7.15: Retrotransposones no LTR

Como su nombre indica, los retrotransposones no LTR carecen de las largas repeticiones terminales características de los retrotransposones LTR. Además, tanto los retrotransposones LTR como los no LTR utilizan distintos mecanismos de movilización. Los retrotransposones no LTR se dividen a su vez en dos clases: elementos nucleares intercalados largos (LINE) y elementos nucleares intercalados cortos (SINE), los cuales se encuentran abundantemente en la mayoría de los mamíferos, incluidos los humanos. Algunos de los retrotransposones activos no LTR en humanos son los elementos L1 (LINE) y los elementos Alu (SINE).

La transposición suele ser una ocurrencia fortuita, lo que significa que la ubicación donde se inserta el elemento transponible es aleatoria. Los transposones que se insertan aleatoriamente en los genes pueden interferir con la expresión génica y causar disfunciones genéticas. Un ejemplo clásico es la inserción del retrotransposón L1 en el gen del factor VIII que causa la hemofilia. Integración de L1 en el gen supresor de tumores La poliposis adenomatosa coli (APC) también se ha encontrado en pacientes con cáncer de colon. El elemento seno Alu causa aberraciones cromosómicas y también se ha relacionado con defectos congénitos como la neurofibromatosis.

El mecanismo celular para la represión de los retrotransposones implica modificaciones químicas como la metilación de los elementos LINE o la producción de retrotransposones truncados. La gran mayoría de los elementos LINE y SINE en el genoma humano están truncados en su extremo 5′ debido a una transcripción inversa errónea. Estos retrotransposones suelen ser silenciosos, lo que significa que no afectan a la expresión génica después de la inserción.

La presencia de retrotransposones en células cancerosas se ha aprovechado para desarrollar retrotransposones como L1, como biomarcadores de cáncer. Se ha observado que la metilación de L1 se reduce significativamente en las células cancerosas. Este tipo de hipometilación conduce a la inestabilidad genómica. Los niveles de L1 hipometilada se han investigado como biomarcadores de neoplasias malignas como el cáncer de mama, colon y piel.