Retrotransposones no LTR

Los retrotransposones no LTR son un tipo de transposones de clase I que actualmente representan aproximadamente el 17% del genoma humano. A diferencia de los retrotransposones LTR con sus características repeticiones terminales largas, los retrotransposones no LTR reciben su nombre por la falta de estos motivos. Los retrotransposones no LTR se subdividen en dos categorías: elementos nucleares intercalados largos, o LINE, y elementos nucleares intercalados cortos, o SINE.

Mientras que los LINE son autónomos y pueden codificar proteínas esenciales para su movilización, los SINE son retrotransposones no autónomos y requieren proteínas codificadas por otros elementos para su movilización. Por ejemplo, los elementos L1, un tipo de retrotransposón LINE y uno de los pocos transposones autónomos activos en humanos, son elementos de aproximadamente 6 kb de largo que contienen dos marcos de lectura abiertos. ORF1 codifica para una proteína con actividades de unión y chaperona de ARN. ORF2 codifica para una proteína con dominios de transcriptasa inversa y endonucleasa.

Ambas proteínas son esenciales para la movilización del elemento L1. Dentro del núcleo, la ARN polimerasa II primero transcribe el elemento L1 en un ARN L1, que luego se poliadenila y se transporta al citoplasma para ser traducido en proteínas ORF1 y ORF2. Ambas proteínas se asocian con el ARN L1 para formar una ribonucleoproteína L1, o RNP. La RNP L1 se importa de nuevo al núcleo, donde utiliza su actividad endonucleasa para hacer muescas escalonadas en el sitio objetivo rico en AT.

A continuación, la transcriptasa inversa utiliza el extremo 3' suelto de una de las hebras de ADN como cebador para la transcripción inversa del ARN L1. Este proceso se denomina transcripción inversa preparada para el sitio objetivo. A continuación, el ARN L1 se digiere mientras que una ADN polimerasa celular comienza a extender el extremo 3' OH de la cadena de ADN complementaria utilizando la cadena de ADN recién sintetizada como plantilla. Finalmente, los extremos del elemento L1 recién sintetizado son sellados por las enzimas huésped, lo que resulta en la duplicación del sitio objetivo.

A diferencia de las LINE, las SINE solo tienen una longitud de alrededor de 100-400 pb y no pueden codificar las proteínas necesarias para su transposición. Sin embargo, la mayoría de los elementos SINE contienen características estructurales, como una secuencia rica en AT 3' que, tras la transcripción, les permite ser reconocidos por las proteínas codificadas por LINE. Esto facilita su integración en el genoma a través del mismo proceso de copia que los elementos LINE.