La constante d'équilibre des liaisons et la force des liaisons

Dans la cellule, les protéines entrent en collision aléatoire avec d'autres molécules, comme d'autres protéines, des acides nucléiques et des petites molécules ligands. Si la liaison est non-spécifique, peu d'interactions non-covalentes entre les molécules entraînent une brève association. Si un ligand spécifique se lie à la protéine, il forme de vastes interactions non-covalentes le long des surfaces complémentaires.

Ces complexes sont stables, restant longtemps liés avant de se dissocier. La force d'une interaction de liaison est rapportée en termes de sa constante d'équilibre, Kb, également appelée liaison ou constante d'association. Le Kb peut être calculé à partir du rapport de la concentration du complexe protéine-ligand sur les concentrations de protéines non-liées et de ligands trouvés à l'équilibre.

Étant donné sa relation avec le changement d'énergie libre dû à la liaison, une valeur impotante de Kb signifie une forte diminution du delta G indiquant une forte affinité entre la protéine et le ligand. Deux processus concurrents sont importants pour la liaison protéine-ligand. L'association d'une protéine et d'un ligand pour former un complexe et la dissociation du complexe en