Una introducción a Saccharomyces cerevisiae

An Introduction to <em>Saccharomyces cerevisiae</em>
JoVE Science Education
Biology I: yeast, Drosophila and C. elegans
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JoVE Science Education Biology I: yeast, Drosophila and C. elegans
An Introduction to Saccharomyces cerevisiae

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10:48 min
May 10, 2013

Overview

Saccharomyces cerevisiae (comúnmente conocido como levadura del panadero) es una eucariotas unicelulares que se utilizan con frecuencia en la investigación científica. S. cerevisiae es un organismo modelo atractivo debido a que se ha secuenciado su genoma, su genética se manipulan fácilmente y es muy fácil de mantener en el laboratorio. Dado que muchas proteínas de la levadura son similares en secuencia y función a las encontradas en otros organismos, estudios realizados en levadura nos pueden ayudar a determinar cómo un gen particular o proteína funciona en eucariotas superiores (incluidos a los humanos).

Este video proporciona una introducción a la biología de este organismo modelo, cómo se descubrió y por qué laboratorios en todo el mundo la han seleccionado como su modelo de elección. Estudios anteriores realizados en S. cerevisiae que han contribuido a nuestra comprensión de importantes procesos celulares tales como el ciclo celular, el envejecimiento y la muerte celular también se discuten. Finalmente, el video describe algunas de las muchas maneras en que las células de levadura se ponen a trabajar en la moderna investigación científica, incluyendo la purificación de proteínas y el estudio de ADN reparación de mecanismos y otros procesos celulares relacionados con enfermedades de Alzheimer y el Parkinson .

Procedure

Saccharomyces cerevisiae, también conocido como levadura, es uno de los muchos organismos modelo en laboratorios en todo el mundo. Ya se ha secuenciado su genoma, su genética se manipulan fácilmente y es fácil de mantener en el laboratorio, esta especie de levadura ha sido un recurso invaluable en la comprensión de los procesos celulares como la división celular y muerte celular. Este video le dará una visión general de este organismo modelo y su amplia gama de aplicaciones en investigación biológica y biomédica.

Levadura pertenecen al dominio Eukaryota, que está conformada por organismos con membrana-limite los núcleos, denominados eucariotas. Junto a hongos y mohos, S. cerevisiae pertenece a los hongos del Reino debido a la presencia de una pared celular hecha de quitina, un polímero de polisacárido que se encuentra en los hongos, sino también en los exoesqueletos de insectos y crustáceos.

Curiosamente, muchas proteínas que se encuentran en secuencias similares de parte de levadura con las proteínas de su compañero eucariotas. Estas proteínas suelen ser homólogas, y sus secuencias similares indican que los organismos comparten a un ancestro común. Investigando la función de una proteína dada en levadura, los investigadores ganan la penetración en función de la proteína en eucariotas superiores, como nosotros, los seres humanos.

En la naturaleza, S. cerevisiae se encuentra en ambientes cálidos, húmedos, con una fuente de azúcar a mano. Uno de su favoritos colgar hacia fuera puntos es el viñedo, donde habita en la piel de la uva.

S. cerevisiae tiene una forma ovoide a elipsoidal y es típicamente 5-10 micrómetros de diámetro cuando es visualizado mediante un microscopio de campo brillante.

Cuando las células eucariotas más se dividen por mitosis y citocinesis, hay una igual segregación del material genético y el citoplasma en las células hijas. Por otra parte, S. cerevisiae sufre división celular a través de un proceso llamado gemación.

Esta forma de reproducción asexual consiste en la formación de un brote recién sintetizado de la célula madre, que crece en tamaño a lo largo del ciclo celular hasta la citocinesis. A diferencia de la división de célula eucariota típica, no son iguales en tamaño después de la mitosis las dos células.

Ahora que hemos aprendido un poco acerca de S. cerevisiae como organismo, vamos a discutir lo que la hace un sistema de gran modelo para la investigación.

En primer lugar, las células de levadura crecen rápidamente y dividen aproximadamente cada 90 minutos. En segundo lugar, son fáciles de crecer y necesitan instrumentación y técnica simple para la propagación. En tercer lugar, siendo el primer organismo eucariótico que su genoma completo secuenciado, tiene todas sus secuencias del gene públicamente disponibles a través de la base de datos del genoma de la levadura S. cerevisiae .

Manipulación genética de la levadura también es muy práctico. La mayoría de S. cerevisiae de vectores, portadores de una secuencia de ADN de interés, son vectores de transporte. Vectores de transporte suelen ser plásmidos que pueden propagarse en dos diferentes especies, como e. coli y S. cerevisiae. Esto permite clonación molecular llevar a cabo en e. coli, digamos incorporar el gen para la proteína verde fluorescente de medusas en un vector de la lanzadera, que puede ser introducido en la levadura para hacerlos brillar.

El plásmido integrativo de la levadura es un tipo de vector de la lanzadera que permite la incorporación de ADN extraño en el genoma de la levadura a través de un proceso denominado recombinación homóloga. Recombinación homóloga es un intercambio de ADN entre secuencias coincidentes o similares que resulta en un cruce genético entre el vector y el anfitrión DNA genomic. Esto puede causar un gen para ser eliminado, o un gen para intercambiar con el otro. Además, puesto que la recombinación homóloga resultados en integración en el genoma del anfitrión, el cambio genético persiste después de la célula de levadura se divide.

Ahora que ya sabe lo que hace tan conveniente para el estudio de la levadura, vamos a echar un vistazo a por qué estos bichos poco han sido tan importantes científicamente. Un largo, largo tiempo atrás, en principios del 6 º milenio A.C., la levadura estaba implicada en la fermentación de las uvas para hacer vino. Levaduras más tarde desempeñó un papel de hornear pan en el antiguo Egipto.

No fue hasta 1856 que Luis Pasteur identificó S. cerevisiae como clave elaboración y horneado de pan microbio. Él clasifica la levadura como un anaerobio facultativo, que, en ausencia de oxígeno, pasa a la fermentación, un proceso que permite a la levadura a metabolizar los azúcares y produce alcohol como un subproducto. En este proceso, el piruvato, que es producido por la glucólisis, se reduce a acetylaldehyde, que luego, gracias a la conversión de NADH a NAD +, reducido a etanol, el ingrediente definitorio vino.

Salto adelante del siglo XX, el descubrimiento de las proteínas que regulan el ciclo celular fueron encontrados en la levadura por Hartwell y enfermera.

El ciclo celular es una serie de eventos celulares que incluye la correcta replicación y segregación del ADN nuclear antes de una célula se divide. La identificación de la proteína ciclina y dependiente de ciclina quinasa, junto con el cambio en su abundancia relativa a través de la interfase y la mitosis, sugiere que estas proteínas son reguladores claves de la división celular. La naturaleza altamente conservada de estas proteínas hace que su estudio en la levadura valiosa para entender el papel de Quinasas Ciclina-dependientes en los organismos multicelulares, tales como la desregulación del ciclo celular, que puede conducir a la división celular incontrolada, o cáncer.

Avanzar a 15 años más tarde, Blackburn, Greider y Szostak hizo estudios de avance en los telómeros de comprensión así como el descubrimiento de telomerases. Los telómeros son secuencias repetitivas de ADN en el extremo de un cromosoma que impiden que una degeneración del ADN genómico. La adición de estas secuencias repetitivas se lleva a cabo por telomerases en los 3′ que flanquea el extremo del cromosoma, y complementación de los nucleótidos es seguido por la polimerasa de ADN en el filamento del revestimiento termoaislante. Los telómeros tienen implicaciones en el envejecimiento como estos segmentos de ADN más cortas a lo largo de toda la vida de un organismo.

Incluso más recientemente, en 1992, Oshumi y sus colegas descubrieron genes que regulan la autofagia, una especie de reciclaje de celulares. Durante hambre de nutrientes, fungibles orgánulos son envuelto por un autophagosome. El autophagosome entonces fusible con un lisosoma para más romper organellar proteínas a aminoácidos esenciales para la fabricación de nuevas proteínas. Autofagia participa en los mecanismos celulares importantes que protegen contra la invasión de patógenos y el crecimiento del tumor.

Hay una amplia gama de aplicaciones para el estudio de la levadura. Levadura puede, por ejemplo, utilizarse para el estudio de mitofagia, que es la eliminación de las mitocondrias dañadas por autophagosomes. Este proceso tiene implicaciones en enfermedades como el Alzheimer y el Parkinson. En este video, es inducida la autofagia en las células de levadura con la adición de medio hambre de nitrógeno. A continuación, las células se preparan para microscopía de fluorescencia, para observar la mitofagia en hambre de nitrógeno de las células.

S. cerevisiae se utiliza para expresar y purificar grandes cantidades de proteínas, por ejemplo la fibrosis quística conductancia transmembrana regulador de la proteína. En este video, las células de levadura llevan el plásmido CFTR se cultivan en grandes culturas. A continuación, centrifugación de las células se lleva a cabo para separar los microsomas. Los microsomas son artifactual formado por el retículo endoplásmico cuando se interrumpen las células. Aislamiento y purificación de CFTR de microsomas permitirá a los científicos estudiar la estructura de la proteína mediante métodos como Cristalografía de rayos x.

La levadura puede utilizarse también como sistema modelo para estudios genéticos de proteínas de reparación de ADN humanos. Estas proteínas detectan y reparar el ADN dañado para evitar la proliferación de las células con un genoma defectuoso, como las células cancerosas. Aquí se puede apreciar a autores plateando las células de levadura con la transformada ADN reparación proteína WRN, en placas de medios selectivos. Morfología de la célula de los mutantes para AVS puede ser visualizado mediante microscopía de fluorescencia, y detección de esta proteína en el lisado celular se lleva a cabo mediante la ejecución de un gel de proteínas para análisis de Western Blot.

Sólo ha visto introducción de Zeus a S. cereviae. En este video repasamos: la historia de la célula y biología molecular y aplicaciones biomédicas de S. cerevisiae. Esperamos te haya gustado nuestro video, y os animamos a compartir con un brote.

Transcript

Saccharomyces cerevisiae, otherwise known as baker’s yeast, is one of the many model organisms studied in laboratories all over the world. Because it’s genome has been sequenced, its genetics are easily manipulated, and it is easy to maintain in the lab, this species of yeast has been an invaluable resource in the understanding of fundamental cellular processes such as cell division and cell death. This video will give you an overview of this model organism and its wide range of applications in biological and biomedical research.

Yeast belong to the domain Eukaryota, which is comprised of organisms with membrane-bound nuclei, referred to as eukaryotes. Along with mushrooms and molds, S. cerevisiae belongs to the Kingdom Fungi due to the presence of a cell wall made out of chitin, a polysaccharide polymer that’s found not only in Fungi, but also in the exoskeletons of insects and crustaceans.

Interestingly, many proteins found in yeast share similar sequences with proteins from their fellow Eukaryotes. These proteins are often homologous, and their similar sequences indicate that the organisms share a common ancestor. By investigating the function of a given protein in yeast, researchers gain insight into the protein’s function in higher eukaryotes, such as us, humans.

In nature, S. cerevisiae is found in warm, moist environments, with a source of sugar close at hand. One of its favorite hang out spots is the vineyard, where it dwells on grape skin.

S. cerevisiae has a round to ellipsoidal ovoid shape and is typically 5-10 micrometers in diameter when visualized using a bright field microscope.

When most eukaryotic cells divide via mitosis and cytokinesis, there is an equal segregation of genetic material and cytoplasm in daughter cells. On the other hand, S. cerevisiae undergoes cell division through a process called budding.

This form of asexual reproduction involves the formation of a newly synthesized bud from the mother cell, which grows in size throughout the cell cycle until cytokinesis. Unlike typical eukaryotic cell division, the two cells are not equal in size following mitosis.

Now that we’ve learned a bit about S. cerevisiae as an organism, let’s discuss what makes it a great model system for research.

First, yeast cells grow quickly and divide approximately every 90 minutes. Second, they are easy to grow, and need only simple technique and instrumentation for propagation. Third, being the first eukaryotic organism to have its entire genome sequenced, S. cerevisiae has all of its gene sequences publicly available via the yeast genome database.

Genetic manipulation of yeast is also extremely practical. Most S. cerevisiae vectors, carriers of a DNA sequence of interest, are shuttle vectors. Shuttle vectors are usually plasmids that can propagate in two different species, such as both E. coli and S. cerevisiae. This allows molecular cloning to be performed in E. coli, say to incorporate the gene for green fluorescent protein from jellyfish into a shuttle vector, which can be introduced in yeast to make them glow.

The yeast integrative plasmid is a type of shuttle vector which allows incorporation of foreign DNA into the yeast genome through a process called homologous recombination. Homologous recombination is an exchange of DNA between matching or similar sequences that results in a genetic crossover between the vector and host genomic DNA. This can cause a gene to be knocked out, or one gene to be swapped with another. In addition, since homologous recombination results in integration into the host genome, the genetic change persists after the yeast cell divides.

Now that you know what makes yeast so convenient for study, let’s have a look at why these little critters have been so important scientifically. A long, long time ago, in early 6th millennium B.C., yeast was involved in the fermentation of grapes to make wine. Yeast later played a role in baking bread in ancient Egypt.

It was not until 1856 that Luis Pasteur identified S. cerevisiae as the key wine-making and bread-baking microbe. He classified yeast as a facultative anaerobe, which, in the absence of oxygen, switches to fermentation, a process that allows yeast to metabolize sugars and produces alcohol as a byproduct. In this process, pyruvate, which is produced by glycolysis, is reduced to acetylaldehyde, which is then, thanks to the conversion of NADH to NAD+, reduced to ethanol, the defining ingredient in wine.

Jumping ahead to the 20th century, the discovery of proteins that regulate the cell cycle were found in yeast by Hartwell and Nurse.

The cell cycle is a series of cellular events that includes the proper replication and segregation of nuclear DNA before a cell divides. The identification of the protein cyclin and cyclin-dependent kinase, along with the change in their relative abundance through interphase and mitosis, suggested that these proteins are key regulators of cell division. The highly conserved nature of these proteins makes their study in yeast valuable for understanding the role of cyclin-dependent kinases in multicellular organisms, such as the dysregulation of the cell cycle, which can lead to uncontrolled cell division, or cancer.

Advancing to 15 years later, Blackburn, Greider, and Szostak made breakthrough studies in understanding telomeres as well as the discovery of telomerases. Telomeres are repetitive sequences of DNA at the end of a chromosome that prevent genomic DNA from degenerating. The addition of these repetitive sequences is carried out by telomerases at the 3’ flanking end of the chromosome, and complementation of nucleotides is followed by DNA polymerase in the lagging strand. Telomeres have implications in aging as these DNA segments get shorter throughout an organism’s lifetime.

Even more recently, in 1992, Ohsumi and his colleagues discovered genes regulating autophagy, a kind of cell recycling. During nutrient starvation, expendable organelles are engulfed by an autophagosome. The autophagosome will then fuse with a lysosome, in order to further break down organellar proteins to amino acids essential for making new proteins. Autophagy is involved in the important cellular mechanisms that protect against invading pathogens and tumor growth.

There are a wide range of applications for the study of yeast. Yeast can, for example, be used to study mitophagy, which is the removal of damaged mitochondria by autophagosomes. This process has implications in diseases such as Alzheimer’s and Parkinson’s. In this video, autophagy is induced in yeast cells with the addition of nitrogen starvation medium. Next, cells are prepared for fluorescence microscopy, in order to observe mitophagy in nitrogen-starved cells.

S. cerevisiae is used to express and purify large amounts of proteins, for example the cystic fibrosis transmembrane conductance regulatory protein. In this video, yeast cells carrying the CFTR plasmid are grown in large cultures. Next, centrifugation of the cells is carried out in order to separate the microsomes. Microsomes are artifactual vessels formed from the endoplasmic reticulum when cells are disrupted. Isolation and purification of CFTR from microsomes will allow scientists to study the structure of the protein by using methods such as x-ray crystallography.

Yeast can also be used as a model system for genetic studies of human DNA repair proteins. These proteins detect and fix damaged DNA in order to prevent proliferation of cells carrying a defective genome, such as cancer cells. Here you see authors plating yeast cells with the transformed DNA repair protein, WRN, on selective media plates. Cell morphology of mutants for WRN can be visualized using fluorescence microscopy, and detection of this protein in cell lysate is carried out by running a protein gel for Western Blot analysis.

You’ve just watched JoVE’s introduction to S. cereviae. In this video we reviewed: the history, cell and molecular biology, and biomedical applications of S. cerevisiae. We hope you enjoyed our video, and we encourage you to share it with a bud.