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Modélisation des différents types de cellules dans des embryons est un mécanisme clé dans le développement des métazoaires. Communautés de microorganismes, comme les colonies et les biofilms également afficher les modèles de types cellulaires. Par exemple, dans la levure S. cerevisiae, les cellules et les cellules sporulées pseudohyphal ne sont pas réparties uniformément dans les colonies. L'importance fonctionnelle de la structuration et les mécanismes moléculaires qui sous-tendent ces tendances sont encore mal compris.
Un défi à l'égard de schémas de enquêter types de cellules dans les colonies fongiques, c'est que contrairement au tissu métazoaires, les cellules en colonies sont relativement faiblement attaché à un autre. En particulier, colonies de champignons ne contiennent pas le même niveau complète de la matrice extracellulaire dans la plupart des tissus. Nous rapportons ici une méthode pour intégrer et de sectionnement des colonies de levures qui révèle les habitudes intérieures de types de cellules dans ces colonies. La méthode peut être utilisée pour préparer des coupes épaisses (0,5 μ) utiles pour la microscopie optique et lames minces (0,1 μ) adapté à la microscopie électronique à transmission. Cellules asques et pseudohyphal peuvent être facilement distingués des cellules de levure ovoïde par microscopie optique, tandis que la structure intérieure de ces cellules peuvent être visualisées par EM.
La méthode est basée sur les colonies environnantes avec de l'agar, les infiltrer avec des moyennes de Spurr, puis sectionner. Colonies avec un diamètre de l'ordre de 1-2 mm sont adaptés à ce protocole. En plus de visualiser l'intérieur des colonies, la méthode permet la visualisation de la région de la colonie qui envahit la gélose sous-jacente.