10.3
Les populations microbiennes sont des groupes de la même espèce que l’on trouve dans le même environnement. Ils sont évalués selon différentes méthodes.
Une méthode basée sur la culture appelée comptage viable plateau estime les cellules vivantes en plaquant des échantillons dilués sur de l’agar, où chaque cellule viable forme une colonie visible.
Dans la méthode la plus probable, les échantillons progressivement dilués sont inoculés en répliqués. Ensuite, le nombre de tubes montrant la croissance est utilisé pour estimer la densité microbienne dans les échantillons.
Les tests biochimiques évaluent l’activité microbienne en suivant des caractéristiques telles que la production d’enzymes, reliant les populations à des rôles écologiques.
Par exemple, les microbes producteurs de cellulase servent très probablement de décomposeurs clés dans les forêts.
L’hybridation in situ par fluorescence utilise des sondes fluorescentes qui se lient à des séquences d’ARNr propres à des microbes spécifiques.
Cela permet l’identification microscopique et la quantification des taxons microbiens.
La cytométrie en flux analyse les microbes en les faisant passer un par un faisceau laser.
Il évalue des caractéristiques telles que la taille des cellules, la complexité et la viabilité, permettant une quantification à haut débit et une évaluation des sous-populations au sein de communautés complexes.
L'évaluation des populations microbiennes est essentielle pour comprendre les rôles des micro-organismes en santé, en écologie et dans l'industrie. Di…
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