Reparación por escisión de base con parche largo

Desde el descubrimiento de las dos vías BER, ha habido un debate sobre cómo una célula elige una vía sobre la otra y los factores que determinan esta selección. Numerosos experimentos in vitro han señalado múltiples determinantes para la selección de la subvía. Estos son:

Tipo de lesión: Dependiendo del tipo de daño básico, se recluta una ADN glicosilasa específica, mono o bifuncional, en el sitio dañado. Mientras que la acción secuencial de una glicosilasa monofuncional favorece los eventos de reparación de parches largos, la glicosilasa bifuncional impulsa la BER de parche corto.

Estado del ciclo celular: las principales proteínas participantes que distinguen la BER de parche largo de la vía alternativa de la BER de parche corto son el antígeno nuclear de células proliferativas (PCNA), el factor de replicación de proteínas C (RF-C) y la estructura del colgajo. endonucleasa específica 1 (FEN1). PCNA es particularmente reconocido como el eje de esta vía. Actúa como andamio para anclar la polimerasa en el sitio dañado y se une a FEN-1 para facilitar su actividad nucleasa. Además, se requiere RF-C para cargar el PCNA en el ADN. Todas estas proteínas también son necesarias durante la replicación del ADN, lo que sugiere que el BER de parche largo repara los daños al ADN en replicación, mientras que el parche corto se utiliza para reparar el ADN en reposo.

Escasez de ATP: También se ha observado que, si bien en condiciones fisiológicas normales predomina la BER de un solo nucleótido o de parche corto, en condiciones de escasez de ATP, la preferencia se desplaza hacia la BER de parche largo. Esto se debe a que la poli(ADP-ribosa) puede servir como fuente única de ATP durante el paso de ligadura en BER.