Écologie microbienne des eaux douces

L’écologie microbienne des eaux douces est façonnée par la disponibilité du carbone organique, des nutriments, de l’oxygène et de la lumière.

Près de la surface, le phytoplancton utilise la lumière du soleil pour convertir le dioxyde de carbone en carbone organique.

Dans les eaux peu profondes, les diatomées contribuent à la production de carbone organique, tandis que les microbes hétérotrophes décomposent ce carbone organique, libérant du dioxyde de carbone et recyclant les nutriments dans l’eau.

Les biofilms sur les surfaces submergées piègent la matière organique de l’eau, où bactéries, champignons et protistes travaillent ensemble pour la décomposer et libérer du dioxyde de carbone.

Les zones benthiques reçoivent généralement du carbone provenant de la litière de feuilles et de la matière organique submergée, qui est dégradé par des microbes hétérotrophes.

Ces microbes libèrent du carbone organique dissous dans l’eau, soutenant ainsi les communautés microbiennes voisines.

Le ruissellement urbain et agricole peut introduire des déchets organiques dans l’eau douce, entraînant l’eutrophisation.

Cela favorise des proliférations cyanobactériennes à la surface et une déplétion subséquente de l’oxygène, car les microbes hétérotrophes décomposent l’excès de biomasse, affectant la structure globale de la communauté microbienne.