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Les cellules souches embryonnaires (ES) sont des cellules pluripotentes dérivées de la masse cellulaire interne de blastocyste-stade précoce des embryons de mammifères 1. Une étape cruciale dans la différenciation des cellules ES est la formation de corps embryoïdes (EB) des agrégats 2, 3. La formation EB est basée sur l'agrégation spontanée lorsque les cellules ES sont cultivées en plaques non adhérentes. Récapitule EB tridimensionnelle de nombreux aspects de l'embryogenèse chez les mammifères début et se différencient en trois feuillets embryonnaires: ectoderme, mésoderme et endoderme 4.
Immunofluorescence et hybridation in situ sont largement utilisés des techniques pour la détection des protéines cibles et de l'ARNm dans les cellules d'une section de 5 tissus, 6, 7. Nous présentons ici une technique simple pour générer cryocoupes haute qualité de corps embryoïdes. Cette approche repose sur l'orientation spatiale d'intégrer EB en OCT suivie par la technique cryosection. Les sections qui en résulte peut être soumis à une grande variété de procédures analytiques afin de caractériser les populations de cellules contenant certaines protéines, ARN ou ADN. En ce sens, la préparation de cryocoupes EB (10 microns) sont des outils essentiels pour l'analyse histologique coloration (par exemple hématoxiline et l'éosine, DAPI), l'immunofluorescence (par exemple Oct4, nestine) ou l'hybridation in situ. Cette technique peut aussi aider à comprendre les aspects de l'embryogenèse à l'égard du maintien de la structure tri-dimensionnelle sphériques d'EBS.