Silenciamiento de genes con morfolinos
Silenciamiento génico mediado morfolino es una técnica común utilizada para el estudio de funciones de genes específicos durante el desarrollo. Morfol…
Técnicas de silenciamiento de genes se utilizan comúnmente en el campo de la biología del desarrollo. Morfolino-precipitación enfoques habitualmente permiten a los investigadores identificar y caracterizar genes implicados en procesos celulares importantes. Morfolinos antisentidos son ahora muy populares en muchos sistemas de modelo, incluyendo ratones, pollos y peces cebra, debido a su alta eficacia, alta especificidad y bajo costo.
Este video le proporcionará una visión general de morfolino mecanismos y estrategias de la microinyección, controles experimentales fundamentales y cómo morfolinos se utilizan en los laboratorios de hoy en día para investigar el desarrollo de vertebrados.
Morfolinos primero fueron desarrollados como una forma de inhibir la traducción de los transcritos de RNA en las células vivas y organismos. En general, morfolinos son moléculas sintéticas de 25 oligonucleótidos conectados por una red neutral cargada.
Pero aunque morfolinos pueden parecerse mucho a DNA, que contienen anillos de morfolina en lugar de los grupos de azúcar encontrados la columna vertebral de azúcar fosfato. Esta conversión simple aumenta morfolino estabilidad en las células y reduce su costo de producción.
Dentro de las células, morfolinos están dirigidas al RNA de interés por la vinculación de base complementaria. La ubicación en el RNA donde se hibridiza el morfolino determina su mecanismo específico de acción.
Bloqueo de empalme morfolinos unen a uniones específicas e inhiben la transcripción correcta de procesamiento, mientras que traducción de bloqueo morfolinos enlazar dentro de lo 5' región sin traducir del gene de la cerca del sitio de inicio traslacional y prevenir el ensamblaje del ribosoma. Ambos tipos de morfolinos reducen la expresión de proteínas objetivo funcional.
Al planear un experimento usando morfolinos, hay algunas consideraciones importantes a tener en cuenta. Morfolinos pueden utilizarse en varios sistemas de modelo, por lo que es importante seleccionar un modelo que es capaz de abordar la cuestión biológica a la mano.
Morfolinos comercialmente se sintetizan y asistencia de profesionales del diseño está disponible sin costo para los investigadores, pero porque son secuencia-específica, información genética para todos los objetivos específicos morfolino debe locales antes de diseñar.
En el sistema de modelo de pez cebra, hay a menudo dos copias de genes que solo se encuentran en otros vertebrados, debido a un acontecimiento de la duplicación de todo el genoma que se produjo en un antepasado evolutivo del pez cebra. Por lo tanto, la caída de ambos genes del pez cebra puede ser necesario correctamente deficiencias de proteína de modelo en el desarrollo humano.
Diseño de controles experimentales bien es tan importante como diseñar tu destino morfolinos. Puede enlazar cualquier morfolino dado a secuencias específicas en genes diferentes. Es recomendable utilizar independiente, sin traslapo morfolinos complementarios para el mismo gen, con el fin de asegurar que un cambio fenotípico observado es debido a la caída de su gen de interés.
Ahora que hemos abordado diseño experimental morfolino, echemos un vistazo a cómo se introducen morfolinos en pez cebra.
Aquí, describimos morfolino microinyección en pez cebra. Para más información e instrucciones sobre los detalles de microinyección, por favor, referencia la enseñanza de las Ciencias JoVE video titulado "Técnicas de microinyección de pez cebra."
Morfolinos normalmente se inyectan en embriones de pez cebra entre la etapa una y cuatro celdas, en la yema de huevo o citoplasma de la célula. Conexiones citoplasmáticas entre las células embrionarias permiten rápida difusión y entrega ubicua de morfolinos soluble en agua en el organismo. Morfolinos son estables en las células, ya que el embrión del pez cebra se eleva a 28,5 ° C.
Volúmenes y concentraciones de inyección óptimo deben probarse empíricamente para cada morfolino. Normalmente, se utiliza la dosis más baja a la que hay un fenotipo definido confiable en al menos 50-75% de los embriones inyectados para evitar la mortalidad embrionaria o efectos no deseados fuera del objetivo.
La mayoría morfolino pez cebra fenotipos se identifican en la primera tres días tras la fertilización, y silenciamiento del gen es generalmente eficaz hasta el día cinco. En el caso de bloqueo de empalme morfolinos, RT-PCR puede utilizarse para identificar cantidades relativas de las transcripciones nativas y modificadas. Para bloqueo de traducción morfolinos, niveles de precipitación del gene pueden evaluarse mediante Western blot.
El rápido desarrollo externo y la transparencia de los embriones de pez cebra permite la fácil observación de muchos procesos biológicos tempranos. Fenotipos de morfolino comúnmente pueden ser anotó mediante el análisis de la morfología mediante microscopía brightfield o fluorescencia, así como mediante la evaluación de comportamiento.
Después de que se ha definido el fenotipo morfolino, rescate de RNA puede realizarse para demostrar la especificidad de la blanco. Tras la caída de morfolino del mRNA endógeno, mRNA sintético se inyecta, que codifica la proteína misma, pero no contiene la secuencia de destino morfolino. Si este ARN inyectado es capaz de restablecer el fenotipo tipo silvestre del organismo, entonces podemos concluir que el fenotipo observado morfolino es específicamente por el gene de la blanco consiguiendo derribado.
Ahora que tienes una idea para qué son los morfolinos y experimentos de morfolino cómo controlados se pueden realizar, echemos un vistazo a cómo morfolinos se están aplicando en los laboratorios biológicos hoy.
En biología celular, morfolinos sirven para entender los procesos de desarrollo tempranos. Flujo generado por cilios en vesícula de Kupffer es un ejemplo que controla patrones de izquierda a derecha en el pez cebra. Flujo corre hacia la izquierda en embriones de control inyectado, mientras que el silenciamiento de un gen que regula la organización de células ciliadas interrumpe la dirección y velocidad del fluido.
Morfolinos también son muy adecuados para la rápida y confiable modelo de enfermedades genéticas humanas. Fenotipos de pérdida de función se pueden reproducir fácilmente mediante la manipulación de la expresión de la proteína, como se ve en un modelo de pez cebra de displasia humano mostrando quistes renales, edema pericárdico y una cola encrespada. Además, las mutaciones patógenas pueden rápidamente ensayarse en vivo mediante el uso de tipo salvaje o mutante mRNA para rescatar morfolino fenotipos de la enfermedad.
Desde morfolinos pueden introducirse en las células vivas de diferentes maneras, son valoradas en el estudio de desarrollo y la regeneración de órganos. Microinyección, seguido por el estímulo eléctrico de morfolinos en tejidos específicos ha permitido a los investigadores a estudiar el crecimiento de la aleta y formación de la retina de pez cebra adulto.
Sólo ha visto introducción de Zeus al silenciamiento génico con morfolinos. En este video, hemos discutido la estructura y mecanismo de morfolinos, aplicaciones comunes para el uso y maneras importantes para evaluar la eficacia y los efectos de silenciamiento de genes específicos. Porque son de fáciles diseño, morfolinos altamente específicas y rentables, serán siendo un jugador importante en el campo de la genética reversa, ayudando a analizar funcionalmente genes implicados en la enfermedad y el desarrollo. ¡Gracias por ver!
Técnicas de silenciamiento de genes se utilizan comúnmente en el campo de la biología del desarrollo. Morfolino-precipitación enfoques habitualmente permiten a los investigadores identificar y caracterizar genes implicados en procesos celulares importantes. Morfolinos antisentidos son ahora muy populares en muchos sistemas de modelo, incluyendo ratones, pollos y peces cebra, debido a su alta eficacia, alta especificidad y bajo costo.
Este video le proporcionará una visión general de morfolino mecanismos y estrategias de la microinyección, controles experimentales fundamentales y cómo morfolinos se utilizan en los laboratorios de hoy en día para investigar el desarrollo de vertebrados.
Morfolinos primero fueron desarrollados como una forma de inhibir la traducción de los transcritos de RNA en las células vivas y organismos. En general, morfolinos son moléculas sintéticas de 25 oligonucleótidos conectados por una red neutral cargada.
Pero aunque morfolinos pueden parecerse mucho a DNA, que contienen anillos de morfolina en lugar de los grupos de azúcar encontrados la columna vertebral de azúcar fosfato. Esta conversión simple aumenta morfolino estabilidad en las células y reduce su costo de producción.
Dentro de las células, morfolinos están dirigidas al RNA de interés por la vinculación de base complementaria. La ubicación en el RNA donde se hibridiza el morfolino determina su mecanismo específico de acción.
Bloqueo de empalme morfolinos unen a uniones específicas e inhiben la transcripción correcta de procesamiento, mientras que traducción de bloqueo morfolinos enlazar dentro de lo 5' región sin traducir del gene de la cerca del sitio de inicio traslacional y prevenir el ensamblaje del ribosoma. Ambos tipos de morfolinos reducen la expresión de proteínas objetivo funcional.
Al planear un experimento usando morfolinos, hay algunas consideraciones importantes a tener en cuenta. Morfolinos pueden utilizarse en varios sistemas de modelo, por lo que es importante seleccionar un modelo que es capaz de abordar la cuestión biológica a la mano.
Morfolinos comercialmente se sintetizan y asistencia de profesionales del diseño está disponible sin costo para los investigadores, pero porque son secuencia-específica, información genética para todos los objetivos específicos morfolino debe locales antes de diseñar.
En el sistema de modelo de pez cebra, hay a menudo dos copias de genes que solo se encuentran en otros vertebrados, debido a un acontecimiento de la duplicación de todo el genoma que se produjo en un antepasado evolutivo del pez cebra. Por lo tanto, la caída de ambos genes del pez cebra puede ser necesario correctamente deficiencias de proteína de modelo en el desarrollo humano.
Diseño de controles experimentales bien es tan importante como diseñar tu destino morfolinos. Puede enlazar cualquier morfolino dado a secuencias específicas en genes diferentes. Es recomendable utilizar independiente, sin traslapo morfolinos complementarios para el mismo gen, con el fin de asegurar que un cambio fenotípico observado es debido a la caída de su gen de interés.
Ahora que hemos abordado diseño experimental morfolino, echemos un vistazo a cómo se introducen morfolinos en pez cebra.
Aquí, describimos morfolino microinyección en pez cebra. Para más información e instrucciones sobre los detalles de microinyección, por favor, referencia la enseñanza de las Ciencias JoVE video titulado "Técnicas de microinyección de pez cebra."
Morfolinos normalmente se inyectan en embriones de pez cebra entre la etapa una y cuatro celdas, en la yema de huevo o citoplasma de la célula. Conexiones citoplasmáticas entre las células embrionarias permiten rápida difusión y entrega ubicua de morfolinos soluble en agua en el organismo. Morfolinos son estables en las células, ya que el embrión del pez cebra se eleva a 28,5 ° C.
Volúmenes y concentraciones de inyección óptimo deben probarse empíricamente para cada morfolino. Normalmente, se utiliza la dosis más baja a la que hay un fenotipo definido confiable en al menos 50-75% de los embriones inyectados para evitar la mortalidad embrionaria o efectos no deseados fuera del objetivo.
La mayoría morfolino pez cebra fenotipos se identifican en la primera tres días tras la fertilización, y silenciamiento del gen es generalmente eficaz hasta el día cinco. En el caso de bloqueo de empalme morfolinos, RT-PCR puede utilizarse para identificar cantidades relativas de las transcripciones nativas y modificadas. Para bloqueo de traducción morfolinos, niveles de precipitación del gene pueden evaluarse mediante Western blot.
El rápido desarrollo externo y la transparencia de los embriones de pez cebra permite la fácil observación de muchos procesos biológicos tempranos. Fenotipos de morfolino comúnmente pueden ser anotó mediante el análisis de la morfología mediante microscopía brightfield o fluorescencia, así como mediante la evaluación de comportamiento.
Después de que se ha definido el fenotipo morfolino, rescate de RNA puede realizarse para demostrar la especificidad de la blanco. Tras la caída de morfolino del mRNA endógeno, mRNA sintético se inyecta, que codifica la proteína misma, pero no contiene la secuencia de destino morfolino. Si este ARN inyectado es capaz de restablecer el fenotipo tipo silvestre del organismo, entonces podemos concluir que el fenotipo observado morfolino es específicamente por el gene de la blanco consiguiendo derribado.
Ahora que tienes una idea para qué son los morfolinos y experimentos de morfolino cómo controlados se pueden realizar, echemos un vistazo a cómo morfolinos se están aplicando en los laboratorios biológicos hoy.
En biología celular, morfolinos sirven para entender los procesos de desarrollo tempranos. Flujo generado por cilios en vesícula de Kupffer es un ejemplo que controla patrones de izquierda a derecha en el pez cebra. Flujo corre hacia la izquierda en embriones de control inyectado, mientras que el silenciamiento de un gen que regula la organización de células ciliadas interrumpe la dirección y velocidad del fluido.
Morfolinos también son muy adecuados para la rápida y confiable modelo de enfermedades genéticas humanas. Fenotipos de pérdida de función se pueden reproducir fácilmente mediante la manipulación de la expresión de la proteína, como se ve en un modelo de pez cebra de displasia humano mostrando quistes renales, edema pericárdico y una cola encrespada. Además, las mutaciones patógenas pueden rápidamente ensayarse en vivo mediante el uso de tipo salvaje o mutante mRNA para rescatar morfolino fenotipos de la enfermedad.
Desde morfolinos pueden introducirse en las células vivas de diferentes maneras, son valoradas en el estudio de desarrollo y la regeneración de órganos. Microinyección, seguido por el estímulo eléctrico de morfolinos en tejidos específicos ha permitido a los investigadores a estudiar el crecimiento de la aleta y formación de la retina de pez cebra adulto.
Sólo ha visto introducción de Zeus al silenciamiento génico con morfolinos. En este video, hemos discutido la estructura y mecanismo de morfolinos, aplicaciones comunes para el uso y maneras importantes para evaluar la eficacia y los efectos de silenciamiento de genes específicos. Porque son de fáciles diseño, morfolinos altamente específicas y rentables, serán siendo un jugador importante en el campo de la genética reversa, ayudando a analizar funcionalmente genes implicados en la enfermedad y el desarrollo. ¡Gracias por ver!
Q1: What are morpholinos and how do they differ from DNA?
Morpholinos are synthetic molecules made up of 25 oligonucleotides connected by a neutrally charged backbone. Unlike DNA, morpholinos contain morpholine rings in place of sugar groups found in the phosphate sugar backbone. This structural difference increases morpholino stability in cells and lowers their production cost, making them cost-effective tools for gene silencing in developmental research.
Q2: How do splice-blocking and translation-blocking morpholinos work differently?
Splice-blocking morpholinos bind to specific junctions and inhibit proper transcript processing, while translation-blocking morpholinos bind within the 5' untranslated region near the translational start site and prevent ribosome assembly. Both types reduce expression of functional target proteins, but they achieve gene silencing through distinct molecular mechanisms targeting different stages of gene expression.
Q3: Why is using independent morpholinos important for experimental design?
Independent, non-overlapping morpholinos complementary to the same gene ensure that observed phenotypic changes are due to knockdown of your target gene, not off-target effects. Since any given morpholino can bind to specific sequences on different genes, using multiple morpholinos confirms specificity and strengthens the validity of your developmental genetics techniques and applications.
Q4: When and where are morpholinos typically injected into zebrafish embryos?
Morpholinos are typically injected into zebrafish embryos between the one- and four-cell stage, into the yolk or cell cytoplasm. Cytoplasmic connections between embryonic cells allow for rapid diffusion and ubiquitous delivery of water-soluble morpholinos throughout the organism. The lowest dose producing a defined reliable phenotype in 50-75% of injected embryos is used to avoid lethality or unwanted off-target effects.
Q5: How is RNA rescue used to confirm morpholino target specificity?
Following morpholino knockdown of endogenous mRNA, synthetic mRNA encoding the same protein but lacking the morpholino target sequence is injected. If this injected RNA restores the wild-type phenotype, the observed morpholino phenotype is specifically due to target gene knockdown. This validation step confirms that the gene silencing effect is genuine and not caused by off-target interactions.
Q6: What are practical applications of morpholinos in studying vertebrate development?
Morpholinos are used to study early developmental processes like cilia-generated fluid flow in Kupffer's vesicle, which controls left-right patterning in zebrafish. They also model human genetic diseases by reproducing loss-of-function phenotypes and rapidly assaying pathogenic mutations. Additionally, microinjection of morpholinos into specific tissues enables researchers to study tissue regeneration with somatic stem cells and organ formation in adult zebrafish.
Q7: Why are zebrafish particularly suitable for morpholino-based gene silencing studies?
Zebrafish are ideal for morpholino research due to their rapid external development, transparency, and ease of observation using brightfield or fluorescence microscopy. Morpholino phenotypes are typically identified within the first three days post-fertilization and remain effective through day five. Additionally, zebrafish often have two gene copies from a whole-genome duplication event, requiring knockdown of both genes to model human protein deficiencies.