Escaneo con fugas

Durante la traducción eucariota, los ribosomas escanean el ARNm comenzando desde el extremo 5' hasta que encuentran la primera secuencia AUG, el codón de inicio, e inician la síntesis de proteínas.

Sin embargo, un ARNm puede tener dos o más codones AUG contenidos en su secuencia. Los ribosomas a veces no reconocen el primer codón AUG y, en cambio, comienzan la síntesis de proteínas a partir de un codón de inicio más abajo en la cadena de ARNm.

Este fenómeno se denomina escaneo permeable y permite la producción de múltiples tipos de proteínas a partir del mismo ARNm.

Una secuencia de consenso particular, conocida como la secuencia de Kozak, determina si un ribosoma iniciará la síntesis de proteínas en el primer codón de inicio o lo omitirá. En esta secuencia, la A del primer codón de inicio AUG se numera como +1. Los nucleótidos posteriores son positivos y los nucleótidos anteriores son negativos.

La secuencia óptima ocurre cuando una purina está presente en la posición -3 y una guanina está presente en la posición +4. En la posición -3, la adenina es más eficaz que la guanina para iniciar la traducción.

Los cambios en el resto de la secuencia de nucleótidos tienen poca influencia en la síntesis de proteínas.

Cuando existe una secuencia óptima, casi todos los ribosomas iniciarán la síntesis de proteínas en este codón AUG.

Por el contrario, si una purina en la posición -3 o una guanina en la posición +4 están ausentes, solo algunos ribosomas iniciarán la traducción en el primer codón AUG. La mayoría de los ribosomas se saltarán este codón de inicio, continuarán escaneando el ARNm e iniciarán la traducción en un codón de inicio posterior dentro de una secuencia de reconocimiento óptima.

En el escaneo con fugas, si ambos codones tienen el mismo marco de lectura, las proteínas producidas diferirán solo en sus N-terminales. Esto permite a las células producir proteínas sin una señal específica de orgánulo en el extremo N-terminal, por ejemplo.

Por otro lado, si el codón de inicio aguas abajo tiene un marco de lectura diferente al del primer codón de inicio, puede conducir a la producción de tipos de proteínas completamente diferentes.