Sistema de clasificación microbiana

La clasificación es el proceso de organizar organismos en grupos jerárquicamente inclusivos basados en sus similitudes fenotípicas o en sus relaciones evolutivas. Una especie comprende una o más cepas, y las especies estrechamente relacionadas se agrupan en géneros. Los géneros se clasifican a su vez en familias, las familias en órdenes, los órdenes en clases, y así sucesivamente, hasta el nivel de dominio, que representa el rango taxonómico más amplio, derivado de una combinación de datos fenotípicos y genotípicos.

La nomenclatura de los organismos sigue el sistema binomial desarrollado por Carl Linnaeus, en el cual a cada organismo se le asigna un nombre de género y un epíteto específico, escritos en cursiva. La denominación de nuevos taxones microbianos está regulada por el Comité Internacional de Sistemática de los Procariotas (ICSP), que supervisa el Código Internacional de Nomenclatura de Bacterias (también conocido como el Código Bacteriológico). Este código establece los procedimientos formales necesarios para su validación. El nombre de una nueva especie debe ir acompañado de una descripción detallada de sus características distintivas y de la deposición de cultivos viables en al menos dos colecciones internacionales. Cuando los organismos no pueden ser cultivados o obtenidos en forma pura, se les asigna un nombre provisional con el prefijo “Candidatus”. Por ejemplo: Candidatus Pelagibacter ubique (una especie bacteriana muy extendida y de difícil cultivo en laboratorio), Candidatus Heliomonas lunata (una especie bacteriana que no puede cultivarse como cultivo puro en laboratorio). Listas actualizadas y validadas de bacterias y arqueas se encuentran disponibles en Listado de nombres procariotas con posición en nomenclatura (http://www.bacterio.net) y Nomenclatura procariota actualizada (http://www.dsmz.de).

El Manual Sistemático de Bacteriología de Bergey es el sistema de clasificación más ampliamente reconocido para bacterias y arqueas. Desde su publicación inicial en 1923, ha sido un recurso esencial para microbiólogos, ofreciendo información detallada que incluye tablas sistemáticas, figuras y herramientas de identificación. Otro recurso importante es The Prokaryotes, que proporciona amplias perspectivas sobre la fisiología, ecología, filogenia y cultivo de organismos procariotas.

Las colecciones nacionales de cultivos microbianos, como la American Type Culture Collection, la Belgian Coordinated Collection of Microorganisms, la Colección del Institut Pasteur, entre muchas otras, desempeñan un papel fundamental en la sistemática microbiana. Estos repositorios almacenan cultivos viables en condiciones que preservan su integridad genética, asegurando su accesibilidad para la investigación y la conservación de la biodiversidad. A diferencia de los especímenes tradicionales de museo, estos cultivos se mantienen en estado vivo, lo que permite su estudio y caracterización continuos. Tales colecciones también protegen cepas tipo, que sirven como puntos de referencia para futuras comparaciones taxonómicas.