9.6
Microbial Phylogeny
Un árbol filogenético representa relaciones evolutivas entre microorganismos y a menudo depende de secuencias de ADN, ARN o proteínas.
En los filogramas, las especies aparecen en las puntas, y la longitud de las ramas refleja la cantidad de cambio de secuencia.
Los árboles enraizados marcan ancestros comunes y puntos de divergencia, mientras que los árboles sin raíces muestran vínculos sin dirección evolutiva.
Los árboles filogenéticos utilizan secuencias homólogas, especialmente ortólogos, que son genes homólogos separados por especiación.
Los genes de subunidad rRNA pequeña altamente conservados, como el gen 16S rRNA, actúan como marcadores universales para comparaciones microbianas.
El ADN de estos genes marcadores en las muestras se secuencia.
Las secuencias se alinean para identificar desajustes y huecos derivados de inserciones o eliminaciones.
Luego, la distancia evolutiva se mide como la relación entre las diferencias de nucleótidos y el número total de posiciones alineadas.
Los árboles filogenéticos a veces pueden ser engañosos cuando rasgos similares evolucionan de forma independiente o cuando la transferencia horizontal de genes introduce genes a través de linajes no relacionado
Comprender las relaciones evolutivas entre microorganismos es fundamental para la ecología y la taxonomía microbianas. Los árboles filogenéticos son h…
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