Protéomiques

La protéomique peut être définie comme l’étude systématique à grande échelle du protéome - l’ensemble complet des protéines exprimées par un organite, une cellule, un tissu ou un organisme à un certain moment.

Selon le type d’étude, l’approche protéomique descendante qui analyse les protéines intactes des systèmes biologiques, ou l’approche ascendante qui étudie les protéines en analysant les fragments peptidiques, pourrait être utilisée pour obtenir des informations sur l’ensemble de protéines cibles.

Dans le cadre d’un flux de travail typique, des échantillons de protéines sont prélevés, par exemple, sur des patients atteints de COVID-19 et des témoins sains, et digérés en peptides. Ensuite, des techniques à haut débit comme la MS permettent d’identifier et de cribler comparatif des protéines significativement régulées ou modifiées entre les populations étudiées, qui peuvent être identifiées à l’aide des bases de données disponibles. Ce profilage protéomique approfondi permet de détecter des biomarqueurs protéiques spécifiques à la maladie et d’identifier des cibles thérapeutiques potentielles.

La protéomique d’expression étudie les différences d’expression des protéines entre les échantillons. La protéomique structurale aide à cartographier la structure protéique au sein d’un organite spécifique, tandis que la protéomique fonctionnelle identifie les fonctions biologiques d’un individu ou d’une classe de protéines.