Retrotransposones LTR

La mayoría de los genomas eucariotas contienen un grupo único de elementos transponibles llamados retrotransposones o transposones de clase I.

A diferencia de los transposones de solo ADN o los transposones de Clase II, los retrotransposones emplean un mecanismo de "copiar y pegar", lo que significa que una copia del transposón se mueve a un nuevo sitio en el genoma.

Hay dos tipos de retrotransposones: los retrotransposones de repetición terminal larga, o LTR, y los retrotransposones no LTR, los cuales utilizan diferentes mecanismos de transposición.

Los retrotransposones LTR consisten en una región codificante de proteínas de 5-7 kb de largo flanqueada en ambos extremos por largas repeticiones terminales, típicamente de 250-600 pb de longitud.

Estos LTRs contienen secuencias potenciadoras y promotoras para la transcripción.

La región codificante es muy similar a la del genoma retroviral, y consta de genes estrechamente relacionados con el gag y el pol de los retrovirus. Por lo tanto, los retrotransposones LTR también se conocen como retrotransposones similares a los retrovirales.

Sin embargo, a diferencia de los retrovirus, los retrotransposones LTR no codifican el gen "env" y, por lo tanto, no pueden formar una envoltura viral.

Mientras que el gen pol codifica enzimas como la proteasa, la transcriptasa inversa, la integrasa y la ARNasa H, el gen gag codifica proteínas estructurales que pueden formar una partícula similar a un virus.

El mecanismo de transposición de los elementos LTR también se asemeja a la replicación retroviral en las células huésped.

Primero, la ARN polimerasa II de la célula huésped se une a la LTR 5' y comienza a transcribir el retrotransposón en una sola cadena de ARN.

Luego, las enzimas de la célula huésped procesan el ARN intermedio para agregar una tapa 5' y una cola de poliA 3'.

A continuación, el ARN maduro se transporta al citoplasma y se traduce en proteínas. Luego, el ARNm y los productos proteicos se ensamblan para formar una partícula similar a un virus. Es dentro de esta partícula similar a un virus que el ARN se transcribe de forma inversa en una copia de ADN monocatenario.

A esto le sigue la degradación de la cadena de ARN por la ARNasa H y la síntesis de una cadena de ADN complementaria que conduce a un ADN bicatenario.

Este ADN lineal de doble cadena está unido por la integrasa en ambos extremos para formar un complejo estable llamado intasoma que puede transportarse de vuelta al núcleo e insertarse en una nueva ubicación en el genoma del huésped.

Los retrotransposones LTR pueden hacer varias copias de sí mismos en la misma célula utilizando este mecanismo de replicación.