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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Erin Hussey, Brandon Ally
Département de neurologie, Université Vanderbilt
La méthodologie de collecte de données potentielles liées à des événements à haute densité pendant que les patients atteints de la maladie d’Alzheimer effectuent une tâche de mémoire de reconnaissance est examinée. Ce protocole comprendra la préparation du sujet, l’assurance qualité, l’acquisition et l’analyse des données.
Joseph R. Loverde1, 2, Rosa E. Tolentino1, 2, Bryan J. Pfister1
1Départements de génie biomédical, Institut de technologie du New Jersey, 2École supérieure des sciences biomédicales, Université de médecine et de dentisterie du New Jersey
Une méthode unique d’ingénierie tissulaire a été développée pour allonger de nombreuses fibres nerveuses en culture en récapitulant la croissance de l’étirement axonal ; une forme de croissance du système nerveux par laquelle les nerfs s’allongent en conjonction avec la croissance du corps en expansion.
John Y. Takekawa1, Nichola J. Colline1, 2, Annie K. Schultz1, Samuel A. Iverson1, Carol J. Cardona3, 4, Walter M. Boyce2, Joseph P. Dudley5
1USGS Western Ecological Research Center, 2Centre de santé de la faune, Université de Californie, Davis, 3Département de la santé de la population et de la reproduction, Université de Californie, Davis, 4Département des sciences vétérinaires et biomédicales, Université du Minnesota , 5Science Applications International Corporation
Cette étude décrit le diagnostic de la grippe aviaire chez les oiseaux sauvages à l’aide d’un système portable de rRT-PCR. La méthode tire parti des réactifs lyophilisés pour dépister les oiseaux sauvages dans un environnement non laboratoire, typique d’un scénario d’épidémie. L’utilisation d’outils moléculaires offre des alternatives précises et sensibles pour un diagnostic rapide.
Robert H.S. Kraus1, Pim van Hooft1, Jonas Waldenström2, Neus Latorre-Margalef2, Ronald C. Ydenberg1, 3, Herbert H.T. Prins1
1Groupe d’écologie des ressources, Université de Wageningen, 2Section d’écologie zoonotique et d’épidémiologie, École des sciences naturelles, Université Linnaeus, 3Centre d’écologie de la faune, Université Simon Fraser
Une méthode de préservation, de détection et de séquençage de l’ARN des virus de l’influenza aviaire a été validée et étendue à l’aide d’échantillons de matières fécales naturelles provenant d’oiseaux. Cette technique élimine la nécessité de maintenir une chaîne du froid et de manipuler des virus infectieux et peut être appliquée dans une configuration à haut débit de 96 puits.
<font color='black'>Lynn Boyd1, Connie Hajjar1, Kevin O’Connell2
1Département des sciences biologiques, Université de l’Alabama à Huntsville, 2NIDDK-National Institutes of Health
Cet article décrit une technique pour la visualisation des événements précoces de l’embryogenèse chez le nématode Caenorhabditis elegans.
<font color='black'>Xiquan Gao1, Robert C. Britt Jr.1, Libo Shan2, Ping He1
1Département de biochimie et de biophysique, Institut de génomique végétale et de biotechnologie, Université Texas A&M, 2Département de pathologie végétale et de microbiologie, Institut de génomique végétale et de biotechnologie, Université Texas A&M
Nous présentons le protocole détaillé pour le test de silençage génique induit par un virus (VIGS) médié par Agrobacterium dans le coton. Les vecteurs VIGS dérivés du virus du hochet du tabac (TRV) ont été déployés pour induire le silençage de l’ARN du gène GrCLA1 du coton, Cloroplastos alterados 1. Le phénotype albinos causé par l’inactivation de GrCLA1 a été observé au stade de plantule dans les 2 semaines suivant l’inoculation.
<font color='black'>Dietmar Plenz, Craig V. Stewart, Woodrow Shew, Hongdian Yang, Andreas Klaus, Tim Bellay
Section on Critical Brain Dynamics, Institut national de la santé mentale
Une manière robuste d’étudier les avalanches neuronales, c’est-à-dire les rafales d’activité spatio-temporelle invariantes à l’échelle, indicatives de la dynamique d’état critique dans le cortex. Les avalanches émergent spontanément dans les couches superficielles en développement du cortex cultivé, ce qui permet de mesurer à long terme l’activité avec des réseaux multi-électrodes intégrés planaires (MEA) dans des conditions contrôlées avec précision.
Ian Sharp1, James Patton1, Molly Listenberger2, Emily Case2
1Département de bio-ingénierie, Université de l’Illinois à Chicago et Institut de réadaptation de Chicago, 2Programme de performance sensoritrice, Institut de réadaptation de Chicago
Récemment, un grand nombre de perspectives sont devenues disponibles pour les systèmes interactifs homme-robot. Dans cet article, nous décrivons l’intégration d’un nouveau dispositif robotique avec un logiciel open source qui peut rapidement rendre possible une bibliothèque de fonctionnalités interactives. Nous décrivons ensuite une application clinique pour une application de neuroréadaptation.
John D. Chan, Jonathan S. Département Marchant
de pharmacologie et Institut des cellules souches, Faculté de médecine de l’Université du Minnesota
Un modèle intéressant pour étudier la différenciation des cellules souches au sein d’un animal vivant est le ver plat planaire. La régénération est étudiée par de simples expériences d’amputation qui sont facilement réalisables dans un laboratoire de base et se prêtent à des manipulations pharmacologiques et génétiques (ARNi in vivo), comme détaillé par les protocoles de cet article.