Reparación por escisión de base con parche largo

En los mamíferos, se observa un segundo tipo de BER, que a menudo se usa preferentemente durante la escasez de ATP: la BER de parche largo. En lugar de simplemente eliminar la base dañada, el parche largo BER repara un parche de varios nucleótidos de largo.

Para lograr esto, una ADN polimerasa diferente, δ/ɛ, agrega varios nucleótidos que desplazan a los nucleótidos originales. Esto da lugar a un saliente de oligonucleótidos llamado colgajo, que contiene la base dañada.

En presencia de un factor de replicación llamado antígeno nuclear de célula proliferativa o PCNA, una endonucleasa especial llamada endonucleasa de colgajo (FEN, por sus siglas en inglés) elimina este colgajo antes de que una ligasa de ADN selle la muesca.

El mecanismo de la BER de parche largo es particularmente útil para reparar los daños resultantes de la radiación ionizante.