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Los ambientes marinos suelen ser pobres en nutrientes, favoreciendo microbios oligotróficos, que tienden a tener tamaños celulares más pequeños en comparación con sus homólogos de agua dulce.
La actividad de marea provoca fluctuaciones de salinidad en estuarios y zonas costeras, apoyando una abundancia de microbios halotolerantes. Estas regiones se vuelven anóxicas de forma intermitente debido a las altas tasas de respiración, lo que permite que las bacterias reductoras de sulfato prosperen y produzcan sulfuro de hidrógeno.
Los 100 a 200 metros superiores de aguas marinas pelágicas contienen la zona fótica, donde los nutrientes se reciclan continuamente a través del bucle microbiano.
Pequeños microbios heterótrofos consumen la materia orgánica disuelta en el mar, que incluye la fotosintato de fotoautótrofos y los restos particulados de la lisis celular.
Los protistas heterotróficos más grandes se alimentan de microbios más pequeños y generan materia orgánica en partículas para el plancton más grande.
Los entornos marinos a menudo experimentan cambios disruptivos. Por ejemplo, los vertidos de petróleo pueden estimular proliferaciones de bacterias degradadoras de hidrocarburos.
El calentamiento global está ampliando las zonas con mínimo ojigeno al aumentar la estratificación y reducir el suministro de oponígeno a capas más profundas, alterando la ecología marina.
Los ecosistemas microbianos marinos están moldeados por límites fisicoquímicos distintos, incluyendo alta salinidad, baja disponibilidad de nutrientes…
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