Transformación bacteriana: El método por choque térmico

Transformación bacteriana es un método ampliamente utilizado donde se introduce ADN extraño en una bacteria, que entonces puede amplificar o clonar el ADN. Las células que tienen la capacidad para fácilmente tomar este ADN se denominan células competentes. Aunque la transformación se produce naturalmente en muchos tipos de bacterias, los científicos han encontrado maneras de inducir artificialmente y mejorar la capacidad de una célula bacteriana. En este video vamos a hablar sobre una de estas maneras, transformación de choque de calor.

Antes de hablar de la técnica de choque de calor, vamos a discutir primero el tipo de ADN más comúnmente-utilizado en la transformación bacteriana: el plásmido. Un plásmido es un pequeño, circular, doble cadena de ADN que puede reducir su tamaño por superenrollamiento, por lo que puede pasar fácilmente a través de poros en la membrana de la célula.

Un plásmido contiene algunas regiones importantes digno de mencionar. Plásmidos disponibles comercialmente contienen un sitio de clonación múltiple o MCS. Esta región contiene secuencias específicas reconocidas por endonucleasas de restricción o enzimas de restricción, que hender la DNA. Fragmentos de ADN de interés para el investigador pueden introducirse en el sitio de clonación múltiple del plásmido y el fragmento de ADN se cortan con las endonucleasas mismo.

Plásmidos también contienen un origen de replicación, o ORI, que proporciona información a la celda donde debe comenzar la replicación del plásmido.

Además el origen de replicación y el sitio de clonación múltiple, la mayoría de plásmidos incluirá un gen de resistencia a los antibióticos. Este gen confiere resistencia a los antibióticos a todas las celdas que contienen el plásmido, permitiendo que esas células a sobrevivir en el antibiótico que contiene los medios de comunicación.

Ahora que hemos analizado plásmidos, vamos a hablar de las células en que se presentará: las células competentes. La más comúnmente utilizada tipo de bacterias en la investigación de la biología molecular y transformación es e. coli, que también habitan el intestino inferior. Las células típicamente se hacen competentes a través de la exposición a un ambiente rico de calcio.

Las cargas positivas de los iones de calcio neutralizan las cargas negativas de los plásmidos y la pared celular bacteriana disipando la repulsión electrostática y debilitamiento de la pared celular.

Al exponer las células a un aumento repentino en la temperatura o choque térmico, se crea una diferencia de presión entre el exterior y el interior de la célula, que induce la formación de poros, a través del cual se puede introducir DNA plasmídico superenrollado. Después de regresar a las células a una temperatura normal, la pared celular le self-heal.

Una vez que las células han tomado en el plásmido, serán capaces de crecer en placas de agar con antibióticos.

Antes de comenzar la transformación de choque de calor, limpiar área de trabajo y asegúrese de que todos los equipos son esterilizados.

Asegúrese de que tiene suficientes medios y preparado, de agar que proporcionan la nutrición a las bacterias que competente. También asegúrese de esterilizar todas las soluciones mediante autoclave. Permite medio líquido a enfriar a temperatura ambiente antes de su uso y deje enfriar el agar a 50-55˚C, la temperatura a la que pueden añadirse antibióticos y vertieron de placas. Permita que las placas se enfríe a temperatura ambiente para solidificar.

Cuando se trabaja con bacterias, uno siempre debe utilizar técnica aséptica para mantener la esterilidad. Técnica aséptica implica típicamente el uso de un mechero de Bunsen para esterilizar instrumentos y reactivos y crear una convección actual – que mantiene contaminantes en el aire en el espacio de trabajo.

Inmediatamente antes de la reacción de choque de calor, caliente previamente sus medios a la temperatura ambiente y que contiene el antibiótico LB las placas de agar a 37 ° C. También asegúrese de que su baño esté a 42° C.

A continuación, descongelar células químicamente competentes en el hielo.

Agregar, 1-5uL de 1ng/μL frío plásmido a las células bacterianas, mezclar suavemente y devolver la mezcla celular y plásmido de hielo durante 30 minutos.

Cuando el tiempo está para arriba, calor descarga la mezcla de células y plásmido colocando en un baño de agua a 42˚C durante 30 segundos.

Inmediatamente después de tomar el tubo de la bañera de agua ponlo en hielo y añadir 450μL de medios de comunicación. Colóquelo en una agitación incubadora de 37° C durante 1 hora a más de 225 rpm para que las células pueden recuperar.

Utilizando una técnica aséptica adecuada, añadir bacterias 20-200uL a una placa de agar LB y difundir el medio alrededor con un esparcidor bacteriano. Incubar las placas durante la noche en 37˚C boca abajo para prevenir la exposición de las bacterias a condensación.

Al día siguiente, las bacterias que han tenido en el plásmido forman colonias.

A continuación, cuente las colonias para calcular la eficiencia de transformación, que es el número de transformantes éxito dividido por la cantidad total de ADN plateado.

Ahora, las colonias pueden seleccionarse para más experimentación.

Antes de hacerse competentes las bacterias utilizadas en la transformación se almacenan en el congelador. Debe ser descongelados en el hielo, extender sobre una placa de agar, sin antibióticos y permitió crecer durante la noche en 37˚C.

Utilizando una técnica aséptica, seleccionar una colonia de bacterias de la placa de agar y crecer en una cultura grande 500 ml durante la noche en 37˚C en un incubador de agitación – un instrumento, que evita la sedimentación de las bacterias y la dispersión uniforme de nutrientes en los medios de comunicación.

Mientras que las células están creciendo hacer 0.1 molar cloruro de calcio y 0,1 molar cloruro de calcio además de soluciones de glicerol al 15%, autoclave y deje enfriar.

Las mediciones de absorbancia se utilizan para determinar si es o no la bacteria en su fase de registro medio de crecimiento, lo cual significa que fácilmente se ocupan de ADN. Una vez que las células han alcanzado esta fase, coloque en hielo y mantenerlos allí durante todo el procedimiento.

A continuación, separar las células bacterianas en dos tubos de centrífuga grande y centrifugar a 4° C. Retirar el sobrenadante y resuspender en 100 ml 0.1 molar frío de cloruro de calcio. Luego, incubar las células en hielo durante 30 minutos. Este paso se repite al menos una vez más. Ciclos de spinning y resuspender las células se refieren a menudo como lavar las células.

Después del último lavado, resuspender las células en un frío 50mL 0.1 molar cloruro de calcio además de solución de glicerol 15%. Estas células son ahora químicamente competentes.

Distribuir 50μL de bacterias en varios tubos de microcentrífuga y conservarlo a - 80˚C hasta que esté listo para el choque del calor.

Existen muchas aplicaciones y variaciones de transformación bacteriana.

Además de golpes de calor, eletroporation es otra técnica común para la transformación. Como su nombre lo indica electroporación implica el uso de electricidad para hacer poros en la membrana celular bacteriana a través del cual el ADN puede pasar.

Con respecto a la detección de bacterias transformadas, plásmidos a menudo contienen un gen que codifica la enzima beta-galactosidasa para ayudar con la investigación. Cuando el sustrato para esta enzima está incluido en las placas de agar, las bacterias que han sido transformadas con plásmidos que contienen un relleno producen colonias blancas, mientras que los que no lo hacen, la producción de colonias azules. Este método se conoce como proyección azul y blanco.

En experimentos de transformación de la mayoría el objetivo es obtener rápidamente dividiendo las bacterias para hacer grandes cantidades de su plásmido, que incluye el gene de la blanco. Después de la transformación bacteriana, el siguiente paso es crecer grandes cantidades de bacterias en medio líquido que contiene antibiótico y purificación del plásmido, que, como su nombre lo indica, consiste en la purificación de la plásmidos de las bacterias. Muchos kits comerciales están disponibles para este propósito.

A veces el objetivo de transformación es que las bacterias generan grandes cantidades de la proteína codificada por el plásmido. Aquí puede ver las células bacterianas se homogeneizó y lisis antes de una técnica llamada purificación de afinidad puede realizarse para aislar la proteína diana. Después de purificar grandes cantidades de la proteína puede ser cristalizado luego y estructura de la proteína particular de interés puede ser identificado.

Sólo ha visto JoVE Introducción a las transformaciones de choque de calor. En este video repasamos: Qué transformación de choque de calor es y cómo funciona, el director detrás de él y cómo éxito transformar bacterias. ¡Gracias por ver!