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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Fuente: LaRiviere, W. B., et al. Detección de glicosaminoglicanos mediante electroforesis en gel de poliacrilamida y tinción de plata. J. Vis. Exp. (2021)
En este video, demostramos un procedimiento para la tinción combinada de azul alcián y plata de fragmentos de oligosacáridos de glicosaminoglicanos sulfatados. Esta técnica de tinción combinada amplifica significativamente las bandas de polímeros de glicosaminoglicanos de diferentes longitudes en geles de poliacrilamida.
1. Protocolo de tinción de plata
Tabla 1: Soluciones necesarias para la tinción con plata de glicosaminoglicanos separados por electroforesis en gel de poliacrilamida. Todas las soluciones deben filtrarse (0,22 μm) antes de su uso.
| NOTA: Todas las soluciones deben filtrarse (0.22μm) antes de su uso. | |||
| solución | receta | composición | Comentarios |
| Solución de tinción de azul alcián (500mL) | Polvo azul alcián 8GX | 2,5 g | Concentración deseada: 0,5% p/v |
| 2% v/v de ácido acético glacial | 500 ml | ||
| Tinción de plata (200 mL) | Agua desionizada | 192.7 mL | Prepare la solución para manchas fresca; úsela dentro de una semana. |
| Hidróxido de sodio 7.6M | 2 mL | Para hacerlo, agregue 3,04 g de gránulos de hidróxido de sodio a 10 ml de agua | |
| Hidróxido de amonio | 3.3 mL | ||
| Solución de nitrato de plata 4M | 2 mL | Para hacerlo, agregue 3.397 g de nitrato de plata a 5 mL de agua. Agregue gota a gota mientras revuelve para evitar la precipitación. | |
| Solución en desarrollo (501 mL) | Agua desionizada | 500 mL | La solución en desarrollo debe hacerse fresca y usarse dentro de las 24 horas. |
| 2,5% p/v de ácido cítrico | 1 mL | Para hacerlo, agregue 100 mg a 4 ml de agua desionizada. El ácido cítrico debe elaborarse fresco. | |
| Formaldehído | 250μL | ||
| Solución de parada (500 mL) | Agua desionizada | 300 mL | |
| Ácido acético glacial | 20 mL | ||
| metanol | 90 mL | ||
| Azul Alcián 8GX (sólido) | ThermoFisher Scientific | AC400460100 | |
| Hidróxido de amonio (líquido) | ThermoFisher Scientific | A669S-500 | Certificado ACS |
| Sistema de purificación de agua Barnstead GenPure Pro | ThermoFisher Scientific | 10-451-217PKG | Cualquier sistema de desionización/purificación de agua es un sustituto aceptable |
| Ácido acético glacial (líquido) | ThermoFisher Scientific | A35-500 | Certificado ACS |
| Metanol (líquido) | ThermoFisher Scientific | A412-500 | Certificado ACS |
| Nitrato de plata (sólido) | ThermoFisher Scientific | S181-25 | Certificado ACS |
| Hidróxido de sodio (sólido) | ThermoFisher Scientific | S392-212 | |
| Unidad de filtro de vacío, de un solo uso, PES de poro de 0,22 uM, volumen de 500 ml | ThermoFisher Scientific | 569-0020 | Volúmenes alternativos y materiales de filtrado aceptables |
| Sistema de imagen molecular Gel Doc XR | Bio-Rad | 170-8170 | Cualquier sistema de imágenes en gel comparable es un sustituto aceptable |