Heuristisk gruvdrift av hierarkiska genotyper och accessoriska genomlois i bakteriepopulationer

Denna analytiska beräkningsplattform ger praktisk vägledning för mikrobiologer, ekologer och epidemiologer som är intresserade av bakteriell populationsgenomik. Specifikt visade det arbete som presenteras här hur man utför: i) fylogenistyrd kartläggning av hierarkiska genotyper; ii) Frekvensbaserad analys av genotyper. iii) släktskaps- och klonalitetsanalyser, iv) Identifiering av härstamningsdifferentierande tillbehörsplatser.