Un aperçu du principe du dispositif ImageStream est donné dans la Figure 1. Il produit plusieurs images haute résolution de chaque cellule en flux, incluant le champ clair (BF), le champ sombre (DF ou lumière latérale diffusée) et les canaux de fluorescence, comme illustré dans la Figure 2 avec trois cellules différentes marquées par des CNT. Les superpositions de ces canaux sont également présentées, illustrant au premier abord la corrélation.
Étant donné que toute l'analyse post-traitement repose sur l'imagerie cellulaire, la sélection des cellules au foyer est cruciale pour l'étude (Figure 3). En effet, la présence de nanotubes de carbone (CNT) induit des modifications à la fois du contraste et du gradient par rapport aux cellules non marquées : les cellules au foyer, ayant internalisé une quantité importante de CNT, ont tendance à présenter un faible gradient rms (paramètre habituellement utilisé seul pour discriminer les cellules au foyer versus hors foyer), mais également un contraste important, ce qui explique pourquoi un tracé biparamétrique est essentiel. Sur la Figure 3, on observe la discrimination entre les cellules hors foyer (zone jaune) versus les cellules au foyer (zone bleue).
Les CNT internalisés par les cellules sont clairement distinguables, en particulier en microscopie fond clair (BF), où ils apparaissent comme des points sombres fortement absorbants (voir l'effet de différentes concentrations de marquage, Figure 4). De plus, le signal moyen des pixels en BF a été analysé, permettant une quantification relative de l'absorption cellulaire : les graphiques de la Figure 5 montrent une augmentation significative en fonction de la concentration de marquage des CNT (résultats obtenus pour environ 7 000 cellules par condition expérimentale).
Deuxièmement, la quantification des CNT est également possible à l'aide de masques, appliqués soit sur une plage restreinte de pixels sombres du BF, soit sur les pixels de forte intensité du DF (voir exemples sur la Figure 6), correspondant aux taches résultant de la présence des CNT. Ainsi, le tracé de la surface de ces masques permet de mettre en évidence, ainsi que d'observer l'augmentation de l'absorption (illustré sur la Figure 7 avec la surface du masque sur BF, sélectionnant des pixels compris entre 0 et 533).
En outre, la corrélation entre les taches sur les images en champ clair (BF) et en champ sombre (DF) peut être évaluée en traçant l'intensité en DF en fonction du signal moyen des pixels sur BF (comme dans la Figure 8) (analyse indépendante du masque) ou la surface du masque sur BF (Masque 1) en fonction de la surface sur DF (Masque 2).
En ce qui concerne la procédure établie pour la localisation des nanotubes de carbone (CNT) à l'intérieur des cellules, la figure 9A présente les différents masques qui ont été créés. Notez que la robustesse des masques de localisation (basés sur l'érosion du masque cellulaire par défaut) doit être vérifiée visuellement sur un ensemble de cellules marquées et non marquées. Les mêmes masques sont utilisés pour tous les échantillons.
Le tracé de la surface totale des taches noires sur la membrane cellulaire par rapport à celle de l'ensemble de la cellule fournit un score d'internalisation pour les cellules incubées pendant 20 heures à 37 °C, comparé à une incubation de 2 heures à 4 °C (voir Figure 9B) ; cela indique que les nanotubes de carbone (CNTs) se trouvent principalement sur la membrane à 4 °C, tandis qu'à 37 °C, ils sont internalisés dans plus de 90 % des cellules.
Enfin, en ce qui concerne la fluorescence, ce paramètre n'a pas été utilisé comme indicateur pour la quantification des nanotubes de carbone en raison d'une corrélation trop faible entre les points fluorescents et les points en champ clair (et en champ sombre). En effet, la corrélation entre l'intensité de la FITC et la valeur moyenne des pixels en champ clair indique un coefficient de corrélation de Pearson de -0,2. Sur la Figure 10, deux cas sont illustrés, dans lesquels le signal de fluorescence correspond correctement ou non au point noir en champ clair.

Figure 1. Aperçu du fonctionnement général d'ImageStream. Le système d'imagerie multispectrale acquiert jusqu'à 12 images par cellule selon trois modes différents : champ clair, champ sombre et fluorescence. Le dispositif comprend 5 lasers d'excitation, dont les longueurs d'onde sont 405, 488, 560 et 658 nm. La lumière provenant des cellules circulant dans la cuve est collectée à l’aide d’objectifs différents (dans cette étude, l’objectif 40X a été utilisé) puis dirigée vers un élément de décomposition spectrale constitué d’un ensemble de filtres passe-haut disposés en réseau angulaire. La caméra CCD qui acquiert les images des cellules fonctionne selon une technique appelée intégration synchrone afin d’éviter les traînées d’image. Une profondeur de champ étendue (EDF) est possible.

Figure 2. Galerie d'images de cellules marquées avec des nanotubes de carbone (50 μg/mL) capturées par ImageStream à travers différents canaux (champ clair (BF), champ sombre (DF), fluorescence (FITC) et leurs superpositions). Les nanotubes de carbone confinés dans les lysosomes intracellulaires apparaissent comme de grandes taches noires sur les images en champ clair. En revanche, ils forment des taches brillantes sur les images en champ sombre et en fluorescence.

Figure 3. Sélection des cellules au point. Le diagramme de dispersion bivarié représentant la racine carrée moyenne (rms) du gradient en fonction du contraste sur les images en champ clair permet d'exclure les cellules floues. Ici, la zone jaune représente les cellules floues, tandis que les cellules au point sont représentées en bleu. Les cellules floues se caractérisent par un faible contraste et une faible valeur rms du gradient sur l'image en champ clair. En plus du gradient rms, la caractéristique de contraste est nécessaire pour discriminer les cellules au point après leur marquage avec des nanotubes de carbone (CNTs).

Figure 4. Absorption dépendante de la dose des nanotubes de carbone visualisée par ImageStream. Le nombre et la surface des taches noires sur les images en champ clair augmentent avec la dose de nanotubes de carbone lors de l'incubation avec les cellules (allant de 0 à 50 µg/ml). Remarquez que les cellules témoins sont dépourvues de taches noires.

Figure 5. Quantification relative de l'absorption des nanotubes de carbone (CNT) basée sur les images en champ clair. Les histogrammes de la caractéristique moyenne des pixels appliquée au masque « objet », représentant l'ensemble de la cellule, montrent clairement un comportement dépendant de la dose, pouvant être utilisé pour la quantification. La plage R9 englobe les cellules positives aux CNT.

Figure 6. Création de masques sélectionnant les taches noires sur les images en champ clair (BF) et les taches brillantes sur les images en champ sombre (DF). Comme les nanotubes de carbone (CNT) apparaissent sous forme de taches sombres fortement absorbantes sur l'image en champ clair (BF), un masque seuil est créé pour sélectionner une plage restreinte de pixels ayant une faible intensité comprise entre 0 et 533 dans cette étude (Masque 1, notation : Intensity(M01, BF, 0-533)). Inversement, un masque correspondant aux pixels de forte intensité (150-4095 dans ce cas) sur l'image en champ sombre (DF) (Masque 2, notation : Intensity(M06, DF, 150-4095)) est utilisé pour sélectionner les taches brillantes sur l'image DF, correspondant aux zones de diffusion élevée.

Figure 7. L'absorption dose-dépendante des nanotubes de carbone est démontrée par la quantification de la surface des taches noires sur les images en champ clair. À l'aide d'un masque seuil (masque 1) appliqué sur le champ clair, la surface des taches noires peut être quantifiée pour chaque cellule, révélant une distribution dépendante de la dose.

Figure 8. Les méthodes de quantification des nanotubes de carbone (CNT) basées sur les images en champ clair (absorption) et en champ sombre (diffusion) sont corrélées. À gauche, la moyenne des pixels sur l'image en champ clair versus l'intensité sur l'image en champ sombre, montrant une bonne corrélation pour les cellules marquées avec des CNT (50 µg/ml) (coefficient de corrélation de Pearson r = -0,68). À droite, la surface du masque ajusté aux taches sombres en champ clair versus la surface du masque ajusté aux taches brillantes en champ sombre pour les cellules marquées avec des CNT (50 µg/ml). Le coefficient de corrélation de Pearson est r = -0,83. Les valeurs de 7 000 cellules sont représentées.

Figure 9. Localisation des nanotubes de carbone (CNT) dans les cellules à l’aide de masques spécifiques. (A) Des masques sont créés pour correspondre à un emplacement particulier de la cellule, de gauche à droite : toute la cellule, uniquement la membrane, et l’intérieur de la cellule. Un autre masque permet de détecter les taches noires grâce à un seuil d’intensité (Mask 1, notation : Intensity(M01, BF, 0-533)). (B) L’évaluation de la localisation des CNT peut être obtenue en mesurant la surface des taches noires sur différentes régions cellulaires à l’aide des masques de localisation décrits en A. L’incubation avec les CNT (50 µg/ml) a été réalisée à 37 °C et à 4 °C afin d’inhiber la voie d’internalisation. Le graphique représentant la surface noire sur la membrane par rapport à la surface noire sur l’ensemble de la cellule montre une absorption dose-dépendante des CNT sur la membrane à 4 °C, tandis que l’internalisation complète des CNT est efficace à 37 °C.

Figure 10. Colocalisation des points noirs induits par les nanotubes de carbone sur l'image en champ clair (BF) et des points fluorescents brillants sur l'image FITC. Les points fluorescents brillants ne sont pas toujours colocalisés avec les points noirs sur l'image en champ clair. Ils correspondent correctement pour les deux premières cellules affichées, mais pas pour les deux dernières cellules.