Le numéro d’octobre 2011 du Journal of Visualized Experiments (JoVE) présente le premier effort de la revue pour explorer la physique et l’ingénierie océanographiques. Des chercheurs de l’Institut océanographique de Woods Hole font la démonstration de l’utilisation d’un appareil de vélocimétrie sous-marine autonome, ou SCUVA. Les principaux composants de cet instrument comprennent une caméra HD et un laser, qui, lorsqu’ils sont alignés avec une lentille optique, produisent une feuille de lumière verticale. Après l’alignement et les tests d’étanchéité, ces chercheurs recherchent les habitants de la colonne d’eau pour analyse. Une expérimentation nocturne est nécessaire, afin que la lumière naturelle n’interfère pas avec la feuille laser. SCUVA est spécialement conçu pour capturer le mouvement des particules dans l’eau, de sorte que les champs de vitesse - un champ vectoriel qui décrit le mouvement d’un fluide - puissent être déterminés autour d’un organisme dans son environnement naturel.
En médecine clinique et translationnelle, des chercheurs en orthodontie de l’Université de Graz déterminent la composition des biofilms buccaux - un agrégat de micro-organismes adhérant à la surface - qui se forment sur les expanseurs palatins de leur patient. Ces auteurs utilisent l’hybridation fluorescente in situ combinée à la microscopie confocale pour détecter des bactéries spécifiques dans le biofilm et visualiser sa structure tridimensionnelle.
JoVE se rend également à Graz pour l’immunologie et l’infection, où des chercheurs de l’Université de Graz et de l’institut de technologie de Graz utilisent la microscopie électronique à transmission, ou TEM, pour analyser les changements ultrastructuraux qui se produisent dans la feuille de la plante à la suite d’une infection virale. De petites sections de feuilles sont coupées de la plante et soumises à une procédure de fixation assistée par micro-ondes, ce qui réduit considérablement le temps de préparation de l’échantillon pour la MET. Après l’enrobage et la section, les échantillons sont chargés dans le microscope électronique et imagés. À l’aide d’un logiciel d’analyse d’images, ces auteurs peuvent calculer les dimensions des particules virales et évaluer les changements ultrastructurels dans la feuille de la plante, ce qui est essentiel pour identifier le virus infectieux.
En neurosciences, des chercheurs de l’Université de Californie à Irvine présentent une série de paradigmes comportementaux visant à mesurer le degré de déficience cognitive chez les rongeurs traités par radiothérapie crânienne. Ces auteurs démontrent une nouvelle tâche de reconnaissance de lieu (pour la mémoire de reconnaissance spatiale), une tâche de labyrinthe élevé plus (pour la mesure de l’anxiété), une tâche de conditionnement de la peur (apprentissage et mémoire) et le labyrinthe d’eau de Morris (pour l’apprentissage spatial). Les déficits cognitifs chez les rongeurs ressemblent à ceux manifestés chez les survivants du cancer après une radiothérapie crânienne, et la normalisation de ces paradigmes cognitivo-comportementaux est donc essentielle pour évaluer la thérapie. Une thérapie potentielle est la greffe de cellules souches dans l’hippocampe, que les auteurs démontrent dans un article vidéo séparé en octobre.
En ce qui concerne les cellules souches, des chercheurs de l’Université de Californie à Riverside démontrent des méthodes de manipulation génétique des cellules souches pluripotentes induites humaines. Les cellules souches pluoripotentes induites, les IPSC, peuvent être dérivées de cellules somatiques, comme les fibroblastes que vous voyez ici, à la suite de l’expression forcée de certains facteurs de transcription, qui provoquent la transformation des cellules en un état pluripotent. Ces auteurs montrent comment les iPSC peuvent être cultivées dans des conditions sans nourrisseur et fournissent des conseils utiles pour soulever et ensemencer les cellules à des concentrations optimales pour la transfection et la nucléofection
En plus de ces publications vedettes, JoVE présente des méthodes de prise de mesures physiologiques chez les individus soumis à un stress psychosocial, de suivi de la lyse bactérienne suite à des infections par phage, d’imagerie dans le bulbe olfactif via une fenêtre crânienne, et des dizaines d’autres articles vidéo de méthodes complexes.