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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Dans cet article, nous présentons une méthode basée microfluidique pour le confinement des particules repose sur l'écoulement hydrodynamique. Nous démontrons le piégeage des particules stables à un point de stagnation du liquide en utilisant un mécanisme de contrôle de rétroaction, permettant ainsi à l'isolement et la micromanipulation de particules arbitraires dans un microdispositif intégré.
La capacité de confiner et de manipuler des particules uniques en solution libre est une technologie clé pour la science fondamentale et appliquée. Méthodes de piégeage des particules basé sur des techniques optiques, magnétiques, électrocinétique, et acoustique ont conduit à des avancées majeures en physique et en biologie moléculaire, allant de la au niveau cellulaire. Dans cet article, nous introduisons une nouvelle technique basée sur microfluidique pour le piégeage des particules et la manipulation basée uniquement sur l'écoulement du fluide hydrodynamique. En utilisant cette méthode, nous démontrons le piégeage des particules micro-et nano-échelle dans des solutions aqueuses pour des échelles de temps longues. Le piège est constitué d'un hydrodynamiques dispositif intégré microfluidique avec une géométrie du canal inter-fente où deux flux laminaire opposés convergent, générant ainsi un flux planaire extensionnel avec un point de stagnation du fluide (zéro-vitesse point). Dans ce dispositif, les particules sont confinées au centre piège par contrôle actif du champ d'écoulement de maintenir la position des particules au point de stagnation du liquide. De cette manière, les particules sont effectivement piégés dans une solution libre utilisant un algorithme de commande de rétroaction en œuvre avec un code personnalisé construit LabVIEW. L'algorithme de contrôle est constitué d'acquisition d'image pour une particule dans le dispositif microfluidique, suivie par suivi de particules, la détermination de la position des particules centroïde, et l'ajustement actif de l'écoulement du fluide en régulant la pression appliquée à une valve pneumatique sur puce utilisant un régulateur de pression. De cette façon, le sur-puce dynamiques fonctions vanne de dosage pour réguler les débits relatifs à des canaux de sortie, permettant ainsi à échelle fine de contrôle de la position de point de stagnation et de piégeage des particules. Le piège hydrodynamiques microfluidique à base présente plusieurs avantages comme une méthode pour piéger des particules. Piégeage hydrodynamique est possible pour toute particule arbitraire sans exigences spécifiques sur les propriétés physiques ou chimiques de l'objet piégé. En outre, le piégeage hydrodynamique permet confinement d'un objet cible "unique" dans les suspensions de particules concentrées ou surpeuplés, ce qui est difficile avec force alternative des méthodes de piégeage sur le terrain. Le piège hydrodynamique est convivial, simple à mettre en œuvre et peut être ajoutée aux dispositifs existants pour faciliter l'analyse microfluidique piégeage et de longue date de particules. Globalement, le piège hydrodynamique est une nouvelle plateforme pour le confinement, la micromanipulation, et l'observation des particules sans immobilisation de surface et élimine le besoin de potentiellement perturbative des champs optiques, magnétiques et électriques dans le piégeage sans solution de petites particules.
Le piège est constitué d'un hydrodynamiques à deux couches hybrides (polydiméthylsiloxane (PDMS) / verre) dispositif microfluidique pour le confinement des particules. Étapes 1-2 décrivent la fabrication de dispositifs microfluidiques, et étapes 3-4 conception du dispositif de discuter et d'exploitation.
1. SU-8 de fabrication de moule (non représenté dans la vidéo)
2. Fabrication de dispositifs microfluidiques
Étapes 3-4 décrivent la mise en œuvre en utilisant le piège hydrodynamiques le dispositif microfluidique décrit ci-dessus.
3. Installation Piège hydrodynamique expérimentale
4. Procédure de piégeage hydrodynamique
Code LabVIEW: Note d'utilisation pour le contrôleur Commentaires
Piégeage des particules automatisé est réalisé en utilisant un algorithme de rétroaction linéaire contrôle mis en œuvre en utilisant un code personnalisé LabVIEW. Le code LabVIEW capture des images d'une caméra CCD et transmet un potentiel électrique (tension) d'un régulateur de pression, qui module la position active (état partiellement ouvert / fermé) d'une vanne sur puce pneumatiques dynamiques. Comme les changements de position de vanne, le taux d'écoulement hydrodynamique dans une ligne de sortie is ajusté, ce qui re-positionnement du point de stagnation et de permettre le piégeage hydrodynamique. Les étapes de la boucle de rétroaction sont séquentiellement et itérativement exécuté à la vitesse de capture d'image (10-60 Hz). Le code LabVIEW exécute les étapes suivantes lors de chaque cycle boucle de rétroaction:
Le code LabVIEW enregistre les données suivantes pour chaque image capturée lors de particules de piégeage: 1) le temps écoulé, 2) centroïde (x, y) la position de la particule piégée, 3) la position du centre de piège, 4) la distance de la particule de la la pression piège centre, 5) appliquée à la vanne sur la puce. En outre, le code enregistre également un film de la particule piégée dans le format de fichier AVI.
5. Les résultats représentatifs
Nous piégés billes de polystyrène fluorescentes de différentes tailles (100, 540, 830 nm, et de 2,2 um de diamètre) en utilisant un piège hydrodynamique. La figure 1 (a) montre une image d'une particule piégée à la jonction de la Croix-fente dans un dispositif microfluidique. La trajectoire d'une particule piégée peut être déterminée directement à partir des données de position centroïde enregistrées par le code LabVIEW lors d'un événement de piégeage ou par le suivi et la localisation de la particule piégée dans le fichier vidéo enregistré. La figure 1 (b) montre la trajectoire d'une particule piégée (2,2 um de perles fluorescentes) le long de la direction de canal de sortie. La perle est d'abord pris au piège (carrés) pendant 3 min puis est libéré de la trappe et s'échappe le long d'un des canaux de sortie (cercles). Trajectoires de particules dans l'axe d'écoulement de compression (sens canal d'amenée; données non présentées) sont similaires à des trajectoires de particules dans l'axe d'écoulement extensionnel (direction d'écoulement), comme illustré dans la figure 1 (b). Un histogramme de déplacement des particules du centre piège pour un piégés billes (2,2 um de diamètre) le long des directions de canal de sortie est montré dans la figure 1 (c). En utilisant l'algorithme de contrôle rétroaction décrites dans ce travail, les particules piégées sont confinés à ± 1 um du centre piège le long de l'entrée et les orientations canal de sortie.
Un schéma du dispositif microfluidique utilisé pour le piégeage hydrodynamique est montré dans la figure 2. Le dispositif intégré microfluidique constitué d'une couche fluidique et une couche de contrôle et est fabriqué en utilisant la norme de lithographie molle multicouches comme décrit dans cet article. La couche contient les canaux fluidiques tampon et des échantillons, ainsi que la géométrie du canal de la Croix-slot pour faciliter le piégeage hydrodynamique. La couche de contrôle est constitué d'une vanne pneumatique positionné au-dessus l'un des canaux de sortie dans la couche fluidique, et le contrôle et les couches fluides sont séparés par une membrane élastomère mince. Pendant le fonctionnement du dispositif, la soupape dans la couche de contrôle est pressurisée avec de l'azote gazeux, ce qui oblige la fine membrane dans la couche fluidique, induisant ainsi une constriction dans le canal de sortie. La valve pneumatique dynamiques resserre le canal de sortie par des quantités variables en changeant la pression appliquée à la couche de contrôle, qui ajuste les débits relatifs dans les canaux de sortie et permet à échelle fine de contrôle du point de stagnation.

Figure 1: Le piégeage des particules. (A) Image d'une seule bille confiné dans le piège hydrodynamique. En plus de la perle au centre piège, plusieurs billes non capturé sont présentés dans la région de piégeage. (B) Trajectoire d'une particule piégée le long des canaux de sortie (carrés). Lorsque la particule est libéré du piège (flèche), il s'échappe le long d'un des canaux de sortie (cercles). (C) Histogramme des déplacements d'une bille piégée (2,2 um de diamètre) à partir du centre le long du piège de canaux de sortie.

Figure 2:. Schéma du dispositif microfluidique pour le piégeage hydrodynamique Le piège hydrodynamiques est construit en utilisant un dispositif bi-couche microfluidique. La couche fluidique constitué d'une entrée de l'échantillon, fnos entrées de tampon, et deux sorties de déchets. La couche de contrôle est constitué d'une vanne pneumatique à membrane située au sommet d'un des canaux de sortie dans la couche fluidiques. Une constriction dans le canal de sortie opposées fournit une pression de décalage pour la soupape pneumatique. Les dimensions de canal typique comprise entre 100 à 500 um. Dans la région (A), entrée de l'échantillon est le flux concentré par deux entrées de mémoire tampon. Dans la région (B), les flux d'entrée opposés convergent à la jonction de la Croix-slot où le piégeage a lieu. La valve pneumatique (C) est positionné sur le dessus de l'un des canaux de sortie. La position du point de stagnation est modulée par la régulation de pression pour cette vanne.
Dans cet article, nous présentons une méthode basée microfluidique pour le confinement des particules repose sur l'écoulement hydrodynamique. Nous démontrons le piégeage des particules stables à un point de stagnation du liquide en utilisant un mécanisme de contrôle de rétroaction, permettant ainsi à l'isolement et la micromanipulation de particules arbitraires dans un microdispositif intégré.
Nous remercions le groupe Kenis à l'Université de l'Illinois à Urbana-Champaign pour des discussions utiles et généreusement offert l'utilisation des installations de salle blanche.
Ce travail a été financé par une voie à l'indépendance du NIH PI Award, par la concession numéro 4R00HG004183-03 (Charles M. Schroeder et Melikhan Tanyeri).
Ce travail a été soutenu par la National Science Foundation grâce à une bourse de recherche supérieures à Eric M. Johnson-Chavarria.
| Aiguille émoussée de calibre 21 | Zephyrtronics | ZT-5-021-1-L | Pour percer des trous dans la |
| seringue en plastique PDMS 3 ml | BD Biosciences | 309585 | Pour remplir la vanne avec de l’huile |
| Si, plaquettes University | Wafer | 3” ; P(100) simple face poli 380 μ ; m test grade | |
| Verre de protection | VWR international | 48404-428 | 24 x 40 mm #1.5 |
| Carte DAQ | National Instruments | PCI 6229 | |
| Perles fluorescentes | Spherotech, Inc. | FP-2056-2 | 2.2 #x03BC ; m Rouge du Nil |
| Fluorinerte | 3M | FC 40 | Huile de support fluorée |
| Microscope inversé Olympus | Corporation | IX-71 | |
| LabVIEW | National Instruments | Version 9.0f3 (32bit) | |
| Stéréomicroscope | Leica Microsystems | MZ6 | Pour l’alignement de la couche de contrôle PDMS sur la couche fluidique. |
| Four à convection mécanique | VWR international | 1300U | Pour les appareils de cuisson afin de créer des dalles PDMS monolithiques à deux couches. |
| Tubes et connecteurs microfluidiques | Upchurch Scientific | 1/16 x .020 PFA et raccords super sans bride | |
| PDMS | GE Healthcare | RTV 615 A& Chambre à plasma B | |
| Harrick Scientific Products, Inc. | PDC-001 | ||
| Transducteur de pression | Proportion Air | DQPV1 | |
| Spin Coater | Systèmes de revêtement spécialisés | G3P-8 Spin Coat | |
| Photoresist | MicroChem Corp. | SU 8 2050 | |
| Pompe à seringue | Harvard Apparatus | PHD 2000 Bloc | de connexion programmable|
| National Instruments BNC | 2110 | Pour sortie analogique vers le régulateur de pression et lecture. | |
| Source lumineuse collimatée UV et système d’exposition | OAI | modèle 30 Source | lumineuse améliorée |