoisomerasas que tienen actividad nucleasa y ligasa; es decir, estas enzimas se rompen reversiblemente y luego se vuelven a conectar los enlaces fosfodiéster en el ADN para eliminar la tensión torsional en el ADN sobreenrollado.
Las topoisomerasas se dividen en dos categorías.
Lastopoisomerasas de tipo I son independientes del ATP y actúan cortando un enlace entre nucleótidos en una sola hebra de ADN bicatenario.
A continuación, la hebra de ADN intacta pasa a través del hueco de la hebra rota hasta la cavidad superior de la enzima.
Finalmente, la enzima liga los extremos rotos de las hebras de ADN y produce una molécula de ADN localmente relajada.
Las topoisomerasas de tipo II, por otro lado, dependen del ATP y actúan sobre el ADN superenrollado donde el ADN está enredado alrededor de sí mismo.
La enzima crea una rotura de doble cadena en un bucle de la doble hélice del ADN antes de ayudar al bucle ininterrumpido a pasar a través de esta rotura a través de una reacción dependiente de ATP.
Luego, utilizando la energía de un segundo ATP, la topoisomerasa de tipo II vuelve a sellar los extremos rotos de las hebras de ADN y finalmente se separa del ADN, dejando atrás una hélice de ADN desenredada.
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